Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R5F1

Protein Details
Accession C4R5F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-273DPSSIKRKVMHSQENKQKKPRRGKITNTHMKGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-264KQKKPRRGK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ppa:PAS_chr3_0737  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MDDRLSAQLNAFKNRIRNTANIPAPKRIVQLDPEPKVSPLRQHQQTIKKEQQRSEIEEELQHESTRSLANISGSHLSTQLHLAVEYIKKQDKEVSINELQRHMSMDISKTLLPLLKNIDRIRYDPDRHTLEYMSLHNIRSAEDLLNYLRIQATFKGILVKELKDGWSGCLAAIAELEEEQKIIVLRTKKENVPRLVWANKGGKLGQIDDDFIEMWSKVKLPDAGNLQEELINNGLKPTSVDPSSIKRKVMHSQENKQKKPRRGKITNTHMKGILKDYSGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.46
4 0.46
5 0.48
6 0.56
7 0.6
8 0.61
9 0.6
10 0.59
11 0.59
12 0.56
13 0.52
14 0.45
15 0.4
16 0.36
17 0.43
18 0.46
19 0.46
20 0.48
21 0.46
22 0.44
23 0.46
24 0.43
25 0.41
26 0.41
27 0.47
28 0.49
29 0.55
30 0.62
31 0.67
32 0.73
33 0.74
34 0.75
35 0.74
36 0.75
37 0.72
38 0.73
39 0.69
40 0.67
41 0.64
42 0.57
43 0.5
44 0.45
45 0.44
46 0.39
47 0.34
48 0.27
49 0.21
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.13
72 0.14
73 0.17
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.26
78 0.26
79 0.29
80 0.29
81 0.32
82 0.34
83 0.37
84 0.38
85 0.35
86 0.32
87 0.27
88 0.27
89 0.2
90 0.16
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.16
102 0.17
103 0.23
104 0.24
105 0.28
106 0.27
107 0.29
108 0.33
109 0.34
110 0.35
111 0.32
112 0.37
113 0.36
114 0.35
115 0.35
116 0.29
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.19
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.14
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.08
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.13
143 0.13
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.15
151 0.16
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.1
171 0.13
172 0.16
173 0.23
174 0.28
175 0.32
176 0.4
177 0.48
178 0.48
179 0.47
180 0.49
181 0.49
182 0.48
183 0.45
184 0.43
185 0.4
186 0.38
187 0.37
188 0.32
189 0.28
190 0.27
191 0.26
192 0.24
193 0.2
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.11
206 0.16
207 0.16
208 0.22
209 0.26
210 0.29
211 0.3
212 0.3
213 0.27
214 0.25
215 0.23
216 0.2
217 0.16
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.21
229 0.29
230 0.39
231 0.41
232 0.42
233 0.41
234 0.45
235 0.52
236 0.59
237 0.61
238 0.61
239 0.68
240 0.75
241 0.83
242 0.85
243 0.87
244 0.86
245 0.85
246 0.87
247 0.87
248 0.87
249 0.86
250 0.89
251 0.89
252 0.91
253 0.92
254 0.85
255 0.79
256 0.73
257 0.65
258 0.57
259 0.51
260 0.44
261 0.36