FuNGI

F4P978

Protein Details

Accession

F4P978

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
478-498	ANYNRRSRGRNDQQYDHRNAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, extr 9, cyto_nucl 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025762 DFDF IPR019050 FDF_dom IPR025609 Lsm14-like_N IPR010920 LSM_dom_sf IPR025768 TFG_box
Gene Ontology	GO:0000932 C:P-body GO:0003729 F:mRNA binding GO:0033962 P:P-body assembly GO:0034063 P:stress granule assembly
Pfam	View protein in Pfam PF12701 LSM14
PROSITE	View protein in PROSITE PS51512 DFDF PS51536 TFG

Amino Acid Sequences

MDSNGLPLLGALISLTSKSNIRFVGTLLSINPQEGAVSLEQVRSYGTEGRALNPMEEIMPSDHVFPQIMFKASDISDLRVLQPRPQSMPIHPPSHLGGQQPGYPPLQNGHPGMNPYYPYQQGVGYQHPPPQQYWSNPSQQHQQPSAQHPTFVRMPQSVDTPTTSATTVPDTSNAASSPSLGSNALQKSSTEKFNNSNAPLNAHGGSRPANNSGPATVSQTSSVPKSTQDTSEAVAKSLGQMKIGGEPPSKDSGVTKKNPGLPKPTQSNQARKSQAKHTDLPQENTDLLALPPKPPVVKAGGNTTQDRDQQQTNDGNRHSRGHRGTNRSYHNDRYNRNFQNQRTQKTEIPDSEFDFESSNAKFDRAIPEQAQTEATLNSDAQFYSKGGFFDNISCDSRDRVEGQWIDRHTRATQERQTNMETFGQTGSSRGGHQRRYNNNRGSYYHNNNNANGSSFKQFNNETGGNKTVNSSGDGSNGANYNRRSRGRNDQQYDHRNAGDSKNTAAPQTTNTSQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.09
4	0.13
5	0.14
6	0.19
7	0.2
8	0.22
9	0.22
10	0.22
11	0.26
12	0.24
13	0.24
14	0.21
15	0.24
16	0.22
17	0.21
18	0.21
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.14
23	0.09
24	0.12
25	0.13
26	0.14
27	0.14
28	0.14
29	0.14
30	0.12
31	0.15
32	0.17
33	0.18
34	0.23
35	0.23
36	0.26
37	0.31
38	0.3
39	0.28
40	0.23
41	0.22
42	0.16
43	0.16
44	0.16
45	0.12
46	0.14
47	0.15
48	0.16
49	0.17
50	0.17
51	0.18
52	0.16
53	0.19
54	0.19
55	0.21
56	0.19
57	0.18
58	0.2
59	0.2
60	0.26
61	0.22
62	0.22
63	0.23
64	0.24
65	0.26
66	0.3
67	0.31
68	0.31
69	0.36
70	0.37
71	0.38
72	0.42
73	0.43
74	0.4
75	0.5
76	0.5
77	0.48
78	0.44
79	0.42
80	0.39
81	0.41
82	0.4
83	0.31
84	0.29
85	0.27
86	0.31
87	0.31
88	0.31
89	0.27
90	0.25
91	0.24
92	0.21
93	0.23
94	0.23
95	0.22
96	0.23
97	0.23
98	0.25
99	0.26
100	0.27
101	0.25
102	0.23
103	0.26
104	0.24
105	0.23
106	0.22
107	0.2
108	0.22
109	0.24
110	0.26
111	0.25
112	0.27
113	0.31
114	0.34
115	0.35
116	0.31
117	0.34
118	0.35
119	0.36
120	0.4
121	0.39
122	0.44
123	0.46
124	0.48
125	0.51
126	0.5
127	0.52
128	0.49
129	0.5
130	0.47
131	0.51
132	0.58
133	0.48
134	0.46
135	0.4
136	0.41
137	0.39
138	0.35
139	0.32
140	0.23
141	0.25
142	0.24
143	0.27
144	0.23
145	0.21
146	0.2
147	0.18
148	0.17
149	0.16
150	0.15
151	0.12
152	0.11
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.09
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.14
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.18
175	0.21
176	0.27
177	0.24
178	0.25
179	0.28
180	0.34
181	0.39
182	0.36
183	0.39
184	0.33
185	0.33
186	0.31
187	0.29
188	0.25
189	0.2
190	0.17
