FuNGI

A0A6G1GH61

Protein Details

Accession

A0A6G1GH61

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-42	QKNAPQKPPKPASPKLKIVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
205-260	KAAQEAAKEAAKSKKGGKHAQQDAKADKAADKKAAKASKEVAASPSRSKRGAKADK
376-396	AKETGRPAKGPRTRGPRGAAK
552-593	REKGGKGTVGGGGGAGQGGRGGHGGRGGRGRGRWGGGKGGGA

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MSPSGKGAPSQNGLLPMPTAILQKNAPQKPPKPASPKLKIVIRRLAPGLTQDEFEAALGGEWKCGAGKVDWVSYRPGSISTDAANPSLPSRAYLRVTDKAHIFALNQHVKETQFVDSKNTTRDPALIGPPVLEIALLQKVPSGKRKVDQRQGLIDQDPDFKAFLESLTNPITKPAPIDAVGEASTSKSAEKVTITPLIQHLRDKKAAQEAAKEAAKSKKGGKHAQQDAKADKAADKKAAKASKEVAASPSRSKRGAKADKTPVRVLTKESPASSKAAAAAATQAQGGATTVPTGPSAERRRERGNASLAAKIVQRDLGVLPSRGPRGKGVVPAPSTPGSREPAAKADSEASPRPAALLDGSSASAATPGRAAAGSAKETGRPAKGPRTRGPRGAAKAAANANATIVDKPNNIGSTAQPLTTPSTKHSAAQSAQPSPTILKKTPTPTPAAQPTPPPSTPSTAPSTSRKSTAPPPLTTTTITHAFLKHANPSQGITTDLLTTALAAHGPVVSCEIDRKKGYAYAEFATSEGLMAAVAASPVKVAEGAVEVLVRREKGGKGTVGGGGGAGQGGRGGHGGRGGRGRGRWGGGKGGGAGDGGAAPVSAAGRAAGAPP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.26
3	0.2
4	0.17
5	0.17
6	0.18
7	0.14
8	0.18
9	0.18
10	0.25
11	0.35
12	0.39
13	0.46
14	0.52
15	0.57
16	0.64
17	0.71
18	0.74
19	0.73
20	0.77
21	0.79
22	0.79
23	0.81
24	0.78
25	0.78
26	0.76
27	0.75
28	0.75
29	0.68
30	0.64
31	0.57
32	0.51
33	0.44
34	0.41
35	0.38
36	0.3
37	0.27
38	0.22
39	0.2
40	0.19
41	0.17
42	0.13
43	0.08
44	0.07
45	0.1
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.12
53	0.09
54	0.15
55	0.18
56	0.25
57	0.26
58	0.28
59	0.31
60	0.3
61	0.3
62	0.25
63	0.23
64	0.2
65	0.2
66	0.21
67	0.18
68	0.22
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.18
73	0.17
74	0.19
75	0.17
76	0.14
77	0.17
78	0.22
79	0.24
80	0.28
81	0.33
82	0.38
83	0.4
84	0.43
85	0.41
86	0.38
87	0.36
88	0.32
89	0.27
90	0.24
91	0.31
92	0.34
93	0.32
94	0.31
95	0.32
96	0.31
97	0.33
98	0.3
99	0.26
100	0.24
101	0.24
102	0.29
103	0.31
104	0.34
105	0.36
106	0.36
107	0.33
108	0.29
109	0.3
110	0.27
111	0.27
112	0.28
113	0.25
114	0.23
115	0.21
116	0.21
117	0.19
118	0.15
119	0.11
120	0.07
121	0.07
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.1
126	0.14
127	0.18
128	0.26
129	0.3
130	0.31
131	0.37
132	0.47
133	0.56
134	0.62
135	0.66
136	0.63
137	0.65
138	0.65
139	0.62
140	0.53
141	0.46
142	0.38
143	0.34
144	0.3
145	0.23
146	0.2
147	0.16
148	0.15
149	0.13
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.14
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.18
158	0.19
159	0.15
160	0.16
161	0.14
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.11
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.09
177	0.1
178	0.11
179	0.14
180	0.19
181	0.19
182	0.19
183	0.23
184	0.26
185	0.25
186	0.29
187	0.32
188	0.32
189	0.36
190	0.35
191	0.34
192	0.38
193	0.41
194	0.37
195	0.36
196	0.33
197	0.34
198	0.35
199	0.31
200	0.27
201	0.29
202	0.29
203	0.27
204	0.32
205	0.32
206	0.38
207	0.46
208	0.51
209	0.55
210	0.63
211	0.67
212	0.65
213	0.65
214	0.6
215	0.54
216	0.47
217	0.37
218	0.31
219	0.3
220	0.27
221	0.29
222	0.27
223	0.28
224	0.35
225	0.39
226	0.36
227	0.34
228	0.35
229	0.32
230	0.33
231	0.3
232	0.26
233	0.25
234	0.26
235	0.29
236	0.32
237	0.3
238	0.31
239	0.32
240	0.34
241	0.42
242	0.49
243	0.48
244	0.51
245	0.59
246	0.63
247	0.66
248	0.62
249	0.56
250	0.5
251	0.46
252	0.42
253	0.37
254	0.36
255	0.33
256	0.32
257	0.29
258	0.27
259	0.28
260	0.23
261	0.18
262	0.13
263	0.12
264	0.11
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.04
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.14
283	0.18
284	0.26
285	0.29
286	0.32
287	0.37
288	0.4
289	0.43
290	0.4
291	0.39
292	0.37
293	0.36
294	0.33
295	0.29
296	0.26
297	0.24
298	0.19
299	0.15
300	0.11
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.14
309	0.17
310	0.17
311	0.18
312	0.15
313	0.18
314	0.2
315	0.23
316	0.22
317	0.25
318	0.26
319	0.25
320	0.27
321	0.25
322	0.23
323	0.2
324	0.21
325	0.18
326	0.17
327	0.18
328	0.17
329	0.19
330	0.2
331	0.19
332	0.17
333	0.16
334	0.17
335	0.19
336	0.19
337	0.17
338	0.16
339	0.15
340	0.15
341	0.13
342	0.11
343	0.08
344	0.08
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.09
361	0.1
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.14
366	0.17
367	0.16
368	0.17
369	0.2
370	0.28
371	0.33
372	0.39
373	0.45
374	0.52
375	0.54
376	0.57
377	0.59
378	0.56
379	0.55
380	0.53
381	0.48
382	0.4
383	0.4
384	0.36
385	0.33
386	0.25
387	0.21
388	0.17
389	0.15
390	0.15
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.17
402	0.18
403	0.17
404	0.15
405	0.16
406	0.19
407	0.21
408	0.21
409	0.17
410	0.22
411	0.22
412	0.24
413	0.25
414	0.26
415	0.25
416	0.31
417	0.33
418	0.31
419	0.31
420	0.29
421	0.28
422	0.24
423	0.28
424	0.27
425	0.24
426	0.24
427	0.29
428	0.33
429	0.39
430	0.4
431	0.4
432	0.38
433	0.43
434	0.47
435	0.46
436	0.43
437	0.43
438	0.45
439	0.46
440	0.44
441	0.4
442	0.35
443	0.35
444	0.35
445	0.33
446	0.34
447	0.3
448	0.34
449	0.37
450	0.42
451	0.4
452	0.41
453	0.38
454	0.36
455	0.42
456	0.48
457	0.47
458	0.43
459	0.47
460	0.47
461	0.48
462	0.46
463	0.39
464	0.33
465	0.31
466	0.3
467	0.26
468	0.23
469	0.23
470	0.25
471	0.25
472	0.27
473	0.29
474	0.3
475	0.29
476	0.29
477	0.29
478	0.26
479	0.26
480	0.2
481	0.16
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.1
486	0.09
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.16
499	0.19
500	0.24
501	0.26
502	0.27
503	0.27
504	0.31
505	0.34
506	0.32
507	0.33
508	0.28
509	0.29
510	0.28
511	0.26
512	0.22
513	0.19
514	0.14
515	0.1
516	0.07
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.03
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.06
531	0.07
532	0.07
533	0.09
534	0.08
535	0.11
536	0.14
537	0.14
538	0.13
539	0.17
540	0.18
541	0.23
542	0.28
543	0.28
544	0.27
545	0.29
546	0.29
547	0.26
548	0.24
549	0.19
550	0.13
551	0.11
552	0.09
553	0.07
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.07
559	0.07
560	0.08
561	0.13
562	0.15
563	0.18
564	0.24
565	0.27
566	0.31
567	0.32
568	0.37
569	0.37
570	0.4
571	0.42
572	0.39
573	0.42
574	0.39
575	0.38
576	0.34
577	0.3
578	0.25
579	0.19
580	0.16
581	0.1
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06

A0A6G1GH61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer