Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P1F1

Protein Details
Accession F4P1F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-356SSSNSSKSKSKSLKKSKSKKSSSSTKCTTHydrophilic
443-471LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGVINSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-347KSKSKSLKKSKSKK
451-461FTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 8.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGFILKKTATNGSSKKSTTASASKKSVSNHSVSAKKKTVTSSSSSSSSSSSDSSDSDVPAKAKSDSSSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSLSDSSDSDVPAKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSLSDSSDSDVPAKAKSDSSSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSSDSSDSSDSDVPTKAKSDSSSNSSKSKSKSLKKSKSKKSSSSTKCTTSSSSETVEKEAISTSTPISGLKRKAEKANTPPSTSSGKRYKVDAIQQRFQRVRAEEVEFADEKLKDNRFVSKGGADGDYGYKAHMDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGVINSNAVHSIKFDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.49
4 0.44
5 0.44
6 0.43
7 0.47
8 0.49
9 0.5
10 0.54
11 0.54
12 0.56
13 0.57
14 0.58
15 0.54
16 0.49
17 0.47
18 0.5
19 0.54
20 0.55
21 0.6
22 0.57
23 0.54
24 0.54
25 0.53
26 0.52
27 0.49
28 0.5
29 0.47
30 0.45
31 0.46
32 0.43
33 0.38
34 0.33
35 0.29
36 0.26
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.2
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.28
55 0.29
56 0.3
57 0.31
58 0.28
59 0.29
60 0.27
61 0.25
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.19
66 0.21
67 0.21
68 0.21
69 0.21
70 0.24
71 0.26
72 0.31
73 0.33
74 0.33
75 0.34
76 0.31
77 0.31
78 0.26
79 0.22
80 0.2
81 0.19
82 0.17
83 0.17
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.21
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.24
92 0.26
93 0.31
94 0.33
95 0.33
96 0.34
97 0.31
98 0.31
99 0.26
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.21
109 0.19
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.21
114 0.26
115 0.27
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.23
121 0.21
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.28
133 0.29
134 0.3
135 0.3
136 0.28
137 0.28
138 0.25
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.21
148 0.19
149 0.2
150 0.21
151 0.24
152 0.26
153 0.31
154 0.33
155 0.33
156 0.34
157 0.31
158 0.31
159 0.26
160 0.22
161 0.2
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.2
166 0.19
167 0.19
168 0.21
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.24
173 0.26
174 0.31
175 0.33
176 0.33
177 0.34
178 0.31
179 0.31
180 0.26
181 0.22
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.17
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.24
194 0.26
195 0.31
196 0.33
197 0.33
198 0.34
199 0.31
200 0.31
201 0.26
202 0.22
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.21
215 0.21
216 0.26
217 0.27
218 0.26
219 0.27
220 0.26
221 0.26
222 0.23
223 0.21
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.22
233 0.23
234 0.28
235 0.29
236 0.3
237 0.31
238 0.28
239 0.29
240 0.27
241 0.25
242 0.22
243 0.22
244 0.2
245 0.19
246 0.21
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.26
252 0.31
253 0.33
254 0.33
255 0.34
256 0.31
257 0.31
258 0.26
259 0.22
260 0.2
261 0.19
262 0.17
263 0.17
264 0.2
265 0.19
266 0.19
267 0.21
268 0.19
269 0.2
270 0.21
271 0.24
272 0.26
273 0.31
274 0.33
275 0.33
276 0.34
277 0.31
278 0.31
279 0.26
280 0.22
281 0.2
282 0.19
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.19
287 0.19
288 0.21
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.24
293 0.26
294 0.31
295 0.33
296 0.33
297 0.34
298 0.31
299 0.31
300 0.26
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.17
305 0.17
306 0.2
307 0.19
308 0.19
309 0.21
310 0.19
311 0.2
312 0.21
313 0.24
314 0.24
315 0.29
316 0.34
317 0.35
318 0.38
319 0.39
320 0.42
321 0.4
322 0.46
323 0.5
324 0.53
325 0.61
326 0.68
327 0.76
328 0.81
329 0.89
330 0.9
331 0.91
332 0.9
333 0.88
334 0.85
335 0.86
336 0.83
337 0.82
338 0.77
339 0.71
340 0.65
341 0.58
342 0.53
343 0.48
344 0.44
345 0.38
346 0.35
347 0.34
348 0.33
349 0.32
350 0.3
351 0.24
352 0.19
353 0.17
354 0.14
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.15
362 0.21
363 0.25
364 0.31
365 0.38
366 0.41
367 0.49
368 0.56
369 0.6
370 0.63
371 0.69
372 0.66
373 0.63
374 0.6
375 0.55
376 0.55
377 0.48
378 0.47
379 0.45
380 0.48
381 0.46
382 0.48
383 0.51
384 0.5
385 0.57
386 0.59
387 0.58
388 0.59
389 0.61
390 0.67
391 0.63
392 0.58
393 0.56
394 0.49
395 0.46
396 0.44
397 0.44
398 0.38
399 0.38
400 0.4
401 0.34
402 0.32
403 0.3
404 0.25
405 0.24
406 0.27
407 0.28
408 0.28
409 0.29
410 0.37
411 0.35
412 0.36
413 0.37
414 0.32
415 0.32
416 0.29
417 0.28
418 0.21
419 0.2
420 0.2
421 0.18
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.15
431 0.21
432 0.21
433 0.21
434 0.22
435 0.21
436 0.27
437 0.3
438 0.36
439 0.42
440 0.53
441 0.63
442 0.73
443 0.82
444 0.85
445 0.9
446 0.91
447 0.9
448 0.9
449 0.88
450 0.86
451 0.85
452 0.8
453 0.72
454 0.63
455 0.58
456 0.48
457 0.41
458 0.34
459 0.25
460 0.21
461 0.19
462 0.22