FuNGI

H6BV54

Protein Details

Accession

H6BV54

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-33	ATDLPPKKTKKSKSADVVADKP	Hydrophilic
82-108	VEEPAVKKSKKSKKNKKGKEDQILTAD	Hydrophilic
196-217	TTPALPKSKKVQKKLDKIKAEG	Hydrophilic
335-354	ADKWQKKVEKEQRKREEKAK	Basic
397-427	AEKEAKESKKEKKDKKKDKKNQDKKAENAEE	Basic
555-589	EPVTSKDDSKKAKKSKKEKKEKMEKKKAKGSKDET	Basic
665-703	VPKGKAALKAYKKEKKEKKALKKKERKNLVKARGPKSGL	Basic
724-758	LLGKGKYDKAKRQAYKELKKNVLKRNILRKSKAGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-24	KKRKGSSGATDLPPKKTKKSK
88-100	KKSKKSKKNKKGK
311-357	GANKKYRKSPHEKLEREKLAAPKTADKWQKKVEKEQRKREEKAKKLK
393-421	KPETAEKEAKESKKEKKDKKKDKKNQDKK
563-586	SKKAKKSKKEKKEKMEKKKAKGSK
663-755	PSVPKGKAALKAYKKEKKEKKALKKKERKNLVKARGPKSGLVATNPKPAPLTVPGKIPGVPLLGKGKYDKAKRQAYKELKKNVLKRNILRKSK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MGEKKRKGSSGATDLPPKKTKKSKSADVVADKPAASAPKDEPVPADNASAVASKKSRKRAADFMNEEESTKAVAPTTASTAVEEPAVKKSKKSKKNKKGKEDQILTADGVNGVVEHPGDEDLETATAQKPADISMQAEAERTLDQELENDFRAVASEDEAGYVDEVEVEDNAAALLKGFDSDTDDKQEDTGLDLSTTPALPKSKKVQKKLDKIKAEGKDDGPGAVYVGRIPHGFYEKQMREYFSQFGDITRLRLSRNKRTGASKHFAFIEFASNEVAKIVAETMDNYLLFGHILKCKYAPPDSLHPDVWKGANKKYRKSPHEKLEREKLAAPKTADKWQKKVEKEQRKREEKAKKLKAIGVDMPASTLANPSDVVKDKLITAEEPKKAIEASKPETAEKEAKESKKEKKDKKKDKKNQDKKAENAEEEKAAAVSVEPEAAKDVESASAEKEAEPEASAETKADKSAPGVPLSKKERKALNKAETTPESEMTKEERKALRNARSKLAQAQAQAKTPKAGSDAKSPAKPTQAAEQPSVEEEKVADAPVDKKNDTAPEPVTSKDDSKKAKKSKKEKKEKMEKKKAKGSKDETVARGEEEQPVKADTSADASKPTETEEQSAFATDADFVSFGDINDEKAEDESESDADAPDGKSTRATLSNASRGPSVPKGKAALKAYKKEKKEKKALKKKERKNLVKARGPKSGLVATNPKPAPLTVPGKIPGVPLLGKGKYDKAKRQAYKELKKNVLKRNILRKSKAGQPATDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.67
3	0.68
4	0.63
5	0.63
6	0.66
7	0.7
8	0.71
9	0.76
10	0.78
11	0.8
12	0.85
13	0.84
14	0.82
15	0.77
16	0.71
17	0.64
18	0.53
19	0.44
20	0.37
21	0.31
22	0.24
23	0.24
24	0.22
25	0.26
26	0.28
27	0.28
28	0.27
29	0.27
30	0.29
31	0.26
32	0.25
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.18
37	0.16
38	0.18
39	0.21
40	0.28
41	0.36
42	0.45
43	0.52
44	0.57
45	0.64
46	0.69
47	0.74
48	0.77
49	0.74
50	0.7
51	0.68
52	0.61
53	0.55
54	0.45
55	0.36
56	0.27
57	0.22
58	0.17
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.13
63	0.16
64	0.17
65	0.16
66	0.17
67	0.18
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.15
72	0.21
73	0.29
74	0.28
75	0.33
76	0.43
77	0.51
78	0.61
79	0.71
80	0.74
81	0.77
82	0.88
83	0.93
84	0.94
85	0.94
86	0.94
87	0.94
88	0.89
89	0.83
90	0.76
91	0.67
92	0.57
93	0.46
94	0.36
95	0.25
96	0.18
97	0.12
98	0.08
99	0.06
100	0.06
101	0.05
102	0.05
103	0.06
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.07
111	0.08
112	0.09
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.12
