Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TZC1

Protein Details
Accession Q0TZC1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MGKTKVTDKSSKKEKKPEVSGVKAGRHydrophilic
38-66SKDIAKSAVKEKKKSKKAKTPTPEPESDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-56KSSKKEKKPEVSGVKAGRVTKPAQATKAKSKDIAKSAVKEKKKSKKAK
388-432GGRGGGRGSFGGGRGGGRGGFGDRGGRGGGRGRGGDRGGRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pno:SNOG_15247  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTKVTDKSSKKEKKPEVSGVKAGRVTKPAQATKAKSKDIAKSAVKEKKKSKKAKTPTPEPESDSESSASEDDDESSASSEDEKVVKKSAAKDSSDSDSDDSSDSEEEAKPVAKTNGAAAKDDSSDSDSDSSASEDKKPATKAAKAETSDSDSDSDSADSDSDSEQEAPSKKRKAEAAAEPAVKKTKTEAPASEGIKNLFVGSLSWNIDEDWLRREFEGFGEITGCRVITDRESGRSKGFGYVEFASAADAAKAKAEMHEYELDGRGLNVDFSTPREKPDQSARANKYGDKRSAPANTLFLGNLSFDCSNEGIQEIFQEYGNITRVSLPTDRDTGSLKGFGYVDFGTVEEATAALEALNGQEVEGRAIRIDYAAPRADNGGGGGFGGGRGGGRGSFGGGRGGGRGGFGDRGGRGGGRGRGGDRGGRGGRGGFSTNRGGFGEFKGQKKSFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.88
4 0.88
5 0.87
6 0.83
7 0.83
8 0.76
9 0.72
10 0.66
11 0.6
12 0.53
13 0.48
14 0.43
15 0.41
16 0.46
17 0.45
18 0.48
19 0.53
20 0.56
21 0.62
22 0.68
23 0.66
24 0.63
25 0.64
26 0.64
27 0.62
28 0.64
29 0.59
30 0.58
31 0.64
32 0.67
33 0.68
34 0.69
35 0.73
36 0.75
37 0.8
38 0.84
39 0.85
40 0.86
41 0.9
42 0.92
43 0.92
44 0.92
45 0.91
46 0.89
47 0.82
48 0.75
49 0.68
50 0.63
51 0.54
52 0.45
53 0.36
54 0.28
55 0.25
56 0.21
57 0.18
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.14
71 0.16
72 0.17
73 0.2
74 0.22
75 0.25
76 0.32
77 0.39
78 0.41
79 0.41
80 0.42
81 0.43
82 0.46
83 0.43
84 0.38
85 0.3
86 0.24
87 0.22
88 0.2
89 0.17
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.12
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.18
104 0.23
105 0.23
106 0.24
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.18
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.16
124 0.18
125 0.22
126 0.23
127 0.27
128 0.3
129 0.33
130 0.35
131 0.38
132 0.42
133 0.39
134 0.4
135 0.36
136 0.36
137 0.32
138 0.29
139 0.24
140 0.18
141 0.17
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.11
155 0.15
156 0.19
157 0.26
158 0.3
159 0.31
160 0.34
161 0.37
162 0.38
163 0.41
164 0.44
165 0.44
166 0.45
167 0.46
168 0.43
169 0.42
170 0.4
171 0.33
172 0.26
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.28
177 0.27
178 0.28
179 0.35
180 0.37
181 0.35
182 0.29
183 0.26
184 0.23
185 0.21
186 0.16
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.11
219 0.11
220 0.17
221 0.2
222 0.21
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.08
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.09
261 0.15
262 0.14
263 0.16
264 0.21
265 0.21
266 0.24
267 0.33
268 0.39
269 0.4
270 0.49
271 0.51
272 0.53
273 0.54
274 0.55
275 0.53
276 0.52
277 0.51
278 0.43
279 0.41
280 0.4
281 0.42
282 0.41
283 0.35
284 0.3
285 0.26
286 0.24
287 0.23
288 0.17
289 0.13
290 0.11
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.09
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.16
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.22
319 0.22
320 0.21
321 0.24
322 0.22
323 0.22
324 0.21
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.15
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.19
366 0.17
367 0.15
368 0.11
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.1
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.2
403 0.23
404 0.23
405 0.26
406 0.26
407 0.3
408 0.32
409 0.35
410 0.31
411 0.36
412 0.34
413 0.33
414 0.33
415 0.29
416 0.29
417 0.27
418 0.29
419 0.23
420 0.25
421 0.32
422 0.32
423 0.32
424 0.31
425 0.3
426 0.28
427 0.3
428 0.37
429 0.34
430 0.38
431 0.45