Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P516

Protein Details
Accession F4P516    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MDSNAQQRSSRWPRIRPKREPATVVNLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12.999, cyto_nucl 12.666, mito 4, cyto_mito 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034352  Rim4_RRM1  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12453  RRM1_RIM4_like  
Amino Acid Sequences MDSNAQQRSSRWPRIRPKREPATVVNLPPIMVPSTDIVTPICANSESELNPSKQMQCDLHQEELCQLHANISTNEPFQKDANNKSSLAVTEPTPYLSSQKNTTHDFERSESGGSSINSGNDTMLAALSTSKSSTVTLIGTVAIRNDRKSNAGLDSNSDGVSFVSTSKSAIGKHKSMPRRALLLSSCRETEMSGNLNLHAPKPQYTCALNTNDSNASSRQRSISVCSDEATSGVNIATESTNSPKTTCDFWKSMDSISSTISSTQTSSTTAFEADTVEILATMFEEVTISSTCSCTSDNIPKNNDIAEQAYSAVPFTAEDATNDDADAMHSLSPSHSEPGIGQDRSVYVNLDNSESFNDTPANTSDVIDTATEQSSAVQIPTLIDHQAGLSTVSRGQPEACLFVASLSAAKSDAELQESVTNHFQTWGELLNVRVLKDWMGRPYAFVQFKSVADAQNALVKGHNTIVDNRHIRIEQAKVNRTLVVSSTDSTSSDIYSIMEKYGPIESFTLPDALKAPSICKDDTCCIGEAVVKYRYREDAMEAFAELRAAGTLSVDWTSSVDKPFRDIDQFSIFVGNLNAVMVTEQLLQEKFGQYGEIVEMNFIKRNQGNPNNRPAFALLRFRTDASAQRAIRSENGQTWWNQSMRVQLREIHSEISQASTPVTPPISGNPAFSNESLPMQSQWRPHPSFAFRNSYNRHSRHHSLPITGSSGEGQYFQNNMMPKAHMGMPPYQYGYAPYPYTWIPPHGHMADQSGYAINGYPMVGQFGAGASGPMMVMMSDRDSNGIEGGGLAKNPGIVLGGAAEEAPQPEADSGYDFYMGQAPIQQQGGQPLMMLPLNPLHQDPQIQQQSVKYGWSPQPMWYMPSQYIQQSYAYPFAQMRSHPASCSGYPQHQLPLQPAQWKEMPKNEFDAGQSSPNNSGTADADLAFATNSSYNVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.89
3 0.89
4 0.89
5 0.89
6 0.89
7 0.85
8 0.8
9 0.78
10 0.74
11 0.67
12 0.61
13 0.51
14 0.43
15 0.36
16 0.32
17 0.24
18 0.17
19 0.16
20 0.12
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.18
33 0.17
34 0.22
35 0.27
36 0.26
37 0.29
38 0.32
39 0.34
40 0.34
41 0.38
42 0.36
43 0.36
44 0.44
45 0.45
46 0.49
47 0.45
48 0.42
49 0.42
50 0.4
51 0.36
52 0.29
53 0.24
54 0.2
55 0.22
56 0.24
57 0.21
58 0.23
59 0.25
60 0.25
61 0.28
62 0.26
63 0.25
64 0.23
65 0.3
66 0.33
67 0.39
68 0.43
69 0.44
70 0.43
71 0.42
72 0.44
73 0.36
74 0.33
75 0.26
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.24
84 0.26
85 0.29
86 0.36
87 0.39
88 0.43
89 0.46
90 0.48
91 0.47
92 0.47
93 0.43
94 0.4
95 0.36
96 0.33
97 0.29
98 0.25
99 0.24
100 0.21
101 0.21
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.12
108 0.12
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.17
130 0.18
131 0.2
132 0.24
133 0.25
134 0.27
135 0.28
136 0.3
137 0.28
138 0.31
139 0.3
140 0.3
141 0.31
142 0.29
143 0.27
144 0.23
145 0.18
146 0.13
147 0.13
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.14
155 0.17
156 0.25
157 0.3
158 0.33
159 0.4
160 0.49
161 0.54
162 0.6
163 0.63
164 0.59
165 0.58
166 0.55
167 0.53
168 0.49
169 0.48
170 0.45
171 0.41
172 0.37
173 0.33
174 0.32
175 0.27
176 0.24
177 0.21
178 0.2
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.22
183 0.22
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.23
188 0.25
189 0.27
190 0.27
191 0.28
192 0.31
193 0.33
194 0.36
195 0.33
196 0.31
197 0.33
198 0.3
199 0.29
200 0.28
201 0.25
202 0.24
203 0.24
204 0.26
205 0.24
206 0.25
207 0.26
208 0.29
209 0.33
210 0.33
211 0.31
212 0.3
213 0.29
214 0.26
215 0.25
216 0.21
217 0.13
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.12
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.23
233 0.27
234 0.29
235 0.28
236 0.3
237 0.35
238 0.35
239 0.34
240 0.31
241 0.28
242 0.23
243 0.22
244 0.21
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.15
283 0.24
284 0.3
285 0.36
286 0.39
287 0.39
288 0.4
289 0.38
290 0.34
291 0.26
292 0.21
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.16
326 0.22
327 0.2
328 0.18
329 0.18
330 0.18
331 0.2
332 0.2
333 0.14
334 0.08
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.07
392 0.07
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.12
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.16
425 0.14
426 0.16
427 0.16
428 0.17
429 0.2
430 0.25
431 0.23
432 0.22
433 0.22
434 0.21
435 0.21
436 0.23
437 0.21
438 0.15
439 0.14
440 0.15
441 0.13
442 0.14
443 0.14
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.12
450 0.09
451 0.12
452 0.14
453 0.2
454 0.22
455 0.21
456 0.22
457 0.2
458 0.2
459 0.2
460 0.21
461 0.2
462 0.25
463 0.28
464 0.28
465 0.29
466 0.29
467 0.26
468 0.23
469 0.18
470 0.16
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.07
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.13
504 0.16
505 0.16
506 0.15
507 0.17
508 0.18
509 0.21
510 0.21
511 0.17
512 0.14
513 0.14
514 0.16
515 0.14
516 0.16
517 0.19
518 0.18
519 0.19
520 0.2
521 0.21
522 0.2
523 0.2
524 0.19
525 0.16
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.14
530 0.12
531 0.12
532 0.08
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.05
544 0.07
545 0.09
546 0.11
547 0.13
548 0.12
549 0.15
550 0.17
551 0.18
552 0.19
553 0.19
554 0.2
555 0.22
556 0.22
557 0.2
558 0.19
559 0.17
560 0.14
561 0.13
562 0.1
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.09
588 0.12
589 0.11
590 0.14
591 0.14
592 0.19
593 0.28
594 0.37
595 0.46
596 0.48
597 0.59
598 0.58
599 0.57
600 0.53
601 0.46
602 0.41
603 0.35
604 0.39
605 0.29
606 0.3
607 0.31
608 0.3
609 0.3
610 0.28
611 0.3
612 0.27
613 0.35
614 0.3
615 0.32
616 0.33
617 0.33
618 0.33
619 0.3
620 0.26
621 0.21
622 0.23
623 0.22
624 0.22
625 0.25
626 0.27
627 0.25
628 0.23
629 0.21
630 0.27
631 0.31
632 0.32
633 0.3
634 0.29
635 0.32
636 0.35
637 0.35
638 0.28
639 0.23
640 0.22
641 0.21
642 0.19
643 0.16
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.1
651 0.1
652 0.12
653 0.17
654 0.17
655 0.18
656 0.17
657 0.2
658 0.22
659 0.22
660 0.21
661 0.16
662 0.17
663 0.17
664 0.16
665 0.14
666 0.16
667 0.19
668 0.22
669 0.28
670 0.35
671 0.37
672 0.38
673 0.43
674 0.46
675 0.51
676 0.52
677 0.53
678 0.47
679 0.53
680 0.56
681 0.58
682 0.6
683 0.56
684 0.55
685 0.56
686 0.59
687 0.57
688 0.61
689 0.56
690 0.5
691 0.49
692 0.46
693 0.41
694 0.36
695 0.29
696 0.2
697 0.18
698 0.15
699 0.14
700 0.12
701 0.11
702 0.11
703 0.12
704 0.14
705 0.15
706 0.16
707 0.16
708 0.17
709 0.15
710 0.17
711 0.21
712 0.19
713 0.2
714 0.24
715 0.25
716 0.26
717 0.27
718 0.25
719 0.21
720 0.23
721 0.23
722 0.21
723 0.2
724 0.18
725 0.19
726 0.19
727 0.22
728 0.21
729 0.22
730 0.21
731 0.22
732 0.28
733 0.27
734 0.28
735 0.25
736 0.27
737 0.24
738 0.22
739 0.2
740 0.14
741 0.13
742 0.12
743 0.11
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.06
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.04
758 0.05
759 0.04
760 0.04
761 0.04
762 0.03
763 0.04
764 0.05
765 0.07
766 0.08
767 0.08
768 0.1
769 0.11
770 0.11
771 0.11
772 0.1
773 0.08
774 0.07
775 0.09
776 0.09
777 0.08
778 0.08
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.07
783 0.06
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.06
795 0.07
796 0.07
797 0.08
798 0.08
799 0.1
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.11
804 0.12
805 0.16
806 0.15
807 0.13
808 0.16
809 0.16
810 0.18
811 0.19
812 0.2
813 0.16
814 0.21
815 0.22
816 0.18
817 0.17
818 0.14
819 0.16
820 0.15
821 0.14
822 0.1
823 0.12
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.17
828 0.18
829 0.22
830 0.23
831 0.3
832 0.35
833 0.35
834 0.36
835 0.36
836 0.39
837 0.36
838 0.36
839 0.27
840 0.28
841 0.32
842 0.38
843 0.37
844 0.35
845 0.42
846 0.41
847 0.43
848 0.38
849 0.37
850 0.32
851 0.35
852 0.34
853 0.29
854 0.31
855 0.29
856 0.27
857 0.26
858 0.27
859 0.28
860 0.25
861 0.24
862 0.22
863 0.24
864 0.26
865 0.24
866 0.28
867 0.32
868 0.33
869 0.31
870 0.35
871 0.38
872 0.35
873 0.42
874 0.4
875 0.38
876 0.4
877 0.42
878 0.43
879 0.41
880 0.42
881 0.39
882 0.42
883 0.4
884 0.44
885 0.43
886 0.42
887 0.44
888 0.48
889 0.49
890 0.49
891 0.48
892 0.44
893 0.49
894 0.45
895 0.42
896 0.38
897 0.36
898 0.29
899 0.32
900 0.31
901 0.28
902 0.3
903 0.29
904 0.28
905 0.24
906 0.24
907 0.19
908 0.2
909 0.18
910 0.15
911 0.14
912 0.13
913 0.14
914 0.12
915 0.1
916 0.09
917 0.09