Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NXU9

Protein Details
Accession F4NXU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42SAGKTMRQRATHKPKARARGRRLAVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-38RATHKPKARARGRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF13831  PHD_2  
PF13832  zf-HC5HC2H_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15571  ePHD  
cd15492  PHD_BRPF_JADE_like  
Amino Acid Sequences MTGSNHSQSPADNSDMSAGKTMRQRATHKPKARARGRRLAVPDEPTSGDEDMDQSQDQELGRTSDSNDRLVSDGQKKEEKASLESGDLGAGKTRSKAIGKVDEDQDKDVDMDDDDDDDDDDDDDEDDDDDEEETFCAICGRAYSPKANCIVLCDGENCDVPVHQKCYGIDVVPPGDEKWFCHRCADGVLVADTSIICCSDLGGALKRTKTLNQYVHVVCAKWNGSNGVENDVIDVVNWPLNSHTCYICNESHGLTLQCTSPSCEKWLHATCGIKEDVLQHPTRNLTKFTVLCFDHKNQKSLKNAPSIKRLAPPTSTKVKRATLKRQRNSSGKDLKWEADSDIDISIEIADDEADGSASVVSSSAMAEDEDEPVMQTVGKDSPSRSIRVDTLSKGKLRKSTVQPTSSTIFPKNSSADKSATGYHSSTGAILARVSKKSAPISPSQASSDASTDSKKPSIAIIPRKSTDSILATGKFNSTRPLPANQAVKMSSAYKPWLKDSQRPLVSSVAGLLNSVSNDDANFDANSRSTTAQTPRSIQETASQSGSAWSWLMDKLATIKTTAAEIENMPVEIKRLFSKEAVGSATSTTSNSALALDTLLESSYNDFSKIAEERINEIRALKQQLSVANTEIQKLQQESIRMRTFAQPTLQASQMTESSNQNSTGAAGTSTSNSVSNVIMQAQYQAMQDNLEVIFSFLNLPQMPNPSKGDIDGYVSALRAIVERAKRSANVIDTGTPNAGTFPTGSHNTNHNIKMDSSGDFETSNSMYAPNMKRVANDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.28
4 0.27
5 0.23
6 0.25
7 0.31
8 0.38
9 0.39
10 0.45
11 0.5
12 0.56
13 0.66
14 0.72
15 0.75
16 0.78
17 0.8
18 0.84
19 0.88
20 0.88
21 0.86
22 0.86
23 0.82
24 0.8
25 0.77
26 0.74
27 0.69
28 0.64
29 0.57
30 0.5
31 0.46
32 0.39
33 0.36
34 0.29
35 0.23
36 0.18
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.16
41 0.13
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.19
51 0.25
52 0.27
53 0.28
54 0.27
55 0.26
56 0.27
57 0.29
58 0.34
59 0.33
60 0.36
61 0.39
62 0.44
63 0.44
64 0.46
65 0.48
66 0.43
67 0.39
68 0.39
69 0.36
70 0.31
71 0.3
72 0.26
73 0.23
74 0.2
75 0.16
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.2
82 0.22
83 0.26
84 0.3
85 0.39
86 0.41
87 0.46
88 0.5
89 0.52
90 0.52
91 0.49
92 0.42
93 0.33
94 0.3
95 0.24
96 0.18
97 0.12
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.11
128 0.17
129 0.2
130 0.27
131 0.29
132 0.34
133 0.36
134 0.37
135 0.33
136 0.32
137 0.32
138 0.26
139 0.26
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.17
145 0.14
146 0.13
147 0.16
148 0.2
149 0.22
150 0.22
151 0.25
152 0.25
153 0.29
154 0.3
155 0.26
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.18
160 0.19
161 0.15
162 0.17
163 0.16
164 0.18
165 0.24
166 0.27
167 0.27
168 0.29
169 0.29
170 0.27
171 0.3
172 0.29
173 0.21
174 0.18
175 0.18
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.09
189 0.12
190 0.16
191 0.2
192 0.2
193 0.22
194 0.24
195 0.26
196 0.3
197 0.36
198 0.37
199 0.37
200 0.43
201 0.42
202 0.45
203 0.42
204 0.36
205 0.28
206 0.27
207 0.25
208 0.19
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.21
213 0.21
214 0.21
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.16
219 0.14
220 0.1
221 0.1
222 0.06
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.16
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.18
239 0.19
240 0.17
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.14
247 0.16
248 0.16
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.26
253 0.3
254 0.3
255 0.31
256 0.33
257 0.31
258 0.33
259 0.32
260 0.24
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.22
265 0.23
266 0.19
267 0.21
268 0.25
269 0.28
270 0.27
271 0.24
272 0.23
273 0.27
274 0.27
275 0.27
276 0.29
277 0.26
278 0.27
279 0.29
280 0.31
281 0.36
282 0.37
283 0.4
284 0.38
285 0.43
286 0.47
287 0.5
288 0.52
289 0.51
290 0.56
291 0.56
292 0.59
293 0.57
