Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6G1GHQ0

Protein Details
Accession A0A6G1GHQ0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-567LNDIQVKKWRQPRWLKSREEQEKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, pero 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences METQELPHIEDHPQGDDVRRQVEYYFSDENLPNDAYLLEKCCGSQNLPVSIKKICSFAMMRKYKPYSAVVAALKKSIYLDVVDDKLIKRKIPVILEEVINAEGKPTYKKPPPNLGFPENPKGPTSNNPLMTKGMLKPTGFEEWYADPPVTPAEYKDDAQCYDSSIPIDARMEAAVQRYSSRRKFHQTTRAIFSAWFRYSGWDAGQRQFQGNDPKELENYDAPEIALMTSTLFPGEDKDDRTKWVVDFEGVAKGFLSTRLPNIIHLSTDNVKTATQVMMNMYNWFLHHNVCPEYSQEILAARSVCGLAYEEYQKLIPLRPQLPGPFNIAMSTLFDGYYGPIYGEGDEMVDIKELRAQAWDGIIMNYHMAKVSVLAGLAAIASEKLFAAIIDKPAGDETEKNNGNGECKDGPSSDAEETWVERAKALIPNVRREVGLQITAIEPPSQEVKELYHQHNAEVRKKMHLKPLGTLRCKLWDLQTFRPRDMPEQKRWNPGEIVVHLEDDLLAHCFVGMKISGVIRMVEEGHWWLDEVLAAFPSFYTLLLNDIQVKKWRQPRWLKSREEQEKAERKDNMAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.3
4 0.32
5 0.31
6 0.3
7 0.29
8 0.27
9 0.31
10 0.29
11 0.3
12 0.29
13 0.26
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.3
18 0.28
19 0.21
20 0.19
21 0.18
22 0.15
23 0.15
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.19
29 0.22
30 0.22
31 0.26
32 0.29
33 0.37
34 0.42
35 0.43
36 0.41
37 0.42
38 0.44
39 0.39
40 0.35
41 0.27
42 0.28
43 0.29
44 0.35
45 0.42
46 0.45
47 0.46
48 0.53
49 0.58
50 0.55
51 0.55
52 0.5
53 0.45
54 0.41
55 0.45
56 0.41
57 0.42
58 0.4
59 0.37
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.21
64 0.16
65 0.11
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.26
73 0.28
74 0.26
75 0.25
76 0.29
77 0.34
78 0.36
79 0.38
80 0.35
81 0.36
82 0.35
83 0.33
84 0.29
85 0.24
86 0.2
87 0.16
88 0.12
89 0.1
90 0.11
91 0.15
92 0.18
93 0.25
94 0.33
95 0.41
96 0.49
97 0.58
98 0.61
99 0.66
100 0.7
101 0.68
102 0.67
103 0.65
104 0.65
105 0.57
106 0.55
107 0.46
108 0.41
109 0.37
110 0.37
111 0.4
112 0.39
113 0.42
114 0.42
115 0.43
116 0.42
117 0.41
118 0.37
119 0.32
120 0.3
121 0.28
122 0.26
123 0.26
124 0.28
125 0.31
126 0.28
127 0.25
128 0.22
129 0.21
130 0.24
131 0.24
132 0.2
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.12
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.23
144 0.22
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.17
165 0.26
166 0.31
167 0.36
168 0.39
169 0.48
170 0.54
171 0.61
172 0.67
173 0.67
174 0.66
175 0.67
176 0.62
177 0.53
178 0.47
179 0.41
180 0.37
181 0.3
182 0.25
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.24
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.25
195 0.28
196 0.31
197 0.3
198 0.32
199 0.31
200 0.31
201 0.3
202 0.3
203 0.28
204 0.2
205 0.2
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.09
222 0.11
223 0.14
224 0.18
225 0.19
226 0.21
227 0.24
228 0.24
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.17
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.16
304 0.18
305 0.18
306 0.21
307 0.23
308 0.25
309 0.25
310 0.26
311 0.22
312 0.2
313 0.19
314 0.17
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.06
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.1
382 0.12
383 0.13
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.26
388 0.26
389 0.28
390 0.25
391 0.27
392 0.19
393 0.19
394 0.21
395 0.18
396 0.19
397 0.18
398 0.21
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.16
405 0.17
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.19
411 0.21
412 0.25
413 0.26
414 0.33
415 0.37
416 0.37
417 0.34
418 0.31
419 0.32
420 0.28
421 0.25
422 0.18
423 0.16
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.12
428 0.09
429 0.09
430 0.13
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.23
436 0.3
437 0.32
438 0.36
439 0.36
440 0.38
441 0.43
442 0.46
443 0.45
444 0.46
445 0.44
446 0.46
447 0.53
448 0.55
449 0.59
450 0.6
451 0.55
452 0.54
453 0.63
454 0.64
455 0.61
456 0.59
457 0.51
458 0.5
459 0.49
460 0.44
461 0.41
462 0.4
463 0.42
464 0.49
465 0.55
466 0.52
467 0.53
468 0.56
469 0.51
470 0.52
471 0.56
472 0.54
473 0.57
474 0.65
475 0.69
476 0.73
477 0.73
478 0.68
479 0.59
480 0.55
481 0.51
482 0.41
483 0.42
484 0.32
485 0.31
486 0.26
487 0.24
488 0.2
489 0.13
490 0.13
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.11
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.14
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.11
509 0.12
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.11
529 0.12
530 0.14
531 0.2
532 0.21
533 0.26
534 0.32
535 0.37
536 0.42
537 0.5
538 0.56
539 0.59
540 0.68
541 0.75
542 0.78
543 0.83
544 0.83
545 0.83
546 0.88
547 0.87
548 0.83
549 0.79
550 0.78
551 0.79
552 0.77
553 0.76
554 0.69