Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NX74

Protein Details
Accession F4NX74    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-110LQRSRRIKSGENRKKCSYSRHydrophilic
662-721KQQPSSGKGKKSNQKSGKGKKLNQKSVQQQSLSGKSKKSNQKSGKGKKSNQKSVQQQPLSHydrophilic
790-817DINATRKIVQARKPQKKAHTPVKNTVSSHydrophilic
837-867MAEYSFNRTNKKRDKRHQPCQYGNAKRIRRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
666-710SSGKGKKSNQKSGKGKKLNQKSVQQQSLSGKSKKSNQKSGKGKKS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0016075  P:rRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MGLPKLRAWMRQTMPKCFAVLEKKKPLEIDHIFVDINFILHLKAHRSASSNSLMIQVVKKLRQIIQHGAIRVTRQLFLSVDGPPPIAKMLLQRSRRIKSGENRKKCSYSRFDTRQITPGCMFMDDVERYLEHYACKHLAVSPKNAPQPSVIISGPSVPGEGELKIIETIVKMQQDAEIRANERFAILGSDTDIILQTIAANVDCLVIDSSTNEVFSVESFYKSLESMVPGKDTRRVALDFAALVLFSGNDYLPKLPKVPISITWAAYIKYSKTIQFQHIVSDDAKSFCTKALLDLLETIKIQEPKLRRKPSASSTAAAQNAESSEEEESEKEIVININPINTSASNSDIFVPKINLAKATQQDLSDDGMVKQYLEGTLWCLHMFRNGKCVNFSFRYSFKRPPTVREVISYLKRNTANIHAPIENNEALPAAVCASMVVQSECKSFIEPRLRPLMDVFQSLIKVDFSLAGVAMQDAYNQMQQHYMSLNKPFDVRNTVPYALVLRKPTYINPLASPESNQNRTEVYIPNPARQFGDFFTFNNPFWKVKLDPGEGINVVKQSESLQQEPIHYTNNVTGPISQPSVFKNNALNQKPLQHQPLLDKNNVLNQKPLQQQPSSGKNNTPNQKPLQQQPLSDKNNAPNQKPVQQQPSSGKNNTPNQKPVKQQPSSGKGKKSNQKSGKGKKLNQKSVQQQSLSGKSKKSNQKSGKGKKSNQKSVQQQPLSGKNNTPDQKSVQQQQPLSDKNNVSDQKSVQYQPSSGKGNKLNQKSVQHQPHNAKNYSSAQSTQSMTLVDINATRKIVQARKPQKKAHTPVKNTVSSQRFDLNEIDVDISAIIATSMAEYSFNRTNKKRDKRHQPCQYGNAKRIRRDVQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.58
3 0.54
4 0.46
5 0.47
6 0.48
7 0.52
8 0.53
9 0.58
10 0.59
11 0.61
12 0.62
13 0.58
14 0.57
15 0.52
16 0.46
17 0.39
18 0.38
19 0.35
20 0.32
21 0.31
22 0.21
23 0.17
24 0.12
25 0.1
26 0.08
27 0.11
28 0.14
29 0.15
30 0.2
31 0.23
32 0.26
33 0.3
34 0.32
35 0.35
36 0.38
37 0.34
38 0.3
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.26
43 0.27
44 0.29
45 0.31
46 0.33
47 0.35
48 0.39
49 0.43
50 0.48
51 0.5
52 0.52
53 0.54
54 0.53
55 0.51
56 0.48
57 0.43
58 0.42
59 0.35
60 0.28
61 0.24
62 0.25
63 0.22
64 0.23
65 0.24
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.17
71 0.18
72 0.15
73 0.14
74 0.12
75 0.17
76 0.26
77 0.34
78 0.39
79 0.47
80 0.55
81 0.59
82 0.63
83 0.61
84 0.6
85 0.62
86 0.68
87 0.71
88 0.72
89 0.76
90 0.77
91 0.8
92 0.76
93 0.76
94 0.73
95 0.71
96 0.71
97 0.71
98 0.74
99 0.73
100 0.71
101 0.7
102 0.63
103 0.59
104 0.49
105 0.44
106 0.36
107 0.29
108 0.26
109 0.18
110 0.22
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.19
117 0.19
118 0.14
119 0.16
120 0.19
121 0.19
122 0.2
123 0.19
124 0.21
125 0.28
126 0.3
127 0.36
128 0.39
129 0.45
130 0.51
131 0.5
132 0.47
133 0.41
134 0.4
135 0.36
136 0.32
137 0.25
138 0.19
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.16
143 0.13
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.17
161 0.19
162 0.22
163 0.23
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.25
168 0.21
169 0.18
170 0.15
171 0.12
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.09
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.25
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.24
223 0.22
224 0.23
225 0.22
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.15
243 0.17
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.29
248 0.31
249 0.29
250 0.3
251 0.28
252 0.25
253 0.24
254 0.22
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.18
259 0.22
260 0.26
261 0.28
262 0.32
263 0.31
264 0.3
265 0.3
266 0.29
267 0.24
268 0.22
269 0.2
270 0.16
271 0.16
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.24
291 0.33
292 0.44
293 0.5
294 0.49
295 0.52
296 0.58
297 0.6
298 0.63
299 0.55
300 0.46
301 0.41
302 0.44
303 0.4
304 0.33
305 0.27
306 0.18
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.12
330 0.09
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.18
345 0.19
346 0.21
347 0.21
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.14
353 0.13
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.15
370 0.19
371 0.17
372 0.24
373 0.26
374 0.26
375 0.28
376 0.29
377 0.29
378 0.28
379 0.3
380 0.25
381 0.27
382 0.34
383 0.37
384 0.43
385 0.41
386 0.48
387 0.47
388 0.49
389 0.52
390 0.5
391 0.46
392 0.41
393 0.4
394 0.35
395 0.39
396 0.39
397 0.32
398 0.32
399 0.32
400 0.3
401 0.29
402 0.29
403 0.28
404 0.26
405 0.28
406 0.23
407 0.23
408 0.24
409 0.26
410 0.21
411 0.16
412 0.13
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.07
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.15
433 0.24
434 0.24
435 0.27
436 0.34
437 0.34
438 0.33
439 0.33
440 0.32
441 0.23
442 0.23
443 0.21
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.12
471 0.12
472 0.17
473 0.17
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.19
478 0.23
479 0.22
480 0.21
481 0.25
482 0.25
483 0.23
484 0.23
485 0.23
486 0.19
487 0.21
488 0.19
489 0.16
490 0.18
491 0.19
492 0.19
493 0.23
494 0.24
495 0.23
496 0.22
497 0.25
498 0.24
499 0.24
500 0.24
501 0.25
502 0.28
503 0.3
504 0.29
505 0.26
506 0.25
507 0.26
508 0.27
509 0.22
510 0.19
511 0.25
512 0.26
513 0.3
514 0.3
515 0.29
516 0.28
517 0.26
518 0.24
519 0.16
520 0.2
521 0.16
522 0.16
523 0.21
524 0.22
525 0.21
526 0.23
527 0.24
528 0.2
529 0.2
530 0.23
531 0.19
532 0.23
533 0.29
534 0.27
535 0.27
536 0.27
537 0.29
538 0.25
539 0.24
540 0.2
541 0.14
542 0.12
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.14
547 0.17
548 0.17
549 0.2
550 0.21
551 0.23
552 0.25
553 0.25
554 0.21
555 0.18
556 0.18