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.14
195	0.15
196	0.15
197	0.15
198	0.16
199	0.15
200	0.15
201	0.13
202	0.16
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.14
209	0.14
210	0.11
211	0.11
212	0.14
213	0.15
214	0.15
215	0.17
216	0.17
217	0.17
218	0.22
219	0.21
220	0.18
221	0.16
222	0.15
223	0.14
224	0.18
225	0.17
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.16
230	0.18
231	0.19
232	0.14
233	0.15
234	0.17
235	0.19
236	0.19
237	0.15
238	0.15
239	0.2
240	0.26
241	0.28
242	0.29
243	0.31
244	0.37
245	0.4
246	0.41
247	0.41
248	0.38
249	0.41
250	0.44
251	0.42
252	0.46
253	0.48
254	0.55
255	0.52
256	0.56
257	0.57
258	0.54
259	0.55
260	0.55
261	0.58
262	0.53
263	0.52
264	0.48
265	0.52
266	0.51
267	0.5
268	0.43
269	0.35
270	0.3
271	0.27
272	0.23
273	0.13
274	0.1
275	0.11
276	0.1
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.11
282	0.14
283	0.14
284	0.17
285	0.17
286	0.23
287	0.28
288	0.31
289	0.31
290	0.31
291	0.3
292	0.3
293	0.31
294	0.27
295	0.23
296	0.22
297	0.26
298	0.31
299	0.3
300	0.33
301	0.33
302	0.34
303	0.34
304	0.37
305	0.34
306	0.35
307	0.36
308	0.41
309	0.47
310	0.51
311	0.55
312	0.59
313	0.64
314	0.64
315	0.64
316	0.61
317	0.62
318	0.62
319	0.6
320	0.6
321	0.64
322	0.61
323	0.65
324	0.65
325	0.59
326	0.63
327	0.66
328	0.63
329	0.59
330	0.59
331	0.54
332	0.52
333	0.55
334	0.47
335	0.45
336	0.42
337	0.38
338	0.36
339	0.33
340	0.28
341	0.23
342	0.2
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.13
350	0.2
351	0.21
352	0.25
353	0.24
354	0.27
355	0.28
356	0.28
357	0.27
358	0.2
359	0.18
360	0.14
361	0.13
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.11
373	0.12
374	0.13
375	0.13
376	0.15
377	0.18
378	0.2
379	0.2
380	0.21
381	0.2
382	0.21
383	0.22
384	0.21
385	0.21
386	0.19
387	0.25
388	0.27
389	0.3
390	0.34
391	0.35
392	0.38
393	0.36
394	0.38
395	0.31
396	0.36
397	0.38
398	0.41
399	0.47
400	0.51
401	0.53
402	0.53
403	0.56
404	0.5
405	0.47
406	0.42
407	0.34
408	0.26
409	0.23
410	0.21
411	0.17
412	0.16
413	0.15
414	0.13
415	0.15
416	0.23
417	0.29
418	0.35
419	0.43
420	0.52
421	0.61
422	0.69
423	0.77
424	0.77
425	0.78
426	0.74
427	0.69
428	0.68
429	0.67
430	0.66
431	0.65
432	0.65
433	0.61
434	0.58
435	0.59
436	0.52
437	0.45
438	0.38
439	0.32
440	0.28
441	0.27
442	0.27
443	0.28
444	0.28
445	0.27
446	0.33
447	0.33
448	0.31
449	0.33
450	0.36
451	0.31
452	0.3
453	0.3
454	0.25
455	0.23
456	0.23
457	0.22
458	0.19
459	0.2
460	0.21
461	0.2
462	0.2
463	0.22
464	0.21
465	0.24
466	0.27
467	0.33
468	0.4
469	0.45
470	0.47
471	0.51
472	0.6
473	0.65
474	0.73
475	0.72
476	0.73
477	0.79
478	0.83
479	0.83
480	0.76
481	0.66
482	0.59
483	0.55
484	0.51
485	0.48
486	0.41
487	0.38
488	0.4
489	0.39
490	0.37
491	0.36
492	0.32
493	0.28
494	0.34

F4P978

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer