FuNGI

F4NSD5

Protein Details

Accession

F4NSD5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-62	MEATKAPKKPKYTKKEIQEYNQKQKELREQQKMENQQRLQAKRKQKRPRQEQPHTPKLRTKI	Hydrophilic
329-351	NLNSSRKSRSERKKEKAAKSFAG	Hydrophilic
397-420	TTALRSKEKSKSGRGKKRDAPVSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-59	AKRKQKRPRQEQPHTPKLR
235-250	KARKLTAKADEKSKKK
334-347	RKSRSERKKEKAAK
402-414	SKEKSKSGRGKKR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0045727 P:positive regulation of translation
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MEATKAPKKPKYTKKEIQEYNQKQKELREQQKMENQQRLQAKRKQKRPRQEQPHTPKLRTKIVVRRLPPTLPRDAFFNTISKWLDYIDWSEYVSGKLAKKLAKQNVFSRAYLNFIDCDSVLDFFKSCNGHLFVDSKGNEHRAVVEFAPFQRFCKQRKTIDPLVNTLDADADYQAFLQSLSDPSSLSDPHSILPSEVGIDSSLETASNLVVVGSTLLTDAETTKSTPLLDAIRAEKARKLTAKADEKSKKKLFKTSLISGNIQLAKRESVSNLSREHTDAHKTVSGAATLKHGKKSKAPKQAISSQNLQISSQHTLSAGDVVSGPSQTGNLNSSRKSRSERKKEKAAKSFAGAHASSQPNSQNAESTPVSKSGNAVQETSFSVSGPSEYDAEPIPTSTTALRSKEKSKSGRGKKRDAPVSNSIPLNQQSISQPAIGLQESNGYGNKTEKDLNLNTSATAKGNTGTSSAGNQTKGKQSKKGPNSDTSNPAALGSTTRIILTKRDGTTTEFQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.89
3	0.88
4	0.88
5	0.88
6	0.88
7	0.88
8	0.86
9	0.78
10	0.7
11	0.69
12	0.69
13	0.69
14	0.69
15	0.68
16	0.67
17	0.72
18	0.79
19	0.83
20	0.8
21	0.79
22	0.7
23	0.66
24	0.7
25	0.7
26	0.69
27	0.67
28	0.7
29	0.71
30	0.8
31	0.84
32	0.85
33	0.88
34	0.9
35	0.93
36	0.93
37	0.93
38	0.94
39	0.93
40	0.94
41	0.9
42	0.84
43	0.8
44	0.76
45	0.74
46	0.68
47	0.68
48	0.67
49	0.69
50	0.72
51	0.69
52	0.68
53	0.63
54	0.64
55	0.62
56	0.57
57	0.56
58	0.5
59	0.47
60	0.46
61	0.44
62	0.42
63	0.36
64	0.34
65	0.25
66	0.29
67	0.29
68	0.25
69	0.23
70	0.2
71	0.19
72	0.18
73	0.19
74	0.16
75	0.15
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.15
80	0.16
81	0.18
82	0.17
83	0.2
84	0.24
85	0.28
86	0.35
87	0.43
88	0.51
89	0.54
90	0.57
91	0.6
92	0.65
93	0.65
94	0.58
95	0.51
96	0.42
97	0.38
98	0.33
99	0.28
100	0.19
101	0.15
102	0.16
103	0.13
104	0.14
105	0.12
106	0.12
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.1
111	0.14
112	0.13
113	0.13
114	0.17
115	0.19
116	0.19
117	0.21
118	0.23
119	0.2
120	0.26
121	0.26
122	0.23
123	0.24
124	0.25
125	0.24
126	0.22
127	0.23
128	0.19
129	0.21
130	0.19
131	0.19
132	0.18
133	0.19
134	0.25
135	0.23
136	0.22
137	0.28
138	0.33
139	0.34
140	0.43
141	0.49
142	0.5
143	0.6
144	0.66
145	0.67
146	0.69
147	0.67
148	0.6
149	0.56
150	0.49
151	0.39
152	0.31
153	0.22
154	0.15
155	0.13
156	0.1
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.14
177	0.13
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.08
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.05
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.11
217	0.12
218	0.16
219	0.17
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.22
224	0.22
225	0.24
226	0.24
227	0.32
228	0.39
229	0.39
230	0.47
231	0.51
232	0.53
233	0.59
234	0.6
235	0.59
236	0.53
237	0.59
238	0.53
239	0.54
240	0.57
241	0.53
242	0.54
243	0.5
244	0.48
245	0.4
246	0.39
247	0.34
248	0.28
249	0.23
250	0.16
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.11
255	0.14
256	0.16
257	0.19
258	0.2
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.22
263	0.18
264	0.2
265	0.18
266	0.18
267	0.19
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.15
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.18
276	0.2
277	0.25
278	0.28
279	0.28
280	0.35
281	0.46
282	0.5
283	0.56
284	0.58
285	0.57
286	0.6
287	0.67
288	0.66
289	0.59
290	0.54
291	0.47
292	0.45
293	0.4
294	0.34
295	0.27
296	0.24
297	0.22
298	0.18
299	0.15
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.13
317	0.15
318	0.18
319	0.23
320	0.26
321	0.29
322	0.35
323	0.44
324	0.5
325	0.59
326	0.67
327	0.7
328	0.78
329	0.84
330	0.87
331	0.86
332	0.82
333	0.73
334	0.66
335	0.64
336	0.55
337	0.5
338	0.4
339	0.32
340	0.32
341	0.32
342	0.28
343	0.25
344	0.25
345	0.22
346	0.24
347	0.23
348	0.18
349	0.17
350	0.22
351	0.2
352	0.21
353	0.2
354	0.2
355	0.21
356	0.19
357	0.2
358	0.19
359	0.25
360	0.24
361	0.24
362	0.21
363	0.22
364	0.24
365	0.25
366	0.19
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.16
385	0.19
386	0.24
387	0.29
388	0.32
389	0.39
390	0.45
391	0.53
392	0.55
393	0.6
394	0.67
395	0.73
396	0.79
397	0.8
398	0.82
399	0.81
400	0.84
401	0.84
402	0.78
403	0.74
404	0.72
405	0.7
406	0.66
407	0.59
408	0.5
409	0.45
410	0.41
411	0.36
412	0.27
413	0.23
414	0.21
415	0.23
416	0.23
417	0.18
418	0.17
419	0.16
420	0.18
421	0.16
422	0.14
423	0.11
424	0.13
425	0.13
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.15
430	0.19
431	0.2
432	0.2
433	0.23
434	0.23
435	0.29
436	0.31
437	0.34
438	0.35
439	0.34
440	0.31
441	0.3
442	0.29
443	0.23
444	0.21
445	0.17
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.16
453	0.21
454	0.23
455	0.25
456	0.27
457	0.31
458	0.39
459	0.47
460	0.49
461	0.52
462	0.59
463	0.66
464	0.73
465	0.79
466	0.75
467	0.76
468	0.78
469	0.76
470	0.72
471	0.66
472	0.58
473	0.48
474	0.42
475	0.34
476	0.27
477	0.22
478	0.19
479	0.17
480	0.15
481	0.15
482	0.17
483	0.18
484	0.22
485	0.26
486	0.31
487	0.31
488	0.34
489	0.36
490	0.4

F4NSD5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer