Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P5J9

Protein Details
Accession F4P5J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-428PESSSRRKSARRRSYSRSPATSRSRSVSPRPKDSRRAKDKSRDRSHAMDRPRQRDRSRQRDRSRDHGRNRSRLRSRDRDRSRDRASBasic
437-478DRDMDRSKDRSRDRSRDRRVEQSSRNRNRTRNSSTSRRVRGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-477RERGRDRHESISPESSSRRKSARRRSYSRSPATSRSRSVSPRPKDSRRAKDKSRDRSHAMDRPRQRDRSRQRDRSRDHGRNRSRLRSRDRDRSRDRASGRDRYRERDRDMDRSKDRSRDRSRDRRVEQSSRNRNRTRNSSTSRRVRG
Subcellular Location(s) extr 19, plas 3, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12259  RRM_SRSF11_SREK1  
Amino Acid Sequences MDSADTACSSVKICLVPLAALNLSKQITEELLCQFFSFIGPIVSISLQPCEANPLVQESLVQFQDSEDAALALHLTGTVLADKALFITPPSAKIQSFNSHGYLNIPPPNPTAPGVLVPGSMAGSTIVPYGQTATIAGQDSVDRTIYTGNIHSGLSQQEVSMLFSSCGDVTQVKMAGDATHSTRYAFIEFATSESAAMALNLHGMMVAGRAIKVNRSKHSIGRPIGMYPGMFRPDTDMVMKQAMQAQMRMGHSFSGDARSAGKFPIIPGTPGMMAIAAAANVPPGTNVMPPMTSYLSAMHAPNPLANINAAATSTAARTSQEKSSRGRTFSRERGRDRHESISPESSSRRKSARRRSYSRSPATSRSRSVSPRPKDSRRAKDKSRDRSHAMDRPRQRDRSRQRDRSRDHGRNRSRLRSRDRDRSRDRASGRDRYRERDRDMDRSKDRSRDRSRDRRVEQSSRNRNRTRNSSTSRRVRGDSRSRSLAAGAKAGGSFGDLRAILNAKHDGDKRSGSQRTSQDHGVVSVSGEHEDKPDAPIPSKDLDTDMQIDSGDYSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.19
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.17
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.2
45 0.15
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.13
50 0.13
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.2
78 0.22
79 0.21
80 0.24
81 0.29
82 0.3
83 0.33
84 0.33
85 0.32
86 0.29
87 0.29
88 0.3
89 0.28
90 0.26
91 0.29
92 0.27
93 0.26
94 0.28
95 0.3
96 0.29
97 0.27
98 0.24
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.17
103 0.15
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.11
199 0.18
200 0.23
201 0.26
202 0.32
203 0.34
204 0.39
205 0.47
206 0.5
207 0.45
208 0.44
209 0.41
210 0.35
211 0.34
212 0.29
213 0.21
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.12
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.08
250 0.08
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.11
306 0.17
307 0.22
308 0.25
309 0.28
310 0.38
311 0.41
312 0.43
313 0.44
314 0.44
315 0.46
316 0.53
317 0.6
318 0.58
319 0.59
320 0.64
321 0.67
322 0.68
323 0.64
324 0.6
325 0.53
326 0.49
327 0.47
328 0.45
329 0.39
330 0.34
331 0.33
332 0.32
333 0.32
334 0.32
335 0.36
336 0.39
337 0.48
338 0.58
339 0.65
340 0.7
341 0.75
342 0.79
343 0.83
344 0.84
345 0.82
346 0.78
347 0.72
348 0.7
349 0.71
350 0.68
351 0.6
352 0.54
353 0.52
354 0.49
355 0.55
356 0.56
357 0.53
358 0.59
359 0.65
360 0.68
361 0.73
362 0.78
363 0.79
364 0.8
365 0.82
366 0.8
367 0.82
368 0.85
369 0.86
370 0.85
371 0.81
372 0.75
373 0.74
374 0.74
375 0.7
376 0.68
377 0.66
378 0.65
379 0.67
380 0.7
381 0.71
382 0.67
383 0.71
384 0.74
385 0.76
386 0.79
387 0.82
388 0.83
389 0.85
390 0.86
391 0.85
392 0.86
393 0.84
394 0.83
395 0.83
396 0.82
397 0.82
398 0.84
399 0.84
400 0.82
401 0.81
402 0.81
403 0.81
404 0.81
405 0.81
406 0.83
407 0.83
408 0.82
409 0.83
410 0.8
411 0.77
412 0.72
413 0.71
414 0.69
415 0.69
416 0.67
417 0.67
418 0.65
419 0.64
420 0.71
421 0.69
422 0.67
423 0.66
424 0.66
425 0.66
426 0.69
427 0.71
428 0.67
429 0.68
430 0.68
431 0.68
432 0.7
433 0.7
434 0.73
435 0.74
436 0.79
437 0.81
438 0.86
439 0.87
440 0.85
441 0.85
442 0.83
443 0.82
444 0.82
445 0.82
446 0.82
447 0.82
448 0.87
449 0.84
450 0.83
451 0.82
452 0.82
453 0.79
454 0.79
455 0.76
456 0.77
457 0.8
458 0.82
459 0.82
460 0.77
461 0.72
462 0.68
463 0.7
464 0.71
465 0.7
466 0.67
467 0.64
468 0.6
469 0.56
470 0.53
471 0.49
472 0.39
473 0.33
474 0.26
475 0.22
476 0.2
477 0.19
478 0.16
479 0.12
480 0.11
481 0.08
482 0.12
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.16
487 0.14
488 0.17
489 0.21
490 0.2
491 0.26
492 0.3
493 0.31
494 0.34
495 0.38
496 0.4
497 0.46
498 0.5
499 0.46
500 0.5
501 0.55
502 0.56
503 0.57
504 0.55
505 0.49
506 0.44
507 0.42
508 0.35
509 0.27
510 0.22
511 0.19
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.17
518 0.17
519 0.19
520 0.23
521 0.25
522 0.27
523 0.29
524 0.32
525 0.33
526 0.33
527 0.3
528 0.28
529 0.27
530 0.27
531 0.28
532 0.25
533 0.21
534 0.2
535 0.19