Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NWQ0

Protein Details
Accession F4NWQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-47MREPSRIRNKIKRGEVFHKLKSEKSRNKLKTRLKQKKEEASNPQLKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-39RIRNKIKRGEVFHKLKSEKSRNKLKTRLKQKKEE
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MREPSRIRNKIKRGEVFHKLKSEKSRNKLKTRLKQKKEEASNPQLKKERLEQNVPQTLETLREEDETLVEQDEEVYADEFSSYFKDGLPPKILVTTNRRPSASVYEFAEQFVSIFPDAEFVKRGSQFEIKKIVEIAIERSYTDLVVINEDRKKPNAITLIHLPDGPTAHFKLTSVKLPKFIRGHGKADDYKPELILNNFNTRLGHTIGRMFASMFPHVPEFVGRQVATLHNQRDFIFFRRHRYIFRNGERCDIQELGPRFTLKLMSLQKGTFDTKFGEYEWLHKPELDTSRRKFHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.8
4 0.77
5 0.76
6 0.69
7 0.67
8 0.69
9 0.72
10 0.71
11 0.72
12 0.77
13 0.77
14 0.84
15 0.88
16 0.88
17 0.87
18 0.89
19 0.91
20 0.89
21 0.9
22 0.89
23 0.89
24 0.88
25 0.87
26 0.85
27 0.85
28 0.85
29 0.78
30 0.76
31 0.73
32 0.65
33 0.59
34 0.59
35 0.58
36 0.54
37 0.6
38 0.58
39 0.6
40 0.66
41 0.62
42 0.53
43 0.45
44 0.39
45 0.35
46 0.3
47 0.22
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.14
73 0.17
74 0.21
75 0.24
76 0.23
77 0.22
78 0.27
79 0.28
80 0.28
81 0.33
82 0.38
83 0.43
84 0.46
85 0.45
86 0.42
87 0.43
88 0.47
89 0.42
90 0.35
91 0.3
92 0.28
93 0.28
94 0.27
95 0.25
96 0.15
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.13
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.23
113 0.24
114 0.26
115 0.34
116 0.3
117 0.28
118 0.28
119 0.25
120 0.2
121 0.19
122 0.18
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.06
132 0.09
133 0.09
134 0.12
135 0.15
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.2
140 0.17
141 0.21
142 0.24
143 0.22
144 0.23
145 0.27
146 0.28
147 0.27
148 0.27
149 0.23
150 0.18
151 0.17
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.14
159 0.16
160 0.22
161 0.26
162 0.26
163 0.33
164 0.34
165 0.4
166 0.37
167 0.39
168 0.42
169 0.41
170 0.44
171 0.39
172 0.44
173 0.42
174 0.42
175 0.43
176 0.36
177 0.32
178 0.29
179 0.27
180 0.23
181 0.2
182 0.23
183 0.2
184 0.23
185 0.23
186 0.23
187 0.22
188 0.21
189 0.23
190 0.2
191 0.18
192 0.14
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.16
213 0.18
214 0.22
215 0.26
216 0.28
217 0.26
218 0.28
219 0.28
220 0.31
221 0.32
222 0.32
223 0.36
224 0.36
225 0.42
226 0.49
227 0.5
228 0.52
229 0.54
230 0.6
231 0.6
232 0.67
233 0.68
234 0.61
235 0.66
236 0.61
237 0.58
238 0.52
239 0.43
240 0.34
241 0.33
242 0.34
243 0.31
244 0.32
245 0.3
246 0.26
247 0.26
248 0.26
249 0.19
250 0.25
251 0.28
252 0.3
253 0.32
254 0.32
255 0.33
256 0.35
257 0.39
258 0.3
259 0.26
260 0.25
261 0.25
262 0.26
263 0.24
264 0.27
265 0.23
266 0.28
267 0.34
268 0.34
269 0.33
270 0.33
271 0.33
272 0.34
273 0.43
274 0.45
275 0.47
276 0.49