Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PCL0

Protein Details
Accession F4PCL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
996-1026EADGFTPSKGKQKRKRKEKMREKQSSDEAQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1004-1017KGKQKRKRKEKMRE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MAATSIEIPLLRSGQTNEVLEVDLNDLRANHDHIIDILTSEDGSLSLFLEFAFQYLKRDMVDEFEIFLQKGREIGQARNSRREENSLILILNTLASHYIEKAKSESDPSIHDQFIANATQILNDAERLDRMHLYTIVGKANVMLSRNQLDQALYTFRGALNQEPNFLPALIGSSCVHFLKQDFKSALAGYQTILRINPTIKPDVRIPIGICFHRLGMEKKAHAAFLRAVSLNPDNLDALALLSILENNRAISTTATPEEKNTAMTAAGGYLARGYRQNNRHSIIFNLMSDRFFSKGDYGKARVFSESALRLPGSKMSCADSYALRGKIAQAEMNYDLAYTCFVKASELNPDSVLIQFGLGQLQIYKKQFDEAMVPLEKVLAKVPDNYEALAIATEIYAQLPDSAQKVSEKLDRLKKIFRSYFEEEHGFKAKTDDDEYINDPELLIVIGCYFSKQDLKQAEKAFDRAIRILETIPDMSVAPELFNNLGALYHLDAQQLIQHASDLGSSRPTSLGDSRSALQLLELAKSFYDRAFEASPTTVEPGDASDILQTTVRYNLARLNETLGDTEKAKAQYLAILNDHPAYVDCLLRLGYISQNSGDNATALDRYSDALAIDENNVKAWSLVANAHLESKALRPARKAFEKILQEIDKYDMFSLCSTGNMCLKFARTDSKQDKLFLGIGVQRDIHCKRAVEFFTKALRLDSRNMYAATGIAIAFAYFGDMDEAREILTQIQEAAGTNINVTLNLAHILVELGLPHSAIPLYESIKKRSTTADIDVIRSLARAHYIIAKTEKLPDAMATVAARLKEACDLKPNDLALQYNLALAKQQYAQILNEQPKEKRPLSLLRSAVIGLEASEKTFEELSKHKPNPQLGYDVERAKERAKYSKGVRRTTEKKIHETEVLDSQREERLAEIRAKREEAAEIKRSEEKQRALNEQLRLEELDRKRRELQAIVQEDNEKMRVELEMEKAKPIRRKAATNEDDEDDMNQHVDQSEADGFTPSKGKQKRKRKEKMREKQSSDEAQILNTNSTIASDDEDEMMMKRAKVLGVRSKLSTAVIGESDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.15
15 0.18
16 0.2
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.2
22 0.17
23 0.15
24 0.12
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.11
40 0.11
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.2
48 0.24
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.23
55 0.19
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.22
60 0.23
61 0.28
62 0.36
63 0.44
64 0.49
65 0.58
66 0.59
67 0.58
68 0.58
69 0.59
70 0.53
71 0.48
72 0.47
73 0.39
74 0.36
75 0.3
76 0.27
77 0.2
78 0.17
79 0.12
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.11
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.22
89 0.23
90 0.24
91 0.28
92 0.29
93 0.25
94 0.29
95 0.33
96 0.35
97 0.33
98 0.32
99 0.28
100 0.26
101 0.26
102 0.22
103 0.16
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.22
122 0.23
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.18
127 0.2
128 0.2
129 0.18
130 0.17
131 0.18
132 0.21
133 0.23
134 0.23
135 0.21
136 0.19
137 0.18
138 0.2
139 0.2
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.18
145 0.19
146 0.21
147 0.26
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.27
153 0.25
154 0.2
155 0.11
156 0.13
157 0.1
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.21
167 0.22
168 0.29
169 0.27
170 0.28
171 0.31
172 0.3
173 0.3
174 0.23
175 0.21
176 0.14
177 0.17
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.2
185 0.21
186 0.27
187 0.28
188 0.31
189 0.33
190 0.36
191 0.37
192 0.35
193 0.32
194 0.31
195 0.35
196 0.32
197 0.31
198 0.26
199 0.24
200 0.25
201 0.27
202 0.24
203 0.27
204 0.32
205 0.31
206 0.35
207 0.36
208 0.34
209 0.31
210 0.31
211 0.26
212 0.23
213 0.25
214 0.2
215 0.19
216 0.22
217 0.23
218 0.21
219 0.18
220 0.17
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.14
241 0.16
242 0.18
243 0.18
244 0.19
245 0.22
246 0.2
247 0.19
248 0.16
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.07
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.14
262 0.22
263 0.29
264 0.36
265 0.41
266 0.45
267 0.46
268 0.44
269 0.44
270 0.41
271 0.36
272 0.29
273 0.27
274 0.24
275 0.22
276 0.22
277 0.21
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.19
283 0.24
284 0.27
285 0.3
286 0.32
287 0.35
288 0.34
289 0.31
290 0.27
291 0.23
292 0.23
293 0.22
294 0.19
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.17
299 0.21
300 0.17
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.15
308 0.18
309 0.22
310 0.22
311 0.19
312 0.18
313 0.18
314 0.21
315 0.22
316 0.19
317 0.14
318 0.17
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.13
323 0.11
324 0.09
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.19
334 0.19
335 0.2
336 0.19
337 0.2
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.08
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.15
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.16
363 0.17
364 0.16
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.17
375 0.14
376 0.14
377 0.1
378 0.09
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.12
395 0.16
396 0.19
397 0.25
398 0.34
399 0.38
400 0.41
401 0.46
402 0.49
403 0.54
404 0.53
405 0.5
406 0.5
407 0.5
408 0.5
409 0.47
410 0.45
411 0.37
412 0.36
413 0.37
414 0.29
415 0.23
416 0.22
417 0.2
418 0.18
419 0.19
420 0.18
421 0.15
422 0.17
423 0.19
424 0.19
425 0.18
426 0.16
427 0.14
428 0.12
429 0.1
430 0.07
431 0.05
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.09
440 0.09
441 0.16
442 0.21
443 0.25
444 0.31
445 0.34
446 0.37
447 0.34
448 0.35
449 0.31
450 0.28
451 0.25
452 0.2
453 0.18
454 0.15
455 0.15
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.14
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.09
515 0.06
516 0.07
517 0.06
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.11
526 0.08
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.11
544 0.13
545 0.14
546 0.13
547 0.15
548 0.14
549 0.15
550 0.15
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.1
560 0.13
561 0.14
562 0.15
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.09
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.06
579 0.07
580 0.08
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.06
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.1
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.15
621 0.17
622 0.18
623 0.21
624 0.27
625 0.34
626 0.39
627 0.41
628 0.37
629 0.41
630 0.43
631 0.42
632 0.42
633 0.36
634 0.31
635 0.29
636 0.28
637 0.22
638 0.19
639 0.17
640 0.11
641 0.11
642 0.1
643 0.11
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.13
649 0.12
650 0.13
651 0.13
652 0.14
653 0.14
654 0.15
655 0.2
656 0.19
657 0.29
658 0.32
659 0.38
660 0.39
661 0.39
662 0.39
663 0.34
664 0.32
665 0.23
666 0.21
667 0.17
668 0.15
669 0.15
670 0.15
671 0.13
672 0.19
673 0.2
674 0.21
675 0.21
676 0.2
677 0.21
678 0.28
679 0.3
680 0.28
681 0.29
682 0.3
683 0.31
684 0.32
685 0.31
686 0.25
687 0.26
688 0.24
689 0.26
690 0.26
691 0.24
692 0.25
693 0.25
694 0.23
695 0.2
696 0.17
697 0.13
698 0.1
699 0.07
700 0.05
701 0.05
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.03
707 0.03
708 0.05
709 0.05
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.07
716 0.06
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.07
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.05
746 0.05
747 0.04
748 0.05
749 0.07
750 0.1
751 0.17
752 0.2
753 0.24
754 0.29
755 0.3
756 0.31
757 0.32
758 0.35
759 0.32
760 0.33
761 0.37
762 0.33
763 0.34
764 0.33
765 0.3
766 0.25
767 0.2
768 0.17
769 0.09
770 0.1
771 0.08
772 0.09
773 0.15
774 0.16
775 0.19
776 0.22
777 0.23
778 0.22
779 0.27
780 0.28
781 0.21
782 0.21
783 0.18
784 0.16
785 0.14
786 0.15
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.09
793 0.1
794 0.14
795 0.17
796 0.17
797 0.24
798 0.27
799 0.29
800 0.33
801 0.33
802 0.28
803 0.28
804 0.27
805 0.2
806 0.2
807 0.17
808 0.15
809 0.14
810 0.13
811 0.13
812 0.12
813 0.13
814 0.12
815 0.14
816 0.14
817 0.16
818 0.17
819 0.21
820 0.28
821 0.31
822 0.35
823 0.37
824 0.37
825 0.42
826 0.48
827 0.44
828 0.41
829 0.41
830 0.45
831 0.46
832 0.52
833 0.47
834 0.41
835 0.4
836 0.37
837 0.31
838 0.22
839 0.16
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.11
847 0.12
848 0.12
849 0.12
850 0.17
851 0.25
852 0.35
853 0.37
854 0.42
855 0.48
856 0.54
857 0.56
858 0.54
859 0.51
860 0.43
861 0.47
862 0.46
863 0.43
864 0.39
865 0.35
866 0.34
867 0.32
868 0.35
869 0.33
870 0.36
871 0.37
872 0.44
873 0.51
874 0.58
875 0.64
876 0.66
877 0.68
878 0.69
879 0.71
880 0.74
881 0.74
882 0.71
883 0.71
884 0.68
885 0.66
886 0.61
887 0.56
888 0.49
889 0.48
890 0.45
891 0.38
892 0.33
893 0.31
894 0.29
895 0.27
896 0.24
897 0.16
898 0.17
899 0.2
900 0.28
901 0.31
902 0.34
903 0.38
904 0.39
905 0.38
906 0.36
907 0.38
908 0.37
909 0.39
910 0.4
911 0.37
912 0.39
913 0.45
914 0.46
915 0.48
916 0.49
917 0.46
918 0.46
919 0.52
920 0.55
921 0.57
922 0.6
923 0.57
924 0.53
925 0.5
926 0.44
927 0.4
928 0.35
929 0.37
930 0.37
931 0.42
932 0.42
933 0.46
934 0.49
935 0.53
936 0.56
937 0.52
938 0.53
939 0.53
940 0.56
941 0.52
942 0.5
943 0.46
944 0.42
945 0.39
946 0.32
947 0.23
948 0.17
949 0.16
950 0.14
951 0.15
952 0.18
953 0.23
954 0.29
955 0.29
956 0.35
957 0.38
958 0.44
959 0.48
960 0.5
961 0.54
962 0.52
963 0.59
964 0.62
965 0.69
966 0.69
967 0.67
968 0.65
969 0.57
970 0.53
971 0.45
972 0.38
973 0.28
974 0.23
975 0.18
976 0.14
977 0.12
978 0.11
979 0.11
980 0.09
981 0.11
982 0.13
983 0.12
984 0.13
985 0.14
986 0.15
987 0.16
988 0.21
989 0.19
990 0.27
991 0.35
992 0.46
993 0.54
994 0.65
995 0.74
996 0.81
997 0.9
998 0.92
999 0.94
1000 0.95
1001 0.96
1002 0.96
1003 0.96
1004 0.92
1005 0.9
1006 0.87
1007 0.83
1008 0.75
1009 0.71
1010 0.6
1011 0.5
1012 0.47
1013 0.4
1014 0.32
1015 0.24
1016 0.21
1017 0.14
1018 0.15
1019 0.14
1020 0.11
1021 0.11
1022 0.12
1023 0.13
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.18
1029 0.18
1030 0.16
1031 0.17
1032 0.19
1033 0.21
1034 0.25
1035 0.32
1036 0.37
1037 0.42
1038 0.45
1039 0.46
1040 0.45
1041 0.44
1042 0.41
1043 0.35
1044 0.26
1045 0.22
1046 0.19
1047 0.18