FuNGI

F4PEM2

Protein Details

Accession

F4PEM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
457-477	NDRLSRKRSPDGRKKEDRGSG	Basic
527-565	RDKDRERDRDRERERNREREKGKGRDRDRNKGNERNQDI	Basic
622-642	TDNKQDKKPSHIQTQVKRSSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
459-486	RLSRKRSPDGRKKEDRGSGRESRREGAS
515-558	RDREREKDRDRERDKDRERDRDRERERNREREKGKGRDRDRNKG

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034772 CPSF6/7 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0110104 P:mRNA alternative polyadenylation GO:0098789 P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12372 RRM_CFIm68_CFIm59

Amino Acid Sequences

MDCNDDDLDLYGGMDPVPVCSFALDQTQSLKAPVSAVSDSTGDMHAYQGHVRQDTTESASMQDIDLYQTIDADYTLGQEDKSAVVDTDAVANEENDMDGNMITESNSDVWTMRVQHRPSIDSTADNGELVDKSNVAIPSTPNIHHSRSIVVQDLSWWTSDQNIFDILRAAGVYDQLVVREFGFSEIKANGKSKGICYIQFDTSTAATKAKEFFERIDIHGKPPSVKYAPVSFTSNPYRGQAKQQSDSGNQNGRSSSGADVGLNSGNNGRLDPRMAGFVGGGQAPIWSGQGFPQPRFDGMRGAPMPPFRVQGPPGTAAFFNPAMMQGLMGFPGGMPGLPGHPMLHNGLSKDAFMYGPQGIPMPIRQAQPRGRSGQVSQTSPPLPQRNYNRDDKGVEGGKTSRGRSPLPDQVRSNTAVKEKEEDRSQPVTKGPETKQPRETDRLEQREGKRSRTHSEDNDRLSRKRSPDGRKKEDRGSGRESRREGASKDVESQKDSKEEQRSDRGRDYSRISGSDRDREREKDRDRERDKDRERDRDRERERNREREKGKGRDRDRNKGNERNQDIGKTRDQTVDKPAERSIISRLGKGPESRSRSTLSSDDRSKGRSGDSSRRGSGNVTAATDNKQDKKPSHIQTQVKRSSLDFETFPSPEERQPLSVYSPVGDRW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.08
3	0.09
4	0.11
5	0.11
6	0.1
7	0.11
8	0.12
9	0.12
10	0.19
11	0.18
12	0.18
13	0.21
14	0.24
15	0.23
16	0.23
17	0.23
18	0.17
19	0.17
20	0.18
21	0.19
22	0.17
23	0.17
24	0.18
25	0.17
26	0.17
27	0.17
28	0.16
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.13
34	0.15
35	0.18
36	0.22
37	0.23
38	0.23
39	0.24
40	0.25
41	0.27
42	0.3
43	0.28
44	0.24
45	0.23
46	0.24
47	0.23
48	0.2
49	0.18
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.12
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.07
60	0.06
61	0.07
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.1
68	0.11
69	0.11
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.09
74	0.12
75	0.12
76	0.11
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.1
81	0.1
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.1
97	0.13
98	0.18
99	0.23
100	0.3
101	0.32
102	0.36
103	0.39
104	0.4
105	0.4
106	0.41
107	0.36
108	0.3
109	0.3
110	0.3
111	0.27
112	0.24
113	0.21
114	0.16
115	0.15
116	0.15
117	0.13
118	0.09
119	0.09
120	0.13
121	0.14
122	0.13
123	0.14
124	0.13
125	0.17
126	0.21
127	0.22
128	0.23
129	0.26
130	0.28
131	0.3
132	0.3
133	0.28
134	0.28
135	0.29
136	0.28
137	0.24
138	0.21
139	0.2
140	0.22
141	0.19
142	0.17
143	0.15
144	0.11
145	0.15
146	0.16
147	0.15
148	0.13
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.16
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.09
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.12
172	0.13
173	0.14
174	0.17
175	0.18
176	0.17
177	0.2
178	0.22
179	0.21
180	0.27
181	0.27
182	0.27
183	0.31
184	0.33
185	0.31
186	0.3
187	0.29
188	0.24
189	0.22
190	0.22
191	0.17
192	0.15
193	0.13
194	0.15
195	0.17
196	0.17
197	0.19
198	0.18
199	0.19
200	0.23
201	0.25
202	0.26
203	0.31
204	0.29
205	0.29
206	0.31
207	0.31
208	0.27
209	0.26
210	0.29
211	0.23
212	0.24
213	0.24
214	0.26
215	0.27
216	0.28
217	0.31
218	0.26
219	0.3
220	0.34
221	0.33
222	0.29
223	0.29
224	0.3
225	0.27
226	0.35
227	0.38
228	0.38
229	0.39
230	0.42
231	0.43
232	0.43
233	0.46
234	0.43
235	0.41
236	0.36
237	0.34
238	0.31
239	0.27
240	0.25
241	0.21
242	0.17
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.07
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.12
277	0.14
278	0.15
279	0.19
280	0.19
281	0.21
282	0.23
283	0.22
284	0.21
285	0.19
286	0.26
287	0.22
288	0.22
289	0.22
290	0.21
291	0.23
292	0.19
293	0.2
294	0.14
295	0.16
296	0.16
297	0.17
298	0.19
299	0.18
300	0.18
301	0.17
302	0.16
303	0.14
304	0.15
305	0.12
306	0.1
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.1
338	0.08
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.13
350	0.15
351	0.16
352	0.23
353	0.29
354	0.34
355	0.37
356	0.37
357	0.35
358	0.35
359	0.35
360	0.36
361	0.34
362	0.31
363	0.28
364	0.28
365	0.27
366	0.27
367	0.31
368	0.29
369	0.27
370	0.32
371	0.4
372	0.44
373	0.48
374	0.54
375	0.52
376	0.48
377	0.48
378	0.42
379	0.39
380	0.34
381	0.29
382	0.24
383	0.21
384	0.25
385	0.27
386	0.27
387	0.24
388	0.24
389	0.25
390	0.27
391	0.33
392	0.35
393	0.38
394	0.42
395	0.41
396	0.41
397	0.42
398	0.41
399	0.37
400	0.31
401	0.3
402	0.26
403	0.26
404	0.27
405	0.26
406	0.28
407	0.3
408	0.29
409	0.31
410	0.34
411	0.35
412	0.32
413	0.34
414	0.33
415	0.32
416	0.37
417	0.33
418	0.36
419	0.43
420	0.47
421	0.5
422	0.51
423	0.54
424	0.53
425	0.55
426	0.55
427	0.57
428	0.57
429	0.55
430	0.58
431	0.57
432	0.61
433	0.6
434	0.56
435	0.53
436	0.51
437	0.52
438	0.52
439	0.55
440	0.53
441	0.6
442	0.61
443	0.6
444	0.64
445	0.62
446	0.57
447	0.54
448	0.52
449	0.46
450	0.48
451	0.52
452	0.54
453	0.61
454	0.7
455	0.76
456	0.79
457	0.81
458	0.8
459	0.79
460	0.75
461	0.7
462	0.67
463	0.67
464	0.64
465	0.65
466	0.6
467	0.54
468	0.52
469	0.5
470	0.43
471	0.42
472	0.4
473	0.35
474	0.39
475	0.42
476	0.39
477	0.38
478	0.4
479	0.35
480	0.34
481	0.35
482	0.36
483	0.39
484	0.43
485	0.46
486	0.53
487	0.56
488	0.57
489	0.61
490	0.6
491	0.55
492	0.54
493	0.53
494	0.5
495	0.47
496	0.44
497	0.4
498	0.42
499	0.42
500	0.47
501	0.45
502	0.43
503	0.45
504	0.48
505	0.51
506	0.54
507	0.57
508	0.58
509	0.63
510	0.69
511	0.71
512	0.74
513	0.76
514	0.76
515	0.77
516	0.77
517	0.77
518	0.77
519	0.77
520	0.78
521	0.78
522	0.78
523	0.79
524	0.8
525	0.79
526	0.8
527	0.82
528	0.83
529	0.82
530	0.81
531	0.76
532	0.76
533	0.77
534	0.77
535	0.78
536	0.77
537	0.77
538	0.78
539	0.83
540	0.83
541	0.82
542	0.82
543	0.81
544	0.81
545	0.82
546	0.82
547	0.79
548	0.75
549	0.69
550	0.66
551	0.61
552	0.56
553	0.54
554	0.47
555	0.44
556	0.44
557	0.45
558	0.41
559	0.45
560	0.5
561	0.46
562	0.45
563	0.44
564	0.4
565	0.38
566	0.37
567	0.33
568	0.32
569	0.31
570	0.32
571	0.34
572	0.34
573	0.38
574	0.4
575	0.42
576	0.42
577	0.48
578	0.48
579	0.48
580	0.47
581	0.45
582	0.46
583	0.46
584	0.44
585	0.45
586	0.47
587	0.49
588	0.48
589	0.5
590	0.47
591	0.42
592	0.39
593	0.38
594	0.41
595	0.46
596	0.52
597	0.56
598	0.57
599	0.56
600	0.53
601	0.47
602	0.45
603	0.41
604	0.35
605	0.3
606	0.29
607	0.29
608	0.32
609	0.36
610	0.38
611	0.37
612	0.41
613	0.45
614	0.46
615	0.54
616	0.6
617	0.61
618	0.65
619	0.68
620	0.72
621	0.74
622	0.82
623	0.81
624	0.74
625	0.68
626	0.59
627	0.56
628	0.5
629	0.44
630	0.34
631	0.3
632	0.33
633	0.32
634	0.32
635	0.3
636	0.29
637	0.29
638	0.35
639	0.33
640	0.31
641	0.33
642	0.34
643	0.34
644	0.34
645	0.32
646	0.27

F4PEM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer