Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BNE5

Protein Details
Accession H6BNE5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MDRVTKSSAKKPAKRRRPNKSLVTTLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-19SAKKPAKRRRPN
67-89KRKSMKSRPGAMKRKEKLDKGER
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MDRVTKSSAKKPAKRRRPNKSLVTTLDTLADALPTEFDGDGDGNNGDANANTQHAGDRPQDQVNIIKRKSMKSRPGAMKRKEKLDKGERDRFAKNLAQLVAAAPKPVTTGETNAKRGDGDSDSDPKPTATVASTSDRWAALRGFISQTLETRPDVKNVTTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.91
4 0.91
5 0.92
6 0.91
7 0.89
8 0.86
9 0.8
10 0.75
11 0.65
12 0.55
13 0.47
14 0.36
15 0.28
16 0.2
17 0.14
18 0.08
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.12
43 0.13
44 0.15
45 0.17
46 0.18
47 0.19
48 0.19
49 0.24
50 0.29
51 0.35
52 0.32
53 0.33
54 0.34
55 0.38
56 0.46
57 0.48
58 0.49
59 0.48
60 0.57
61 0.63
62 0.71
63 0.76
64 0.75
65 0.76
66 0.7
67 0.73
68 0.69
69 0.63
70 0.61
71 0.61
72 0.63
73 0.62
74 0.68
75 0.62
76 0.61
77 0.59
78 0.51
79 0.45
80 0.38
81 0.32
82 0.26
83 0.23
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.08
96 0.13
97 0.21
98 0.27
99 0.29
100 0.29
101 0.3
102 0.27
103 0.27
104 0.26
105 0.19
106 0.17
107 0.18
108 0.23
109 0.23
110 0.24
111 0.24
112 0.2
113 0.19
114 0.16
115 0.14
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.19
120 0.2
121 0.21
122 0.22
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.22
133 0.21
134 0.22
135 0.23
136 0.24
137 0.23
138 0.25
139 0.25
140 0.27
141 0.29