Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NVD8

Protein Details
Accession F4NVD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-72ATPKSKRAPATPTKTPKRKTKAASTPEKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-65KKAAATPKSKRAPATPTKTPKRKTKA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MGRRAANTSTAKPTESETPSKRASRSSNPITSQVSSESPKKAAATPKSKRAPATPTKTPKRKTKAASTPEKQDAIDTADDSELPVDLSDPILESSKNISTDLQSQSINILETTQAIDEPSETSNLPSTYESTMVLDDSTQTISSSIDDLVSADLSTESIQPETVEPTPSTFQSIVESHTSSVADESVGRGLHKRKSVSDDMDNNPEAKKRSKRMFQMLVGTLQTAKKDQDTNMSEAAIRRQTIEQRLAEKLVKEKAELADRIKKEREAVIEKRRLTEQKIKDISEEIIESQKKCLEKFIFTKASPGVYFMPANHNDRTKKVLVSAITVKTEAVSNADQPSSHTSIISV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.45
4 0.41
5 0.46
6 0.52
7 0.56
8 0.55
9 0.54
10 0.56
11 0.56
12 0.62
13 0.64
14 0.66
15 0.64
16 0.67
17 0.63
18 0.57
19 0.49
20 0.42
21 0.37
22 0.33
23 0.35
24 0.33
25 0.3
26 0.31
27 0.31
28 0.34
29 0.38
30 0.44
31 0.5
32 0.53
33 0.62
34 0.68
35 0.69
36 0.67
37 0.64
38 0.64
39 0.63
40 0.64
41 0.64
42 0.68
43 0.75
44 0.81
45 0.83
46 0.84
47 0.82
48 0.82
49 0.8
50 0.8
51 0.79
52 0.8
53 0.83
54 0.78
55 0.77
56 0.74
57 0.68
58 0.57
59 0.47
60 0.39
61 0.32
62 0.28
63 0.2
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.22
88 0.24
89 0.22
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.19
94 0.17
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.1
177 0.14
178 0.18
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.3
183 0.35
184 0.36
185 0.39
186 0.41
187 0.39
188 0.42
189 0.41
190 0.35
191 0.31
192 0.29
193 0.25
194 0.27
195 0.31
196 0.35
197 0.43
198 0.49
199 0.56
200 0.62
201 0.66
202 0.62
203 0.6
204 0.54
205 0.48
206 0.4
207 0.33
208 0.26
209 0.2
210 0.17
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.23
217 0.26
218 0.28
219 0.28
220 0.27
221 0.25
222 0.24
223 0.27
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.19
228 0.23
229 0.28
230 0.33
231 0.32
232 0.32
233 0.34
234 0.35
235 0.34
236 0.31
237 0.3
238 0.3
239 0.27
240 0.25
241 0.26
242 0.27
243 0.3
244 0.31
245 0.32
246 0.36
247 0.37
248 0.42
249 0.42
250 0.4
251 0.36
252 0.38
253 0.39
254 0.39
255 0.46
256 0.5
257 0.55
258 0.55
259 0.55
260 0.57
261 0.54
262 0.53
263 0.54
264 0.51
265 0.54
266 0.58
267 0.56
268 0.51
269 0.5
270 0.44
271 0.36
272 0.3
273 0.21
274 0.23
275 0.25
276 0.24
277 0.25
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.33
282 0.29
283 0.34
284 0.38
285 0.45
286 0.49
287 0.47
288 0.51
289 0.44
290 0.45
291 0.37
292 0.36
293 0.29
294 0.25
295 0.26
296 0.22
297 0.29
298 0.3
299 0.34
300 0.35
301 0.4
302 0.4
303 0.42
304 0.47
305 0.42
306 0.39
307 0.38
308 0.39
309 0.33
310 0.36
311 0.4
312 0.37
313 0.36
314 0.34
315 0.31
316 0.26
317 0.26
318 0.2
319 0.18
320 0.16
321 0.18
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.22
326 0.29
327 0.29
328 0.27