557 0.18
558 0.19
559 0.18
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.16
564 0.17
565 0.15
566 0.14
567 0.16
568 0.21
569 0.2
570 0.21
571 0.23
572 0.28
573 0.37
574 0.39
575 0.39
576 0.36
577 0.42
578 0.45
579 0.45
580 0.42
581 0.35
582 0.34
583 0.37
584 0.44
585 0.42
586 0.39
587 0.36
588 0.33
589 0.38
590 0.41
591 0.34
592 0.29
593 0.27
594 0.34
595 0.38
596 0.42
597 0.39
598 0.35
599 0.4
600 0.43
601 0.5
602 0.49
603 0.45
604 0.45
605 0.49
606 0.57
607 0.59
608 0.58
609 0.55
610 0.54
611 0.59
612 0.58
613 0.58
614 0.59
615 0.54
616 0.52
617 0.54
618 0.59
619 0.56
620 0.55
621 0.51
622 0.47
623 0.54
624 0.55
625 0.49
626 0.47
627 0.48
628 0.51
629 0.54
630 0.54
631 0.54
632 0.51
633 0.55
634 0.53
635 0.58
636 0.57
637 0.54
638 0.52
639 0.51
640 0.58
641 0.6
642 0.59
643 0.58
644 0.59
645 0.64
646 0.66
647 0.68
648 0.69
649 0.64
650 0.65
651 0.66
652 0.67
653 0.71
654 0.7
655 0.69
656 0.67
657 0.74
658 0.76
659 0.76
660 0.78
661 0.76
662 0.8
663 0.83
664 0.84
665 0.86
666 0.87
667 0.85
668 0.85
669 0.87
670 0.87
671 0.84
672 0.82
673 0.81
674 0.81
675 0.79
676 0.7
677 0.64
678 0.6
679 0.62
680 0.61
681 0.54
682 0.48
683 0.47
684 0.56
685 0.61
686 0.64
687 0.65
688 0.67
689 0.73
690 0.8
691 0.86
692 0.88
693 0.87
694 0.88
695 0.87
696 0.88
697 0.89
698 0.87
699 0.85
700 0.84
701 0.84
702 0.85
703 0.77
704 0.71
705 0.67
706 0.68
707 0.64
708 0.57
709 0.5
710 0.44
711 0.52
712 0.51
713 0.48
714 0.43
715 0.43
716 0.48
717 0.52
718 0.56
719 0.54
720 0.56
721 0.54
722 0.56
723 0.59
724 0.56
725 0.54
726 0.52
727 0.47
728 0.43
729 0.5
730 0.47
731 0.42
732 0.42
733 0.39
734 0.37
735 0.41
736 0.41
737 0.37
738 0.36
739 0.36
740 0.35
741 0.39
742 0.41
743 0.38
744 0.42
745 0.45
746 0.51
747 0.58
748 0.6
749 0.62
750 0.62
751 0.68
752 0.67
753 0.7
754 0.72
755 0.7
756 0.72
757 0.73
758 0.75
759 0.76
760 0.71
761 0.62
762 0.58
763 0.57
764 0.52
765 0.47
766 0.4
767 0.35
768 0.36
769 0.37
770 0.32
771 0.26
772 0.23
773 0.2
774 0.2
775 0.18
776 0.15
777 0.16
778 0.18
779 0.19
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.28
784 0.34
785 0.4
786 0.48
787 0.57
788 0.67
789 0.75
790 0.8
791 0.82
792 0.86
793 0.87
794 0.87
795 0.87
796 0.84
797 0.85
798 0.85
799 0.8
800 0.72
801 0.72
802 0.66
803 0.57
804 0.53
805 0.49
806 0.42
807 0.39
808 0.38
809 0.32
810 0.28
811 0.27
812 0.24
813 0.18
814 0.17
815 0.14
816 0.12
817 0.08
818 0.06
819 0.05
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.05
824 0.05
825 0.07
826 0.07
827 0.14
828 0.22
829 0.26
830 0.34
831 0.4
832 0.5
833 0.6
834 0.7
835 0.76
836 0.79
837 0.86
838 0.89
839 0.94
840 0.94
841 0.94
842 0.92
843 0.91
844 0.91
845 0.89
846 0.86
847 0.85
848 0.82
849 0.78
850 0.78