Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDU4

Protein Details
Accession F4PDU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-135TTDNRLQQQKKSNKIKNRHTVKNKEKSQNGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039136  NUFIP1-like  
IPR019496  NUFIP1_cons_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000492  P:box C/D snoRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF10453  NUFIP1  
Amino Acid Sequences MGFKQSNRTILPPSYRPPPPPSSTIHSIQSSELSHQHSFVPDSHQQYQAHYPLHQQYYPYPVYASQYNSNWGSYQSTMAAFNTNPYNQQQFLQFQGEPNQLQSNTTDNRLQQQKKSNKIKNRHTVKNKEKSQNGYAGLAQSQDSTNQLHSIPDSTSSFDQSNAGNQELCMDVGISSQSINPSFENINSSTDTDDSSIDEEESLKIQPPSAQSFNLDTPKDIEQWIQERKRKFPTESNIKQKMEDEKQRQKQGNIIDVNGKKLKGRNADKRQLIRKNDTVQEKHGTSEQKDSTIYLDDASNAKLEASHDTLALDMTGKLNQHKGASSCCRHGSNCRHSHDLSKLAESRSAPKTHTPLNPTAAPIKGTNRRPLLNMLLETDFKKDKNALLQCIRFIIENKFFVETEVISSATD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.58
4 0.59
5 0.6
6 0.58
7 0.56
8 0.57
9 0.57
10 0.57
11 0.56
12 0.54
13 0.48
14 0.44
15 0.41
16 0.39
17 0.32
18 0.29
19 0.3
20 0.3
21 0.28
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.27
26 0.25
27 0.28
28 0.29
29 0.35
30 0.38
31 0.43
32 0.41
33 0.43
34 0.48
35 0.46
36 0.43
37 0.37
38 0.39
39 0.41
40 0.45
41 0.42
42 0.37
43 0.34
44 0.4
45 0.4
46 0.34
47 0.27
48 0.23
49 0.25
50 0.27
51 0.29
52 0.27
53 0.27
54 0.31
55 0.32
56 0.31
57 0.28
58 0.26
59 0.24
60 0.19
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.25
74 0.23
75 0.25
76 0.26
77 0.24
78 0.27
79 0.29
80 0.26
81 0.25
82 0.29
83 0.32
84 0.28
85 0.28
86 0.28
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.24
91 0.22
92 0.25
93 0.26
94 0.23
95 0.3
96 0.39
97 0.42
98 0.43
99 0.52
100 0.57
101 0.65
102 0.74
103 0.75
104 0.75
105 0.81
106 0.84
107 0.84
108 0.85
109 0.85
110 0.85
111 0.87
112 0.88
113 0.88
114 0.87
115 0.85
116 0.81
117 0.77
118 0.71
119 0.66
120 0.57
121 0.48
122 0.4
123 0.33
124 0.27
125 0.22
126 0.17
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.16
199 0.19
200 0.22
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.19
205 0.2
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.13
210 0.19
211 0.27
212 0.32
213 0.35
214 0.37
215 0.42
216 0.5
217 0.52
218 0.5
219 0.5
220 0.53
221 0.59
222 0.65
223 0.7
224 0.69
225 0.65
226 0.62
227 0.57
228 0.55
229 0.52
230 0.53
231 0.52
232 0.54
233 0.61
234 0.68
235 0.68
236 0.61
237 0.58
238 0.53
239 0.52
240 0.43
241 0.37
242 0.36
243 0.34
244 0.38
245 0.35
246 0.31
247 0.25
248 0.28
249 0.33
250 0.35
251 0.44
252 0.5
253 0.58
254 0.66
255 0.71
256 0.75
257 0.78
258 0.77
259 0.74
260 0.7
261 0.67
262 0.65
263 0.64
264 0.64
265 0.57
266 0.53
267 0.52
268 0.46
269 0.41
270 0.39
271 0.36
272 0.3
273 0.35
274 0.32
275 0.28
276 0.27
277 0.27
278 0.24
279 0.22
280 0.21
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.09
300 0.06
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.21
310 0.28
311 0.35
312 0.38
313 0.4
314 0.42
315 0.44
316 0.44
317 0.51
318 0.54
319 0.56
320 0.6
321 0.6
322 0.61
323 0.59
324 0.63
325 0.59
326 0.57
327 0.48
328 0.46
329 0.45
330 0.41
331 0.44
332 0.39
333 0.4
334 0.38
335 0.39
336 0.35
337 0.37
338 0.41
339 0.44
340 0.49
341 0.49
342 0.48
343 0.51
344 0.5
345 0.47
346 0.46
347 0.4
348 0.35
349 0.32
350 0.35
351 0.39
352 0.43
353 0.49
354 0.51
355 0.51
356 0.52
357 0.54
358 0.52
359 0.49
360 0.44
361 0.39
362 0.36
363 0.36
364 0.34
365 0.34
366 0.3
367 0.25
368 0.27
369 0.27
370 0.28
371 0.36
372 0.41
373 0.45
374 0.51
375 0.54
376 0.51
377 0.51
378 0.47
379 0.4
380 0.36
381 0.36
382 0.34
383 0.33
384 0.34
385 0.34
386 0.33
387 0.33
388 0.32
389 0.24
390 0.2
391 0.2