FuNGI

F4NTM5

Protein Details

Accession

F4NTM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
211-236	LGFRSRSRSRSKSRSRSRSRSPIYKH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
214-257	RSRSRSRSKSRSRSRSRSPIYKHSRSRSFSRSPSPRRRARSPPP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0016607 C:nuclear speck GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MYSSEATARARAAASATTDAPSSLSLKSPCLVNGKNNLKGKLPSKVYVGHLPYNVAKRELDDLFVTYGKILSIEIKHGGYAFVQYGLLSVMCLASLFSVPFHMKTQKDADEAVLALNNHSFDGRRLLVEFSNKRDSVGNSCLLCGNEGHWARDCPDNKERGADVKSGKCFKCGSFGHLARFCRGPDTGSMVGVPVTVRDQGYPSKSSYRHLGFRSRSRSRSKSRSRSRSRSPIYKHSRSRSFSRSPSPRRRARSPPPLSHPVSRHHRDDPRYDGPRNHYSPLSRCAPHPNSTTPSSIVNVKRVSGNAGHGIGGMIGSVNEHMYDEQDDYRYMERPSDWPYFRGGYNRYDDGYYPYQSDHRDYSPEYHRDNRYLDERDTKGRHHHADYIEYYDARDRRTSPSPRSYDRYMAEVNDKHAGYGAPSGDNGAAIAESPLVNPRLADSRHIPNSRVQEGIKHDDPRLVLHDPRLKDAISPHDIRPHDPRHYDPRLHDARTHDPRLYGARDLDRSATHTADIRTADPRLYHEHKNVSESTLEVRSRIR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.19
4	0.18
5	0.18
6	0.17
7	0.16
8	0.15
9	0.14
10	0.13
11	0.17
12	0.18
13	0.2
14	0.21
15	0.22
16	0.25
17	0.31
18	0.33
19	0.34
20	0.43
21	0.49
22	0.56
23	0.61
24	0.59
25	0.56
26	0.6
27	0.58
28	0.57
29	0.54
30	0.49
31	0.46
32	0.49
33	0.49
34	0.5
35	0.5
36	0.46
37	0.41
38	0.42
39	0.43
40	0.45
41	0.42
42	0.36
43	0.31
44	0.28
45	0.33
46	0.3
47	0.27
48	0.22
49	0.21
50	0.21
51	0.21
52	0.19
53	0.14
54	0.13
55	0.11
56	0.1
57	0.09
58	0.11
59	0.12
60	0.15
61	0.17
62	0.17
63	0.18
64	0.18
65	0.18
66	0.14
67	0.14
68	0.12
69	0.1
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.08
75	0.06
76	0.06
77	0.05
78	0.04
79	0.05
80	0.04
81	0.04
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.09
86	0.11
87	0.13
88	0.17
89	0.22
90	0.22
91	0.27
92	0.33
93	0.34
94	0.34
95	0.33
96	0.3
97	0.26
98	0.25
99	0.21
100	0.17
101	0.13
102	0.11
103	0.12
104	0.11
105	0.09
106	0.1
107	0.1
108	0.09
109	0.14
110	0.15
111	0.15
112	0.16
113	0.18
114	0.2
115	0.29
116	0.31
117	0.32
118	0.39
119	0.37
120	0.37
121	0.38
122	0.38
123	0.35
124	0.36
125	0.35
126	0.27
127	0.28
128	0.29
129	0.26
130	0.24
131	0.18
132	0.14
133	0.18
134	0.19
135	0.2
136	0.2
137	0.21
138	0.22
139	0.3
140	0.31
141	0.3
142	0.35
143	0.38
144	0.36
145	0.39
146	0.38
147	0.36
148	0.37
149	0.35
150	0.33
151	0.35
152	0.4
153	0.45
154	0.44
155	0.41
156	0.4
157	0.35
158	0.39
159	0.34
160	0.33
161	0.35
162	0.38
163	0.42
164	0.45
165	0.46
166	0.39
167	0.4
168	0.35
169	0.27
170	0.25
171	0.19
172	0.15
173	0.21
174	0.19
175	0.18
176	0.17
177	0.15
178	0.14
179	0.13
180	0.11
181	0.05
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.08
186	0.1
187	0.13
188	0.17
189	0.18
190	0.19
191	0.25
192	0.25
193	0.27
194	0.32
195	0.33
196	0.35
197	0.37
198	0.44
199	0.43
200	0.5
201	0.58
202	0.57
203	0.59
204	0.62
205	0.67
206	0.67
207	0.72
208	0.74
209	0.76
210	0.8
211	0.84
212	0.86
213	0.87
214	0.87
215	0.87
216	0.83
217	0.81
218	0.76
219	0.76
220	0.75
221	0.76
222	0.74
223	0.72
224	0.73
225	0.68
226	0.68
227	0.65
228	0.62
229	0.58
230	0.6
231	0.62
232	0.64
233	0.71
234	0.74
235	0.74
236	0.74
237	0.76
238	0.76
239	0.76
240	0.77
241	0.74
242	0.72
243	0.71
244	0.72
245	0.68
246	0.63
247	0.56
248	0.53
249	0.54
250	0.51
251	0.48
252	0.47
253	0.5
254	0.49
255	0.5
256	0.5
257	0.5
258	0.51
259	0.5
260	0.46
261	0.46
262	0.51
263	0.49
264	0.43
265	0.36
266	0.34
267	0.35
268	0.36
269	0.34
270	0.27
271	0.26
272	0.33
273	0.35
274	0.37
275	0.37
276	0.36
277	0.35
278	0.37
279	0.37
280	0.29
281	0.26
282	0.22
283	0.25
284	0.23
285	0.24
286	0.22
287	0.21
288	0.21
289	0.21
290	0.21
291	0.16
292	0.17
293	0.14
294	0.14
295	0.13
296	0.12
297	0.11
298	0.09
299	0.07
300	0.05
301	0.03
302	0.02
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.16
322	0.21
323	0.27
324	0.27
325	0.25
326	0.28
327	0.28
328	0.28
329	0.31
330	0.28
331	0.25
332	0.28
333	0.29
334	0.27
335	0.26
336	0.25
337	0.25
338	0.26
339	0.23
340	0.19
341	0.19
342	0.21
343	0.22
344	0.24
345	0.22
346	0.2
347	0.22
348	0.22
349	0.28
350	0.33
351	0.37
352	0.38
353	0.43
354	0.44
355	0.45
356	0.46
357	0.43
358	0.42
359	0.4
360	0.39
361	0.39
362	0.39
363	0.43
364	0.43
365	0.42
366	0.43
367	0.46
368	0.48
369	0.44
370	0.48
371	0.42
372	0.45
373	0.43
374	0.4
375	0.34
376	0.29
377	0.27
378	0.26
379	0.26
380	0.23
381	0.24
382	0.21
383	0.26
384	0.35
385	0.42
386	0.45
387	0.53
388	0.57
389	0.6
390	0.64
391	0.62
392	0.6
393	0.53
394	0.5
395	0.42
396	0.38
397	0.4
398	0.35
399	0.34
400	0.32
401	0.31
402	0.26
403	0.25
404	0.23
405	0.16
406	0.18
407	0.17
408	0.12
409	0.12
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.07
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.1
425	0.12
426	0.18
427	0.19
428	0.23
429	0.25
430	0.33
431	0.42
432	0.44
433	0.44
434	0.43
435	0.49
436	0.48
437	0.46
438	0.37
439	0.35
440	0.39
441	0.45
442	0.45
443	0.41
444	0.4
445	0.39
446	0.4
447	0.36
448	0.35
449	0.31
450	0.27
451	0.32
452	0.39
453	0.37
454	0.4
455	0.39
456	0.35
457	0.33
458	0.35
459	0.35
460	0.35
461	0.37
462	0.36
463	0.42
464	0.43
465	0.44
466	0.49
467	0.48
468	0.49
469	0.5
470	0.54
471	0.56
472	0.63
473	0.66
474	0.6
475	0.63
476	0.62
477	0.61
478	0.59
479	0.55
480	0.58
481	0.61
482	0.62
483	0.54
484	0.47
485	0.48
486	0.5
487	0.47
488	0.4
489	0.37
490	0.39
491	0.39
492	0.4
493	0.39
494	0.34
495	0.34
496	0.33
497	0.29
498	0.24
499	0.25
500	0.25
501	0.26
502	0.27
503	0.25
504	0.26
505	0.27
506	0.27
507	0.24
508	0.27
509	0.31
510	0.35
511	0.4
512	0.44
513	0.51
514	0.51
515	0.55
516	0.53
517	0.47
518	0.42
519	0.36
520	0.34
521	0.32
522	0.3

F4NTM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer