Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PD01

Protein Details
Accession F4PD01    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-33DIKVDVHKVKRLRKLRNDFDETTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MPAAWVDEDDDIKVDVHKVKRLRKLRNDFDETTVAGSDYEMRLRHQYERLFPKPKWAQVPTEKRDRDTSDQVDLGHNALLKLLQSTESIVNTNGKALLSADKLDVMRLKDVNQLAYSQAVVQSVQFHPYAPVLLTAGFDKTLRLFQVDGKLNSKIQSIYIKDMPIHKAHFTADGRRIIMTGRRKWFYVYDLESGTTEKIWGVRGRKDKSFERSIISPCGKYIGFLCLDGNVTLVSSNTMQWMSDVKMNGHVRCAVFSADGTRLFTFGGSGEVYEWDVETRECLNRFTDQGCLRPTAIAVSNDGKYIATGSSSGVVNVYLMESIRSASVDDGATTYEPQPVKVFMNLTTSITTLIFHPDSKLLLMASHSDKNALRIAHLPSMRVVKNWPTKAIPFDAVSTAAFSPHGGYLSVGNAKGKALLFKLGAYDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.25
4 0.32
5 0.39
6 0.47
7 0.57
8 0.66
9 0.72
10 0.76
11 0.83
12 0.86
13 0.88
14 0.87
15 0.8
16 0.75
17 0.67
18 0.57
19 0.48
20 0.37
21 0.27
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.13
26 0.16
27 0.15
28 0.17
29 0.23
30 0.26
31 0.32
32 0.35
33 0.39
34 0.45
35 0.54
36 0.6
37 0.62
38 0.59
39 0.64
40 0.65
41 0.66
42 0.66
43 0.6
44 0.61
45 0.64
46 0.75
47 0.7
48 0.73
49 0.69
50 0.63
51 0.66
52 0.63
53 0.6
54 0.58
55 0.56
56 0.5
57 0.49
58 0.47
59 0.42
60 0.36
61 0.3
62 0.22
63 0.19
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.16
79 0.17
80 0.15
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.17
91 0.19
92 0.17
93 0.19
94 0.19
95 0.2
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.22
100 0.21
101 0.18
102 0.18
103 0.16
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.13
133 0.22
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.3
138 0.3
139 0.3
140 0.28
141 0.2
142 0.17
143 0.21
144 0.2
145 0.23
146 0.24
147 0.24
148 0.24
149 0.28
150 0.28
151 0.26
152 0.26
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.25
157 0.23
158 0.26
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.27
163 0.27
164 0.22
165 0.26
166 0.29
167 0.31
168 0.34
169 0.35
170 0.35
171 0.37
172 0.37
173 0.33
174 0.31
175 0.27
176 0.23
177 0.22
178 0.22
179 0.21
180 0.2
181 0.18
182 0.12
183 0.08
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.12
188 0.15
189 0.22
190 0.3
191 0.33
192 0.37
193 0.41
194 0.44
195 0.47
196 0.49
197 0.44
198 0.39
199 0.39
200 0.37
201 0.39
202 0.35
203 0.29
204 0.23
205 0.24
206 0.2
207 0.17
208 0.16
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.19
234 0.22
235 0.22
236 0.22
237 0.23
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.14
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.07
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.19
273 0.18
274 0.23
275 0.22
276 0.26
277 0.26
278 0.26
279 0.25
280 0.23
281 0.22
282 0.18
283 0.2
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.15
291 0.11
292 0.12
293 0.09
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.17
331 0.22
332 0.22
333 0.23
334 0.21
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.11
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.17
347 0.17
348 0.12
349 0.11
350 0.12
351 0.15
352 0.18
353 0.21
354 0.2
355 0.24
356 0.24
357 0.26
358 0.29
359 0.25
360 0.22
361 0.24
362 0.28
363 0.32
364 0.32
365 0.3
366 0.29
367 0.37
368 0.35
369 0.32
370 0.32
371 0.34
372 0.43
373 0.46
374 0.47
375 0.44
376 0.47
377 0.51
378 0.51
379 0.45
380 0.36
381 0.35
382 0.32
383 0.28
384 0.25
385 0.23
386 0.18
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.16
397 0.2
398 0.19
399 0.19
400 0.19
401 0.19
402 0.22
403 0.22
404 0.21
405 0.19
406 0.23
407 0.22
408 0.23