118	0.15
119	0.14
120	0.14
121	0.14
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.14
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.11
133	0.13
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.14
138	0.13
139	0.14
140	0.13
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.08
149	0.08
150	0.06
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.11
168	0.14
169	0.16
170	0.21
171	0.21
172	0.21
173	0.21
174	0.22
175	0.16
176	0.16
177	0.16
178	0.11
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.08
185	0.1
186	0.15
187	0.16
188	0.21
189	0.3
190	0.4
191	0.48
192	0.56
193	0.64
194	0.7
195	0.8
196	0.85
197	0.86
198	0.82
199	0.79
200	0.79
201	0.75
202	0.69
203	0.62
204	0.52
205	0.45
206	0.39
207	0.34
208	0.26
209	0.19
210	0.15
211	0.11
212	0.1
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.14
220	0.14
221	0.16
222	0.26
223	0.27
224	0.32
225	0.34
226	0.34
227	0.33
228	0.35
229	0.35
230	0.25
231	0.27
232	0.21
233	0.2
234	0.21
235	0.19
236	0.18
237	0.19
238	0.2
239	0.19
240	0.25
241	0.32
242	0.38
243	0.45
244	0.48
245	0.49
246	0.56
247	0.61
248	0.63
249	0.63
250	0.53
251	0.47
252	0.44
253	0.41
254	0.34
255	0.26
256	0.24
257	0.17
258	0.17
259	0.16
260	0.14
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.06
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.1
280	0.11
281	0.12
282	0.13
283	0.15
284	0.18
285	0.2
286	0.22
287	0.22
288	0.3
289	0.35
290	0.37
291	0.36
292	0.33
293	0.32
294	0.3
295	0.28
296	0.25
297	0.23
298	0.27
299	0.33
300	0.37
301	0.42
302	0.5
303	0.57
304	0.6
305	0.67
306	0.69
307	0.71
308	0.78
309	0.78
310	0.75
311	0.75
312	0.69
313	0.62
314	0.57
315	0.52
316	0.45
317	0.43
318	0.38
319	0.33
320	0.33
321	0.39
322	0.44
323	0.41
324	0.43
325	0.47
326	0.53
327	0.51
328	0.59
329	0.62
330	0.65
331	0.72
332	0.77
333	0.79
334	0.8
335	0.81
336	0.8
337	0.79
338	0.77
339	0.78
340	0.76
341	0.71
342	0.66
343	0.64
344	0.57
345	0.5
346	0.43
347	0.35
348	0.27
349	0.21
350	0.18
351	0.16
352	0.13
353	0.09
354	0.08
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.09
360	0.1
361	0.12
362	0.11
363	0.12
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.1
368	0.14
369	0.19
370	0.2
371	0.2
372	0.2
373	0.19
374	0.19
375	0.19
376	0.17
377	0.16
378	0.19
379	0.23
380	0.24
381	0.24
382	0.25
383	0.26
384	0.27
385	0.22
386	0.24
387	0.27
388	0.28
389	0.34
390	0.39
391	0.45
392	0.52
393	0.61
394	0.65
395	0.7
396	0.79
397	0.84
398	0.9
399	0.92
400	0.92
401	0.94
402	0.95
403	0.94
404	0.94
405	0.93
406	0.89
407	0.81
408	0.82
409	0.74
410	0.64
411	0.57
412	0.47
413	0.37
414	0.3
415	0.26
416	0.15
417	0.1
418	0.08
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.09
452	0.14
453	0.16
454	0.17
455	0.21
456	0.22
457	0.29
458	0.37
459	0.42
460	0.41
461	0.44
462	0.5
463	0.53
464	0.61
465	0.63
466	0.64
467	0.63
468	0.62
469	0.62
470	0.56
471	0.52
472	0.44
473	0.37
474	0.29
475	0.23
476	0.22
477	0.21
478	0.25
479	0.22
480	0.27
481	0.3
482	0.32
483	0.4
484	0.47
485	0.52
486	0.55
487	0.57
488	0.56
489	0.55
490	0.53
491	0.51
492	0.47
493	0.4
494	0.35
495	0.39
496	0.36
497	0.38
498	0.38
499	0.33
500	0.31
501	0.28
502	0.25
503	0.22
504	0.25
505	0.22
506	0.29
507	0.36
508	0.38
509	0.41
510	0.43
511	0.41
512	0.4
513	0.4
514	0.33
515	0.33
516	0.36
517	0.36
518	0.35
519	0.33
520	0.29
521	0.29
522	0.29
523	0.21
524	0.14
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.13
532	0.18
533	0.22
534	0.2
535	0.2
536	0.23
537	0.27
538	0.28
539	0.28
540	0.25
541	0.26
542	0.27
543	0.28
544	0.28
545	0.26
546	0.28
547	0.29
548	0.34
549	0.38
550	0.45
551	0.54
552	0.61
553	0.68
554	0.74
555	0.8
556	0.84
557	0.87
558	0.9
559	0.9
560	0.91
561	0.93
562	0.94
563	0.94
564	0.95
565	0.93
566	0.91
567	0.91
568	0.87
569	0.83
570	0.83
571	0.78
572	0.75
573	0.74
574	0.71
575	0.63
576	0.59
577	0.52
578	0.43
579	0.38
580	0.31
581	0.29
582	0.25
583	0.23
584	0.21
585	0.21
586	0.2
587	0.18
588	0.17
589	0.11
590	0.15
591	0.16
592	0.16
593	0.17
594	0.17
595	0.18
596	0.17
597	0.21
598	0.21
599	0.2
600	0.23
601	0.21
602	0.22
603	0.22
604	0.22
605	0.19
606	0.13
607	0.12
608	0.09
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.06
613	0.08
614	0.09
615	0.08
616	0.12
617	0.12
618	0.13
619	0.13
620	0.14
621	0.12
622	0.12
623	0.13
624	0.09
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.09
631	0.09
632	0.11
633	0.1
634	0.12
635	0.13
636	0.13
637	0.14
638	0.15
639	0.19
640	0.2
641	0.22
642	0.26
643	0.31
644	0.39
645	0.39
646	0.4
647	0.37
648	0.34
649	0.38
650	0.39
651	0.4
652	0.34
653	0.36
654	0.4
655	0.42
656	0.49
657	0.5
658	0.51
659	0.53
660	0.6
661	0.67
662	0.7
663	0.75
664	0.78
665	0.82
666	0.83
667	0.85
668	0.87
669	0.88
670	0.9
671	0.94
672	0.94
673	0.95
674	0.94
675	0.94
676	0.94
677	0.93
678	0.92
679	0.92
680	0.91
681	0.89
682	0.89
683	0.85
684	0.82
685	0.75
686	0.66
687	0.61
688	0.57
689	0.5
690	0.46
691	0.48
692	0.43
693	0.49
694	0.48
695	0.43
696	0.38
697	0.36
698	0.34
699	0.34
700	0.37
701	0.3
702	0.35
703	0.36
704	0.37
705	0.37
706	0.34
707	0.28
708	0.25
709	0.23
710	0.22
711	0.27
712	0.26
713	0.28
714	0.29
715	0.35
716	0.4
717	0.48
718	0.54
719	0.57
720	0.66
721	0.72
722	0.77
723	0.8
724	0.82
725	0.84
726	0.84
727	0.85
728	0.84
729	0.85
730	0.86
731	0.86
732	0.85
733	0.84
734	0.84
735	0.85
736	0.85
737	0.86
738	0.83
739	0.8
740	0.75
741	0.75
742	0.75
743	0.69

H6BV54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer