FuNGI

F4PBL0

Protein Details

Accession

F4PBL0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
345-372	NTATTKSEKDRHSKKKRKIDTVNDAKIQ	Hydrophilic
454-474	KSIYTKTSQQHQDKMKRLKLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
354-362	DRHSKKKRK

Subcellular Location(s)

mito 12.5, mito_nucl 12, nucl 10.5, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006941 RNase_CAF1 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0015030 C:Cajal body GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0017069 F:snRNA binding GO:0034472 P:snRNA 3'-end processing
Pfam	View protein in Pfam PF04857 CAF1

Amino Acid Sequences

MTATLLSFNVVNRHNLSTLSLTINHILSRAHHVALDAEFTGLGDPQLTRQRNIEDRYRELANVARTHALVAFGLSIFEQPDPKHHPEQFTVNTFQFTMLSCKEHRVNPSSLAFLAEHKFDFNDQISNGIPYMPGNDIAGETDSGLNAIMRSILNQIIIGKIPTVVHNGLLDSMFVYQSFYAELPKDLTMFIADLNGMFRGGIYDTKYVSEFVTRESRTFLSYLFRKYERIQLQRQKANAPPYLTLAVKNRIQHKYTLTTSTLAELGLVSNPTASNKAGGKNKSQKAKNMYVSNRPYCEQYAAHGFCSLYSACAKSHDLDMILDWEEKDIAAAHGGQKVLLEKADNTATTKSEKDRHSKKKRKIDTVNDAKIQSEQTPNLASLATETVSEKLVDSSPKPPVGPAPIFETYHSACFDAYMTGFIFCHQCLECPNLMKEHGDRLYLIGKDMPIRVEKSIYTKTSQQHQDKMKRLKLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.29
4	0.26
5	0.26
6	0.25
7	0.24
8	0.23
9	0.25
10	0.25
11	0.22
12	0.2
13	0.18
14	0.17
15	0.24
16	0.24
17	0.22
18	0.21
19	0.22
20	0.23
21	0.23
22	0.23
23	0.15
24	0.12
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.09
29	0.08
30	0.07
31	0.07
32	0.12
33	0.22
34	0.24
35	0.26
36	0.29
37	0.37
38	0.43
39	0.48
40	0.52
41	0.49
42	0.52
43	0.55
44	0.53
45	0.46
46	0.4
47	0.4
48	0.37
49	0.32
50	0.29
51	0.27
52	0.25
53	0.26
54	0.24
55	0.2
56	0.14
57	0.12
58	0.1
59	0.08
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.11
66	0.11
67	0.18
68	0.25
69	0.31
70	0.39
71	0.41
72	0.45
73	0.46
74	0.54
75	0.52
76	0.5
77	0.49
78	0.41
79	0.39
80	0.35
81	0.31
82	0.24
83	0.19
84	0.19
85	0.16
86	0.19
87	0.19
88	0.24
89	0.28
90	0.32
91	0.37
92	0.37
93	0.38
94	0.4
95	0.41
96	0.37
97	0.33
98	0.31
99	0.25
100	0.23
101	0.21
102	0.18
103	0.16
104	0.14
105	0.15
106	0.13
107	0.16
108	0.14
109	0.15
110	0.14
111	0.15
112	0.15
113	0.16
114	0.15
115	0.12
116	0.11
117	0.08
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.1
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.05
134	0.04
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.12
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.06
159	0.07
160	0.06
161	0.05
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.06
189	0.08
190	0.09
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.12
197	0.1
198	0.12
199	0.19
200	0.19
201	0.19
202	0.21
203	0.21
204	0.2
205	0.2
206	0.17
207	0.16
208	0.19
209	0.21
210	0.22
211	0.22
212	0.24
213	0.25
214	0.33
215	0.35
216	0.38
217	0.44
218	0.49
219	0.57
220	0.58
221	0.58
222	0.53
223	0.49
224	0.48
225	0.42
226	0.36
227	0.28
228	0.26
229	0.27
230	0.24
231	0.22
232	0.19
233	0.2
234	0.21
235	0.24
236	0.3
237	0.31
238	0.32
239	0.33
240	0.33
241	0.35
242	0.34
243	0.34
244	0.28
245	0.25
246	0.24
247	0.22
248	0.19
249	0.13
250	0.11
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.09
262	0.11
263	0.17
264	0.23
265	0.25
266	0.33
267	0.42
268	0.47
269	0.53
270	0.54
271	0.55
272	0.57
273	0.63
274	0.61
275	0.6
276	0.59
277	0.59
278	0.64
279	0.61
280	0.55
281	0.48
282	0.44
283	0.37
284	0.35
285	0.26
286	0.21
287	0.26
288	0.25
289	0.25
290	0.24
291	0.22
292	0.19
293	0.21
294	0.18
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.13
300	0.15
301	0.13
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.1
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.06
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.11
321	0.11
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.14
333	0.15
334	0.16
335	0.18
336	0.2
337	0.22
338	0.28
339	0.34
340	0.42
341	0.51
342	0.61
343	0.7
344	0.77
345	0.83
346	0.86
347	0.9
348	0.91
349	0.9
350	0.89
351	0.89
352	0.89
353	0.86
354	0.79
355	0.7
356	0.6
357	0.51
358	0.43
359	0.35
360	0.29
361	0.23
362	0.21
363	0.22
364	0.22
365	0.21
366	0.19
367	0.15
368	0.11
369	0.12
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.1
378	0.13
379	0.15
380	0.17
381	0.21
382	0.26
383	0.28
384	0.28
385	0.27
386	0.3
387	0.34
388	0.34
389	0.3
390	0.32
391	0.33
392	0.34
393	0.33
394	0.34
395	0.28
396	0.29
397	0.28
398	0.21
399	0.17
400	0.17
401	0.17
402	0.13
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.12
409	0.13
410	0.11
411	0.15
412	0.14
413	0.15
414	0.17
415	0.22
416	0.25
417	0.28
418	0.31
419	0.3
420	0.31
421	0.33
422	0.33
423	0.36
424	0.34
425	0.31
426	0.29
427	0.28
428	0.33
429	0.29
430	0.28
431	0.22
432	0.21
433	0.24
434	0.25
435	0.25
436	0.24
437	0.26
438	0.27
439	0.27
440	0.28
441	0.32
442	0.38
443	0.38
444	0.38
445	0.42
446	0.46
447	0.53
448	0.61
449	0.61
450	0.62
451	0.7
452	0.75
453	0.79
454	0.84

F4PBL0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer