FuNGI

F4P4M8

Protein Details

Accession

F4P4M8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
721-740	EGAMSRKNGKRNKGQNGPLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013907 Sds3
Gene Ontology	GO:0070822 C:Sin3-type complex GO:0042826 F:histone deacetylase binding GO:0016575 P:histone deacetylation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08598 Sds3

Amino Acid Sequences

MQHRTSSSSTSGTTPNNGYRNDGFVSRDHPTPSASTIGGNGQPQPPTLPPLSSFRHVPPPHGSSNAYSHPSTTTLPPPTSISAHSREYHYYSQQQPGHVSSHSTNSAIATTSHAINPSAANARQGSSVGSATSGANHVSIGSTTGSTTVGSTAITTRPTHIQQQGYSDYDREYYSQHHPQSEYGNSTAIASHGNGNHHPSQHYYRQYNSGTGSGGSHYNPPPPQHMLHGSGHQQIHHHSPTHPQIHSQSTGSGAQSGMTYGRDPHPYSIQHHQQQHYNQQQPMDMHHTVISPLPGPAQYHHQHHSIVPTSQQHRDQRDHQQQSMPYHHPMQQHPHLNQHHQQQSMHHPQEYQRHSYQPVHHSQPPRIEHRKSFSGSLPVSHQPSQYQQHQSNFRGDNLDESHDSTAAAYRPLSHPSTAGSASHADNDITTITPIVPTTSVMPAASNAAPSNTNAKLAPVTTSPTMSGQALHGSTYPLQQIQQSERQQIKQEPIGRPRSSATTKFDAPNPPPQSRPHQTARNTSPGTYTDHSNASESSDGYKESYADMAYANHQLGTSLSAATHRKPRIFHDVDEHLEKLDITFQAQKDEIYRSRLDKFAKETKELRMGIYPEYLDALKVLEQERDAALVEAALFRDYTIECAKKVHQLEHDTCLTEYVGEKSGLRESMLNQLNEKKRKLKEERDGFDVATDAGIEATKNVGIRKAARLNQRFNAGNNGSEEGAMSRKNGKRNKGQNGPLLVFQLKDHEIYDDLGLLRRNANVRKATSGYKSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.39
3	0.42
4	0.41
5	0.44
6	0.4
7	0.41
8	0.39
9	0.36
10	0.31
11	0.27
12	0.32
13	0.29
14	0.31
15	0.3
16	0.28
17	0.28
18	0.29
19	0.29
20	0.27
21	0.24
22	0.21
23	0.2
24	0.23
25	0.23
26	0.23
27	0.24
28	0.24
29	0.25
30	0.25
31	0.27
32	0.24
33	0.27
34	0.27
35	0.25
36	0.25
37	0.3
38	0.35
39	0.35
40	0.37
41	0.36
42	0.45
43	0.43
44	0.46
45	0.47
46	0.48
47	0.48
48	0.48
49	0.46
50	0.39
51	0.45
52	0.45
53	0.41
54	0.35
55	0.33
56	0.31
57	0.31
58	0.3
59	0.28
60	0.29
61	0.31
62	0.32
63	0.33
64	0.34
65	0.34
66	0.34
67	0.33
68	0.31
69	0.31
70	0.35
71	0.35
72	0.36
73	0.37
74	0.4
75	0.42
76	0.42
77	0.45
78	0.45
79	0.52
80	0.51
81	0.5
82	0.48
83	0.45
84	0.42
85	0.34
86	0.34
87	0.26
88	0.29
89	0.28
90	0.25
91	0.23
92	0.21
93	0.21
94	0.18
95	0.16
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.17
103	0.17
104	0.16
105	0.2
106	0.19
107	0.2
108	0.2
109	0.21
110	0.21
111	0.21
112	0.18
113	0.15
114	0.15
115	0.12
116	0.11
117	0.11
118	0.1
119	0.11
120	0.11
121	0.09
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.07
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.09
140	0.1
141	0.13
142	0.13
143	0.15
144	0.2
145	0.23
146	0.29
147	0.33
148	0.36
149	0.35
150	0.4
151	0.42
152	0.39
153	0.38
154	0.31
155	0.26
156	0.23
157	0.23
158	0.18
159	0.15
160	0.17
161	0.23
162	0.31
163	0.33
164	0.35
165	0.35
166	0.37
167	0.4
168	0.4
169	0.36
170	0.28
171	0.26
172	0.22
173	0.21
174	0.19
175	0.14
176	0.12
177	0.09
178	0.12
179	0.13
180	0.16
181	0.17
182	0.22
183	0.25
184	0.26
185	0.26
186	0.27
187	0.32
188	0.37
189	0.43
190	0.41
191	0.41
192	0.47
193	0.47
194	0.45
195	0.4
196	0.34
197	0.26
198	0.23
199	0.21
200	0.15
201	0.15
202	0.13
203	0.16
204	0.16
205	0.21
206	0.23
207	0.25
208	0.28
209	0.3
210	0.3
211	0.29
212	0.32
213	0.31
214	0.31
215	0.32
216	0.31
217	0.33
218	0.33
219	0.29
220	0.27
221	0.24
222	0.29
223	0.28
224	0.27
225	0.22
226	0.29
227	0.36
228	0.41
229	0.38
230	0.35
231	0.36
232	0.39
233	0.4
234	0.33
235	0.26
236	0.22
237	0.23
238	0.2
239	0.17
240	0.13
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.12
249	0.16
250	0.17
251	0.19
252	0.24
253	0.26
254	0.29
255	0.36
256	0.41
257	0.44
258	0.49
259	0.49
260	0.5
261	0.52
262	0.57
263	0.58
264	0.55
265	0.5
266	0.45
267	0.46
268	0.4
269	0.39
270	0.36
271	0.27
272	0.22
273	0.21
274	0.2
275	0.17
276	0.18
277	0.15
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.16
285	0.19
286	0.23
287	0.26
288	0.27
289	0.27
290	0.27
291	0.3
292	0.26
293	0.23
294	0.22
295	0.25
296	0.27
297	0.3
298	0.36
299	0.38
300	0.41
301	0.45
302	0.47
303	0.52
304	0.59
305	0.59
306	0.55
307	0.53
308	0.52
309	0.52
310	0.53
311	0.45
312	0.37
313	0.35
314	0.37
315	0.36
316	0.35
317	0.38
318	0.38
319	0.42
320	0.41
321	0.47
322	0.46
323	0.47
324	0.49
325	0.5
326	0.47
327	0.43
328	0.42
329	0.37
330	0.42
331	0.47
332	0.44
333	0.36
334	0.33
335	0.35
336	0.43
337	0.43
338	0.4
339	0.32
340	0.33
341	0.36
342	0.39
343	0.41
344	0.38
345	0.4
346	0.4
347	0.43
348	0.44
349	0.44
350	0.46
351	0.44
352	0.47
353	0.49
354	0.47
355	0.46
356	0.48
357	0.5
358	0.44
359	0.42
360	0.35
361	0.34
362	0.31
363	0.28
364	0.26
365	0.24
366	0.26
367	0.24
368	0.23
369	0.18
370	0.23
371	0.26
372	0.28
373	0.32
374	0.32
375	0.37
376	0.42
377	0.43
378	0.45
379	0.42
380	0.37
381	0.32
382	0.28
383	0.26
384	0.21
385	0.22
386	0.15
387	0.16
388	0.15
389	0.13
390	0.13
391	0.1
392	0.1
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.13
399	0.14
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.15
404	0.14
405	0.13
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.08
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.07
428	0.08
429	0.07
430	0.1
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.13
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.13
445	0.09
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.13
452	0.11
453	0.11
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.14
467	0.17
468	0.25
469	0.27
470	0.33
471	0.36
472	0.37
473	0.4
474	0.41
475	0.4
476	0.38
477	0.42
478	0.42
479	0.47
480	0.53
481	0.49
482	0.47
483	0.44
484	0.45
485	0.42
486	0.41
487	0.38
488	0.35
489	0.37
490	0.38
491	0.41
492	0.41
493	0.39
494	0.44
495	0.44
496	0.42
497	0.41
498	0.43
499	0.48
500	0.47
501	0.5
502	0.48
503	0.5
504	0.53
505	0.6
506	0.61
507	0.61
508	0.56
509	0.5
510	0.45
511	0.39
512	0.39
513	0.31
514	0.29
515	0.22
516	0.23
517	0.23
518	0.22
519	0.21
520	0.17
521	0.16
522	0.14
523	0.14
524	0.13
525	0.12
526	0.12
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.11
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.08
535	0.1
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.09
544	0.07
545	0.07
546	0.11
547	0.14
548	0.17
549	0.25
550	0.27
551	0.3
552	0.32
553	0.37
554	0.44
555	0.45
556	0.44
557	0.43
558	0.44
559	0.45
560	0.46
561	0.41
562	0.3
563	0.27
564	0.24
565	0.17
566	0.15
567	0.12
568	0.11
569	0.16
570	0.16
571	0.19
572	0.19
573	0.2
574	0.19
575	0.25
576	0.26
577	0.26
578	0.29
579	0.29
580	0.32
581	0.37
582	0.37
583	0.36
584	0.4
585	0.44
586	0.45
587	0.48
588	0.48
589	0.48
590	0.54
591	0.49
592	0.44
593	0.4
594	0.37
595	0.33
596	0.32
597	0.26
598	0.18
599	0.19
600	0.17
601	0.12
602	0.11
603	0.1
604	0.08
605	0.11
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.14
610	0.14
611	0.14
612	0.13
613	0.11
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.06
622	0.08
623	0.08
624	0.11
625	0.17
626	0.18
627	0.18
628	0.22
629	0.24
630	0.3
631	0.33
632	0.35
633	0.36
634	0.42
635	0.46
636	0.48
637	0.48
638	0.42
639	0.39
640	0.35
641	0.28
642	0.2
643	0.18
644	0.15
645	0.15
646	0.14
647	0.15
648	0.15
649	0.19
650	0.19
651	0.18
652	0.17
653	0.17
654	0.25
655	0.31
656	0.3
657	0.29
658	0.38
659	0.46
660	0.52
661	0.56
662	0.55
663	0.56
664	0.66
665	0.73
666	0.74
667	0.76
668	0.8
669	0.78
670	0.75
671	0.71
672	0.6
673	0.5
674	0.4
675	0.29
676	0.18
677	0.14
678	0.08
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.05
683	0.06
684	0.08
685	0.09
686	0.1
687	0.13
688	0.17
689	0.21
690	0.29
691	0.37
692	0.42
693	0.51
694	0.59
695	0.63
696	0.64
697	0.68
698	0.62
699	0.55
700	0.59
701	0.5
702	0.44
703	0.39
704	0.36
705	0.29
706	0.26
707	0.25
708	0.16
709	0.18
710	0.16
711	0.15
712	0.23
713	0.27
714	0.37
715	0.44
716	0.51
717	0.59
718	0.68
719	0.77
720	0.77
721	0.81
722	0.79
723	0.79
724	0.73
725	0.64
726	0.58
727	0.49
728	0.39
729	0.32
730	0.3
731	0.23
732	0.22
733	0.21
734	0.18
735	0.19
736	0.19
737	0.2
738	0.17
739	0.16
740	0.18
741	0.2
742	0.19
743	0.19
744	0.22
745	0.29
746	0.32
747	0.39
748	0.43
749	0.44
750	0.49
751	0.52
752	0.54
753	0.55

F4P4M8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer