Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UQ23

Protein Details
Accession Q0UQ23    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42HSATSPQPQPSKRDKRRNMLAEKLGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
538-545RGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pno:SNOG_06141  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MVRNGSPSPADNFPLGHSATSPQPQPSKRDKRRNMLAEKLGEMMASFSDNRDSHYRAQLAALTADINLIMKADPYANAPLDDGGDEASDLISQIMGNNVPTAPSAGTDYIAQCGKHYARFVDAVNDAMEERDYNLTMLHNKHENTKNEIENSHYYKVQIAEEEHKLLAATIRERLIASIQQRTGRLKREKEQLDLSDSNAMLLHPNQFGIGNPASPGGPQAPRKTRRTGHKFGEAEDLAAANESKRKRKLFEEADNDSPGPAGRNVEIGMGSPFRDAKARTMNAQFESSAYSLERLFTEKELNMAMNQATTAASHFFAKMKQADNGAQNEATTYGHTTNGNGTNGDHASENGDVMDQDQDSDDIPGAADMTRQISSNPHATRGATRSAFNPSAAAIANGHMPFIYNPPFVLDAKIFQKPNAAAPTPPALSASDIDQDLKLMLRDAPLDDELNEKLLQAACHPIKARDYQVQPPGFQEPVNEITSQVRNTAPGLEVGLMNGMGGVPMSAQSSQWSDAGGNTPLGAAERPVPMARTASGRGRGRGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.18
5 0.19
6 0.23
7 0.27
8 0.28
9 0.3
10 0.38
11 0.42
12 0.49
13 0.58
14 0.64
15 0.7
16 0.78
17 0.81
18 0.83
19 0.9
20 0.92
21 0.89
22 0.87
23 0.84
24 0.76
25 0.68
26 0.59
27 0.48
28 0.38
29 0.29
30 0.2
31 0.13
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.16
36 0.16
37 0.21
38 0.25
39 0.29
40 0.32
41 0.4
42 0.41
43 0.35
44 0.36
45 0.35
46 0.31
47 0.27
48 0.22
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.08
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.11
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.19
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.25
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.24
127 0.24
128 0.33
129 0.4
130 0.42
131 0.44
132 0.49
133 0.48
134 0.46
135 0.46
136 0.42
137 0.41
138 0.43
139 0.38
140 0.32
141 0.29
142 0.29
143 0.3
144 0.26
145 0.21
146 0.19
147 0.21
148 0.23
149 0.24
150 0.22
151 0.2
152 0.18
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.16
164 0.18
165 0.21
166 0.23
167 0.25
168 0.28
169 0.33
170 0.36
171 0.41
172 0.47
173 0.47
174 0.52
175 0.59
176 0.6
177 0.58
178 0.59
179 0.52
180 0.5
181 0.45
182 0.39
183 0.32
184 0.29
185 0.24
186 0.19
187 0.16
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.13
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.09
205 0.13
206 0.17
207 0.25
208 0.34
209 0.4
210 0.45
211 0.51
212 0.55
213 0.61
214 0.66
215 0.66
216 0.62
217 0.65
218 0.62
219 0.56
220 0.57
221 0.46
222 0.37
223 0.29
224 0.24
225 0.14
226 0.14
227 0.12
228 0.05
229 0.1
230 0.12
231 0.18
232 0.24
233 0.27
234 0.29
235 0.34
236 0.43
237 0.47
238 0.53
239 0.55
240 0.53
241 0.53
242 0.51
243 0.47
244 0.37
245 0.29
246 0.2
247 0.13
248 0.09
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.09
264 0.13
265 0.2
266 0.21
267 0.24
268 0.27
269 0.3
270 0.29
271 0.29
272 0.25
273 0.17
274 0.18
275 0.15
276 0.12
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.12
306 0.15
307 0.16
308 0.17
309 0.19
310 0.22
311 0.25
312 0.27
313 0.25
314 0.22
315 0.2
316 0.18
317 0.16
318 0.13
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.13
334 0.09
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.11
362 0.14
363 0.22
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.25
368 0.29
369 0.29
370 0.33
371 0.26
372 0.26
373 0.25
374 0.31
375 0.31
376 0.26
377 0.24
378 0.17
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.09
383 0.08
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.14
391 0.17
392 0.13
393 0.14
394 0.16
395 0.18
396 0.18
397 0.19
398 0.16
399 0.16
400 0.2
401 0.26
402 0.25
403 0.23
404 0.28
405 0.26
406 0.32
407 0.34
408 0.31
409 0.26
410 0.28
411 0.33
412 0.28
413 0.27
414 0.22
415 0.16
416 0.17
417 0.17
418 0.16
419 0.14
420 0.14
421 0.15
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.17
439 0.16
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.14
444 0.13
445 0.22
446 0.2
447 0.25
448 0.27
449 0.27
450 0.3
451 0.34
452 0.38
453 0.37
454 0.41
455 0.45
456 0.52
457 0.52
458 0.48
459 0.47
460 0.46
461 0.38
462 0.33
463 0.27
464 0.23
465 0.25
466 0.26
467 0.23
468 0.2
469 0.24
470 0.28
471 0.27
472 0.24
473 0.21
474 0.2
475 0.21
476 0.22
477 0.18
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.04
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.1
497 0.13
498 0.15
499 0.15
500 0.15
501 0.14
502 0.16
503 0.19
504 0.19
505 0.16
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.14
510 0.12
511 0.1
512 0.12
513 0.14
514 0.16
515 0.18
516 0.19
517 0.2
518 0.22
519 0.22
520 0.24
521 0.27
522 0.32
523 0.4
524 0.43
525 0.48