Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NSS5

Protein Details
Accession F4NSS5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-66CEEFRKIRPKTKSQQEREEKRSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11, nucl 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR017131  snRNP-assoc_SmB/SmN  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0005687  C:U4 snRNP  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences SLSKNSRILQLLNHRLKITIQDGRTFIGQMLAFDKHMNLVLSECEEFRKIRPKTKSQQEREEKRSLGLVILRGETIISLSVEAPPPTAEDPKKSSAALGGPGVARGAGRGLPIAAPLTAAPAGLGGPIRGIGGPAPQSMQPQMGPGMGFSRPPISNMPPGMMGMPPMGMSGPPPPMSFGRGMPPMPPQGFRPPVRRLDYWTNLNGILQRTAIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.48
4 0.45
5 0.41
6 0.38
7 0.33
8 0.34
9 0.35
10 0.36
11 0.36
12 0.31
13 0.24
14 0.21
15 0.19
16 0.15
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.12
23 0.14
24 0.13
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.18
35 0.27
36 0.29
37 0.37
38 0.45
39 0.53
40 0.61
41 0.71
42 0.77
43 0.75
44 0.82
45 0.84
46 0.85
47 0.83
48 0.79
49 0.69
50 0.59
51 0.53
52 0.42
53 0.33
54 0.26
55 0.22
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.1
62 0.08
63 0.06
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.1
74 0.14
75 0.14
76 0.17
77 0.21
78 0.24
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.18
83 0.18
84 0.16
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.04
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.13
138 0.12
139 0.15
140 0.18
141 0.2
142 0.25
143 0.25
144 0.26
145 0.21
146 0.22
147 0.2
148 0.16
149 0.14
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.09
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.16
162 0.17
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.24
170 0.27
171 0.32
172 0.32
173 0.32
174 0.31
175 0.37
176 0.45
177 0.48
178 0.51
179 0.51
180 0.58
181 0.62
182 0.6
183 0.58
184 0.6
185 0.62
186 0.61
187 0.56
188 0.5
189 0.44
190 0.43
191 0.39
192 0.32
193 0.26