Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

H6C9L1

Protein Details
Accession H6C9L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-424TPEQREKKMRDLLRRIKEIKKPFNVKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-435KKMRDLLRRIKEIKKPFNVKGLLTKRKEKGKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5.5, cyto_mito 4.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYAVEAKKRKFDRILEALTDGAASPSRTSLSSRNNASSTSLSQDAASDSSKRRRIGGTSKTTITTSSSTTSLAGHYLPSSRTAFLQRLETFRHVTQWHIPSTEPINATAWAKRGWTCVDTDTVYCGACKERLHVDLNMDNNHLHSESKDDEDGGQVKGGNAEDNFDMASEVYRNMVRRYQDLLVTGHAESCLWRKRGCDASIQRIEGLLNTNTALLGLRSRYDSIMTRPEEVPEVAPLPTTSGNDTEELERYRFDSQGQPNINALRLAICGWVRKSEDVIECRHCFRSLGLWLYRGDAPAMEKLDGVEDHLEYCPWRSAEAQDTELVVGSSHESNEDNATPKKERASGWMLVYQAVVKDNLKRRSATPAVPATPATPRQSVAFSESETIVSRQESLTPEQREKKMRDLLRRIKEIKKPFNVKGLLTKRKEKGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.6
4 0.57
5 0.49
6 0.41
7 0.35
8 0.25
9 0.17
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.17
17 0.24
18 0.32
19 0.39
20 0.43
21 0.47
22 0.47
23 0.47
24 0.47
25 0.43
26 0.36
27 0.32
28 0.29
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.24
37 0.32
38 0.39
39 0.39
40 0.41
41 0.43
42 0.49
43 0.54
44 0.58
45 0.58
46 0.57
47 0.58
48 0.57
49 0.53
50 0.46
51 0.39
52 0.31
53 0.24
54 0.21
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.23
71 0.25
72 0.24
73 0.32
74 0.3
75 0.32
76 0.36
77 0.37
78 0.37
79 0.34
80 0.38
81 0.31
82 0.32
83 0.36
84 0.36
85 0.35
86 0.32
87 0.32
88 0.29
89 0.32
90 0.33
91 0.25
92 0.22
93 0.21
94 0.21
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.21
107 0.21
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.22
120 0.25
121 0.26
122 0.28
123 0.29
124 0.31
125 0.3
126 0.27
127 0.23
128 0.2
129 0.2
130 0.16
131 0.13
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.18
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.22
170 0.21
171 0.18
172 0.19
173 0.16
174 0.13
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.13
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.24
184 0.31
185 0.32
186 0.36
187 0.35
188 0.43
189 0.46
190 0.45
191 0.4
192 0.33
193 0.32
194 0.23
195 0.21
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.19
214 0.2
215 0.22
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.18
221 0.12
222 0.12
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.13
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.19
244 0.21
245 0.29
246 0.31
247 0.3
248 0.31
249 0.31
250 0.3
251 0.22
252 0.18
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.2
265 0.25
266 0.25
267 0.29
268 0.31
269 0.32
270 0.34
271 0.35
272 0.3
273 0.25
274 0.23
275 0.25
276 0.23
277 0.27
278 0.26
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.28
283 0.22
284 0.18
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.11
302 0.13
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.16
307 0.23
308 0.25
309 0.25
310 0.22
311 0.23
312 0.22
313 0.2
314 0.17
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.2
327 0.25
328 0.26
329 0.28
330 0.31
331 0.33
332 0.32
333 0.34
334 0.37
335 0.36
336 0.36
337 0.37
338 0.34
339 0.3
340 0.29
341 0.23
342 0.18
343 0.15
344 0.14
345 0.12
346 0.2
347 0.29
348 0.36
349 0.38
350 0.39
351 0.39
352 0.47
353 0.51
354 0.47
355 0.47
356 0.47
357 0.46
358 0.45
359 0.44
360 0.36
361 0.37
362 0.38
363 0.34
364 0.29
365 0.28
366 0.28
367 0.3
368 0.29
369 0.28
370 0.24
371 0.21
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.21
376 0.2
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.17
382 0.19
383 0.24
384 0.32
385 0.36
386 0.44
387 0.51
388 0.58
389 0.63
390 0.64
391 0.67
392 0.68
393 0.69
394 0.72
395 0.74
396 0.78
397 0.78
398 0.84
399 0.81
400 0.8
401 0.82
402 0.82
403 0.81
404 0.81
405 0.8
406 0.75
407 0.78
408 0.73
409 0.67
410 0.67
411 0.67
412 0.67
413 0.66
414 0.7
415 0.68