Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NVP4

Protein Details
Accession F4NVP4    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-191ALQMSKTTPKRKSRQNSIAATTHydrophilic
339-363VASPLGKSKKERRSKSKRVIQEKSQHydrophilic
423-446RSTNNKRRDKFKKLKGSTRKQSASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-356GKSKKERRSKSKR
428-440KRRDKFKKLKGST
515-532KKKAGGRGRVPKSRKKAL
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
CDD cd15550  PHD_MLL5  
Amino Acid Sequences MSSKRARTIASYKLEIPVSSEDNSDDEVTRCICGDTASKGVMVQCDECGVWQHCDCMNLAGKKLPKKYFCEQCKPESHPSIIPALAVQSTSSKNIAETSVNTNLTYGQDSRNPQRQSSVASSGMSSLGDFQDGESNFPATAHEQPTNTKSPSTTLSNSRFNVSAKDKAAALQMSKTTPKRKSRQNSIAATTASIATAAKKRNTLNSRVADQWNAELLLMQTGDNHTETECSMDVDGASEDGTDHDPTLHGTDPEASVPEEFLRSRGQLGPHYDSFLNDCSKSSLLDSGGERSRNQSIHKNDDINEAREELDEGSEYTNGRKRLKRLNSVTDASTQDVKVASPLGKSKKERRSKSKRVIQEKSQSEASPLLMDSDKFNLNERKSSHVSKTSEIDRTIEGEHGAFYASLSTNPPVLDDDNTLSGRSTNNKRRDKFKKLKGSTRKQSASALECTVDRDSDQGLAKTFSLYEVETNKLAMDHAFDSSNVIDSIPAAHSTVAEDESMPDDMAVATLGSTKKKAGGRGRVPKSRKKALPGNRDIHVCDDDAYVDTGIGSSLKPGLVESACHPQTDSLDASDILAPDSHSIHASGDHPLKPDSDPICSLRAPPSPPVQPHSLGLDSPPLEIHRRLKQLYEAVQRLRESLGTCIAVVPPEHMPLKKLKDCSHGRFASDGSEFPCKDLSSTVDPQGLDRTCHSMMSELNNRDGPHFSTHSQMDIDCTPIVSSDLASMDSNPVDCVVANQLDDQIVKKTRSALQRLIITLATPCSSVADMVDILEDALDQFDSRFAML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.4
3 0.37
4 0.33
5 0.29
6 0.27
7 0.26
8 0.22
9 0.22
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.13
20 0.14
21 0.16
22 0.18
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.21
27 0.23
28 0.23
29 0.22
30 0.19
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.22
39 0.25
40 0.25
41 0.26
42 0.27
43 0.26
44 0.31
45 0.29
46 0.31
47 0.33
48 0.38
49 0.45
50 0.53
51 0.56
52 0.55
53 0.59
54 0.67
55 0.71
56 0.75
57 0.78
58 0.75
59 0.75
60 0.77
61 0.77
62 0.76
63 0.72
64 0.66
65 0.58
66 0.55
67 0.5
68 0.42
69 0.35
70 0.25
71 0.21
72 0.17
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.19
83 0.17
84 0.18
85 0.22
86 0.27
87 0.28
88 0.27
89 0.26
90 0.25
91 0.24
92 0.24
93 0.2
94 0.17
95 0.22
96 0.28
97 0.36
98 0.44
99 0.45
100 0.43
101 0.46
102 0.44
103 0.45
104 0.45
105 0.42
106 0.35
107 0.33
108 0.32
109 0.28
110 0.26
111 0.2
112 0.14
113 0.11
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.13
127 0.18
128 0.2
129 0.22
130 0.22
131 0.27
132 0.32
133 0.36
134 0.35
135 0.31
136 0.27
137 0.27
138 0.31
139 0.33
140 0.32
141 0.35
142 0.4
143 0.46
144 0.46
145 0.46
146 0.43
147 0.38
148 0.41
149 0.37
150 0.38
151 0.32
152 0.33
153 0.3
154 0.29
155 0.32
156 0.27
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.22
161 0.29
162 0.34
163 0.38
164 0.45
165 0.54
166 0.59
167 0.68
168 0.75
169 0.79
170 0.83
171 0.84
172 0.81
173 0.75
174 0.71
175 0.61
176 0.51
177 0.41
178 0.31
179 0.21
180 0.15
181 0.11
182 0.1
183 0.15
184 0.19
185 0.21
186 0.25
187 0.27
188 0.37
189 0.42
190 0.45
191 0.49
192 0.49
193 0.5
194 0.51
195 0.51
196 0.43
197 0.38
198 0.33
199 0.25
200 0.21
201 0.17
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.16
253 0.18
254 0.21
255 0.26
256 0.3
257 0.28
258 0.3
259 0.28
260 0.26
261 0.26
262 0.24
263 0.21
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.11
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.21
279 0.24
280 0.24
281 0.26
282 0.3
283 0.33
284 0.39
285 0.42
286 0.42
287 0.39
288 0.46
289 0.46
290 0.4
291 0.35
292 0.28
293 0.24
294 0.22
295 0.21
296 0.12
297 0.1
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.14
305 0.18
306 0.24
307 0.27
308 0.31
309 0.41
310 0.49
311 0.56
312 0.58
313 0.62
314 0.62
315 0.6
316 0.57
317 0.5
318 0.43
319 0.35
320 0.3
321 0.21
322 0.17
323 0.15
324 0.13
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.15
330 0.19
331 0.25
332 0.31
333 0.4
334 0.48
335 0.57
336 0.65
337 0.7
338 0.76
339 0.81
340 0.86
341 0.85
342 0.84
343 0.85
344 0.82
345 0.79
346 0.77
347 0.69
348 0.62
349 0.56
350 0.46
351 0.38
352 0.33
353 0.25
354 0.16
355 0.13
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.15
364 0.19
365 0.2
366 0.24
367 0.25
368 0.29
369 0.31
370 0.34
371 0.34
372 0.36
373 0.37
374 0.34
375 0.36
376 0.33
377 0.33
378 0.3
379 0.27
380 0.2
381 0.2
382 0.18
383 0.15
384 0.12
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.05
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.11
410 0.16
411 0.24
412 0.3
413 0.4
414 0.49
415 0.52
416 0.61
417 0.69
418 0.74
419 0.75
420 0.76
421 0.78
422 0.76
423 0.83
424 0.84
425 0.85
426 0.83
427 0.82
428 0.74
429 0.65
430 0.62
431 0.56
432 0.49
433 0.41
434 0.32
435 0.24
436 0.22
437 0.22
438 0.18
439 0.14
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.09
455 0.1
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.03
496 0.03
497 0.06
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.16
503 0.18
504 0.26
505 0.32
506 0.41
507 0.5
508 0.6
509 0.67
510 0.71
511 0.75
512 0.76
513 0.76
514 0.75
515 0.69
516 0.66
517 0.68
518 0.69
519 0.74
520 0.74
521 0.7
522 0.63
523 0.61
524 0.54
525 0.48
526 0.39
527 0.29
528 0.21
529 0.17
530 0.14
531 0.13
532 0.13
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.04
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.12
549 0.2
550 0.21
551 0.21
552 0.21
553 0.19
554 0.2
555 0.22
556 0.2
557 0.12
558 0.13
559 0.13
560 0.13
561 0.14
562 0.13
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.08
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.15
575 0.19
576 0.2
577 0.22
578 0.22
579 0.23
580 0.22
581 0.28
582 0.24
583 0.23
584 0.24
585 0.25
586 0.27
587 0.26
588 0.27
589 0.25
590 0.29
591 0.28
592 0.29
593 0.33
594 0.36
595 0.39
596 0.41
597 0.4
598 0.37
599 0.36
600 0.36
601 0.31
602 0.25
603 0.23
604 0.24
605 0.2
606 0.19
607 0.18
608 0.16
609 0.18
610 0.23
611 0.28
612 0.3
613 0.36
614 0.37
615 0.39
616 0.42
617 0.45
618 0.49
619 0.52
620 0.5
621 0.47
622 0.5
623 0.48
624 0.44
625 0.38
626 0.32
627 0.24
628 0.21
629 0.21
630 0.17
631 0.17
632 0.17
633 0.16
634 0.15
635 0.14
636 0.14
637 0.11
638 0.15
639 0.18
640 0.17
641 0.19
642 0.26
643 0.34
644 0.38
645 0.43
646 0.44
647 0.51
648 0.59
649 0.64
650 0.67
651 0.6
652 0.56
653 0.52
654 0.48
655 0.43
656 0.35
657 0.3
658 0.23
659 0.28
660 0.26
661 0.25
662 0.28
663 0.23
664 0.22
665 0.23
666 0.24
667 0.24
668 0.28
669 0.3
670 0.31
671 0.3
672 0.31
673 0.36
674 0.33
675 0.27
676 0.25
677 0.28
678 0.25
679 0.26
680 0.25
681 0.2
682 0.22
683 0.28
684 0.35
685 0.31
686 0.34
687 0.37
688 0.37
689 0.36
690 0.36
691 0.31
692 0.28
693 0.3
694 0.28
695 0.31
696 0.31
697 0.31
698 0.3
699 0.27
700 0.25
701 0.21
702 0.23
703 0.17
704 0.17
705 0.14
706 0.14
707 0.15
708 0.11
709 0.1
710 0.09
711 0.1
712 0.11
713 0.12
714 0.12
715 0.13
716 0.14
717 0.14
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.1
722 0.11
723 0.13
724 0.14
725 0.15
726 0.15
727 0.16
728 0.17
729 0.18
730 0.17
731 0.2
732 0.24
733 0.25
734 0.26
735 0.3
736 0.35
737 0.44
738 0.5
739 0.49
740 0.51
741 0.55
742 0.55
743 0.52
744 0.45
745 0.37
746 0.31
747 0.27
748 0.2
749 0.15
750 0.14
751 0.13
752 0.14
753 0.13
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.11
758 0.11
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.05
767 0.06
768 0.07