Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NXL9

Protein Details
Accession F4NXL9    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-91SSGRGHSKSRSRSRGRSNRQYRSRSRSPKDHydrophilic
225-250TDISNAKINKKRQYRQYMNRSKGFNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-90SSGRGHSKSRSRSRGRSNRQYRSRSRSPK
110-149YRRSRDRRRSLSRSTSPRHHRRRYSVSRSPSVERGRNRRS
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDYRRRDSRDVRRESGHSKRSSGRGYRDADTFDTPDKVMPETLDYEGRGGHSNSRENGQRSSGRGHSKSRSRSRGRSNRQYRSRSRSPKDDHLALDRSERGYRDREEDYRRSRDRRRSLSRSTSPRHHRRRYSVSRSPSVERGRNRRSRNEIDDREQPNQAPIKKASSSRAYSNDNLSGKHSDLQDCTSENGNNIEELDEEAKMRLLMGIDGFDSTKGKKVPGTDISNAKINKKRQYRQYMNRSKGFNRALSPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.72
4 0.7
5 0.63
6 0.6
7 0.61
8 0.63
9 0.65
10 0.65
11 0.62
12 0.61
13 0.62
14 0.6
15 0.56
16 0.52
17 0.46
18 0.42
19 0.36
20 0.31
21 0.28
22 0.25
23 0.24
24 0.22
25 0.2
26 0.18
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.17
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.19
39 0.21
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.35
44 0.35
45 0.37
46 0.37
47 0.36
48 0.34
49 0.38
50 0.4
51 0.42
52 0.43
53 0.47
54 0.5
55 0.55
56 0.62
57 0.67
58 0.7
59 0.7
60 0.75
61 0.8
62 0.83
63 0.84
64 0.85
65 0.86
66 0.86
67 0.88
68 0.88
69 0.85
70 0.83
71 0.84
72 0.83
73 0.79
74 0.78
75 0.75
76 0.76
77 0.73
78 0.68
79 0.6
80 0.55
81 0.52
82 0.42
83 0.38
84 0.3
85 0.26
86 0.23
87 0.22
88 0.19
89 0.21
90 0.22
91 0.23
92 0.26
93 0.3
94 0.35
95 0.42
96 0.46
97 0.5
98 0.54
99 0.57
100 0.61
101 0.65
102 0.68
103 0.7
104 0.73
105 0.72
106 0.74
107 0.77
108 0.77
109 0.75
110 0.7
111 0.69
112 0.7
113 0.73
114 0.75
115 0.74
116 0.72
117 0.72
118 0.78
119 0.79
120 0.78
121 0.75
122 0.71
123 0.68
124 0.65
125 0.6
126 0.57
127 0.52
128 0.49
129 0.48
130 0.51
131 0.55
132 0.6
133 0.62
134 0.63
135 0.65
136 0.66
137 0.68
138 0.69
139 0.65
140 0.61
141 0.65
142 0.61
143 0.56
144 0.5
145 0.41
146 0.36
147 0.36
148 0.33
149 0.28
150 0.26
151 0.28
152 0.29
153 0.32
154 0.32
155 0.34
156 0.35
157 0.36
158 0.4
159 0.4
160 0.39
161 0.4
162 0.41
163 0.35
164 0.33
165 0.31
166 0.28
167 0.25
168 0.27
169 0.25
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.22
209 0.3
210 0.37
211 0.42
212 0.43
213 0.48
214 0.49
215 0.53
216 0.52
217 0.52
218 0.51
219 0.52
220 0.56
221 0.61
222 0.67
223 0.7
224 0.8
225 0.83
226 0.86
227 0.9
228 0.91
229 0.89
230 0.87
231 0.82
232 0.74
233 0.73
234 0.68
235 0.62