Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NU20

Protein Details
Accession F4NU20    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-208RDYGRERDSRRRSRSHSRSPHHSSSARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-211ERDSRRRSRSHSRSPHHSSSARDKS
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MVARSIYVRGVPPDASSSDLMEHFEEYGKVNDIYIPKSYHNGRPRGFAYVKFDKQEDAELAMEKIPSIVILGQTLNVEWATGERKTSNDMRRADDRSGRYRSNRYHYDDDDYYSSHRRDGGRDRYRDSSRDRYRDSSRDRYRDSSRDRYRDSSRDRYRDSSRDRYRNSSLERGRDRDYGRDRDYGRERDSRRRSRSHSRSPHHSSSARDKSPENRSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.13
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.2
24 0.26
25 0.3
26 0.36
27 0.42
28 0.48
29 0.46
30 0.5
31 0.5
32 0.52
33 0.5
34 0.45
35 0.45
36 0.46
37 0.48
38 0.43
39 0.42
40 0.35
41 0.34
42 0.34
43 0.26
44 0.19
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.09
52 0.07
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.04
66 0.06
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.22
74 0.26
75 0.31
76 0.34
77 0.37
78 0.42
79 0.45
80 0.44
81 0.43
82 0.41
83 0.41
84 0.43
85 0.42
86 0.41
87 0.44
88 0.47
89 0.48
90 0.5
91 0.49
92 0.49
93 0.47
94 0.49
95 0.42
96 0.39
97 0.32
98 0.27
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.15
103 0.18
104 0.17
105 0.21
106 0.29
107 0.38
108 0.42
109 0.45
110 0.48
111 0.52
112 0.54
113 0.53
114 0.51
115 0.51
116 0.51
117 0.55
118 0.55
119 0.54
120 0.58
121 0.62
122 0.63
123 0.63
124 0.63
125 0.63
126 0.63
127 0.63
128 0.63
129 0.63
130 0.63
131 0.63
132 0.63
133 0.63
134 0.63
135 0.63
136 0.63
137 0.63
138 0.63
139 0.63
140 0.63
141 0.63
142 0.63
143 0.63
144 0.63
145 0.63
146 0.63
147 0.63
148 0.65
149 0.68
150 0.68
151 0.69
152 0.69
153 0.68
154 0.66
155 0.65
156 0.61
157 0.61
158 0.63
159 0.6
160 0.58
161 0.57
162 0.54
163 0.53
164 0.56
165 0.54
166 0.52
167 0.55
168 0.52
169 0.54
170 0.6
171 0.58
172 0.55
173 0.56
174 0.58
175 0.62
176 0.71
177 0.72
178 0.72
179 0.75
180 0.77
181 0.8
182 0.85
183 0.85
184 0.85
185 0.83
186 0.85
187 0.85
188 0.84
189 0.81
190 0.75
191 0.71
192 0.71
193 0.73
194 0.67
195 0.61
196 0.58
197 0.59