294 0.52
295 0.49
296 0.47
297 0.4
298 0.38
299 0.38
300 0.35
301 0.42
302 0.42
303 0.41
304 0.43
305 0.46
306 0.5
307 0.54
308 0.6
309 0.6
310 0.69
311 0.72
312 0.75
313 0.76
314 0.76
315 0.73
316 0.71
317 0.7
318 0.6
319 0.58
320 0.52
321 0.46
322 0.4
323 0.35
324 0.26
325 0.17
326 0.17
327 0.12
328 0.1
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.02
337 0.02
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.02
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.16
369 0.18
370 0.2
371 0.2
372 0.21
373 0.2
374 0.23
375 0.25
376 0.2
377 0.24
378 0.26
379 0.28
380 0.28
381 0.3
382 0.31
383 0.33
384 0.38
385 0.4
386 0.46
387 0.5
388 0.5
389 0.49
390 0.47
391 0.45
392 0.39
393 0.34
394 0.27
395 0.22
396 0.2
397 0.21
398 0.2
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.2
406 0.19
407 0.19
408 0.17
409 0.14
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.16
423 0.19
424 0.22
425 0.22
426 0.23
427 0.29
428 0.29
429 0.29
430 0.28
431 0.26
432 0.23
433 0.21
434 0.18
435 0.14
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.19
445 0.25
446 0.33
447 0.36
448 0.39
449 0.4
450 0.42
451 0.41
452 0.36
453 0.32
454 0.24
455 0.21
456 0.2
457 0.2
458 0.19
459 0.18
460 0.19
461 0.17
462 0.15
463 0.16
464 0.14
465 0.17
466 0.19
467 0.22
468 0.24
469 0.29
470 0.32
471 0.3
472 0.31
473 0.28
474 0.26
475 0.24
476 0.22
477 0.18
478 0.16
479 0.19
480 0.2
481 0.21
482 0.24
483 0.31
484 0.33
485 0.39
486 0.44
487 0.5
488 0.5
489 0.5
490 0.48
491 0.41
492 0.38
493 0.3
494 0.24
495 0.16
496 0.12
497 0.11
498 0.09
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.16
517 0.2
518 0.26
519 0.28
520 0.3
521 0.31
522 0.33
523 0.32
524 0.28
525 0.3
526 0.28
527 0.27
528 0.25
529 0.23
530 0.19
531 0.2
532 0.2
533 0.13
534 0.09
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.07
541 0.1
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.09
557 0.1
558 0.09
559 0.1
560 0.12
561 0.14
562 0.15
563 0.16
564 0.2
565 0.2
566 0.22
567 0.22
568 0.19
569 0.18
570 0.16
571 0.17
572 0.13
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.09
577 0.09
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.07
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.14
595 0.16
596 0.17
597 0.17
598 0.18
599 0.22
600 0.27
601 0.28
602 0.25
603 0.25
604 0.26
605 0.28
606 0.32
607 0.28
608 0.26
609 0.27
610 0.31
611 0.32
612 0.3
613 0.26
614 0.26
615 0.26
616 0.25
617 0.23
618 0.2
619 0.21
620 0.21
621 0.22
622 0.19
623 0.24
624 0.26
625 0.34
626 0.36
627 0.33
628 0.34
629 0.39
630 0.39
631 0.38
632 0.37
633 0.33
634 0.33
635 0.36
636 0.36
637 0.29
638 0.26
639 0.25
640 0.24
641 0.21
642 0.21
643 0.2
644 0.21
645 0.23
646 0.23
647 0.21
648 0.19
649 0.18
650 0.16
651 0.14
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.11
662 0.12
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.13
668 0.12
669 0.13
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.09
683 0.07
684 0.12
685 0.12
686 0.14
687 0.17
688 0.25
689 0.27
690 0.3
691 0.33
692 0.31
693 0.32
694 0.31
695 0.32
696 0.25
697 0.27
698 0.24
699 0.22
700 0.2
701 0.19
702 0.18
703 0.15
704 0.14
705 0.1
706 0.11
707 0.16
708 0.21
709 0.24
710 0.28
711 0.31
712 0.32
713 0.35
714 0.39
715 0.36
716 0.34
717 0.33
718 0.34
719 0.33
720 0.34
721 0.31
722 0.25
723 0.21
724 0.18
725 0.16
726 0.13
727 0.11
728 0.1
729 0.15
730 0.19
731 0.21
732 0.23
733 0.28
734 0.34
735 0.41
736 0.42
737 0.4
738 0.38
739 0.37
740 0.39
741 0.36
742 0.31
743 0.28
744 0.26
745 0.24
746 0.22
747 0.21
748 0.2
749 0.18
750 0.17
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.21
755 0.25
756 0.29
757 0.34
758 0.33