Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SW46

Protein Details
Accession Q8SW46    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-157RMYLEDRHQRDNNKRRKHGRHLRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-157NKRRKHGRHLR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027157  NCBP2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ecu:ECU03_0760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVTLERYFGGEPRGYFYREKTFVGTDEEYLEAKRSSSTVFVSNISTSVREERIWELFLLCGPVRRVVMGLNRNTLRFCGFCFVEFYSTDSANVAVRYLNGFRLEQSPLAIDKDYGFVDGRQYGRGVFGGRVKTDRMYLEDRHQRDNNKRRKHGRHLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.32
4 0.36
5 0.36
6 0.38
7 0.35
8 0.34
9 0.33
10 0.37
11 0.34
12 0.25
13 0.24
14 0.23
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.13
34 0.14
35 0.15
36 0.13
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.19
55 0.22
56 0.23
57 0.26
58 0.27
59 0.27
60 0.27
61 0.25
62 0.2
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.12
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.18
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.25
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.27
124 0.29
125 0.37
126 0.45
127 0.46
128 0.52
129 0.55
130 0.59
131 0.65
132 0.72
133 0.72
134 0.74
135 0.81
136 0.84
137 0.89