Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SW54

Protein Details
Accession Q8SW54    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-336TMFNVADHLRRRRHRSSRNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-331RRRHR
Subcellular Location(s) plas 17, nucl 5.5, cyto_nucl 4.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
KEGG ecu:ECU03_0560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MSFYKGREKMTLHGLISKQINPTDSTPLDVREVKKYCYYGFSNASLRPKYWKVFLGYYSKNKFRTEMFLRNMRSSYSFYIGKIGDEFEGKDGCYKVIENDVCRTFIKPRTECKDSGEKRRYCEFLDSIHRDTQETHRAVIERILKCYAMTNSSVKYVQGMNLVLTAIYYVLYLSEDEEDRRYCEEDSFFCFNSLMVEIGDNFMEDLDQCSGGIVHRMSRVMEIVEEADRELYRAMKRKGLVEGGFHMKWILLMFVSCFDIEDVVWLWDRLLSDSCRFEMVLYCCASAIIMARSVIIREDFDVCMELLQKPSTVSAETMFNVADHLRRRRHRSSRNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.43
4 0.41
5 0.37
6 0.33
7 0.34
8 0.31
9 0.32
10 0.34
11 0.31
12 0.32
13 0.29
14 0.29
15 0.32
16 0.34
17 0.34
18 0.36
19 0.39
20 0.38
21 0.42
22 0.43
23 0.39
24 0.4
25 0.41
26 0.38
27 0.39
28 0.41
29 0.4
30 0.42
31 0.48
32 0.44
33 0.41
34 0.42
35 0.43
36 0.41
37 0.41
38 0.41
39 0.39
40 0.41
41 0.45
42 0.46
43 0.48
44 0.54
45 0.57
46 0.58
47 0.57
48 0.54
49 0.52
50 0.45
51 0.48
52 0.47
53 0.49
54 0.48
55 0.52
56 0.54
57 0.55
58 0.53
59 0.45
60 0.4
61 0.34
62 0.31
63 0.29
64 0.26
65 0.23
66 0.28
67 0.26
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.19
84 0.21
85 0.2
86 0.26
87 0.27
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.26
92 0.3
93 0.38
94 0.37
95 0.44
96 0.5
97 0.54
98 0.53
99 0.53
100 0.57
101 0.53
102 0.6
103 0.61
104 0.56
105 0.56
106 0.61
107 0.57
108 0.48
109 0.47
110 0.38
111 0.33
112 0.4
113 0.4
114 0.38
115 0.38
116 0.36
117 0.31
118 0.32
119 0.33
120 0.32
121 0.28
122 0.26
123 0.25
124 0.25
125 0.25
126 0.28
127 0.3
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.22
133 0.24
134 0.2
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.02
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.19
174 0.21
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.09
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.11
219 0.15
220 0.23
221 0.25
222 0.29
223 0.3
224 0.33
225 0.36
226 0.38
227 0.34
228 0.28
229 0.31
230 0.32
231 0.31
232 0.28
233 0.24
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.11
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.15
259 0.19
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.14
274 0.14
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.18
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.18
310 0.23
311 0.31
312 0.4
313 0.49
314 0.58
315 0.67
316 0.77