Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NTM4

Protein Details
Accession F4NTM4    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-192TLYYPVPQKRKYKKAVTKKPPQSVKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-185KRKYKKAVTKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001578  Peptidase_C12_UCH  
IPR036959  Peptidase_C12_UCH_sf  
IPR041507  UCH_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01088  Peptidase_C12  
PF18031  UCH_C  
Amino Acid Sequences MSAPVVPPNQYDVNMDNPLQGSPWADIESHPGVFTELASQIGIKGVEIAEIFSLDAEYLKAFEPIYGLIFLFEWHAEDTEQSKIAADIKSIPEKIFFINQVVPDACATQALLSIALNSATIELDSSLVEFKQFCLELSPAMRGLALSGFQRLRVSHNSFARQTDISTLYYPVPQKRKYKKAVTKKPPQSVKGNLARVPVSISTDTSQKSSTGTTLKSRKAQQRKNMTSKTCDSNLEKSQTTCNDKSAQPKYHFIGYVPIDDAVWELDGLKRMPKKLGNIPKNGDSWISIAISIIQKRMNSYSVEFNLLALIEDRVQMYEKKKRLISTARECILKCEASEASPTSDFAVFLKEAELSVEDYAVLKSKLNVSTALEILDKSDRAIDCRIKEEAEKRQEYKDENIRRRFNYAPFIRKWFEIMIRNGSLASHIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.2
8 0.16
9 0.14
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.19
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.13
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.08
31 0.09
32 0.08
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.05
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.16
75 0.2
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.25
81 0.26
82 0.25
83 0.22
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.23
88 0.22
89 0.21
90 0.17
91 0.17
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.09
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.17
140 0.24
141 0.29
142 0.31
143 0.36
144 0.4
145 0.4
146 0.41
147 0.39
148 0.32
149 0.27
150 0.24
151 0.21
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.18
157 0.21
158 0.24
159 0.29
160 0.34
161 0.44
162 0.51
163 0.6
164 0.65
165 0.73
166 0.76
167 0.8
168 0.85
169 0.85
170 0.87
171 0.86
172 0.86
173 0.82
174 0.77
175 0.72
176 0.66
177 0.65
178 0.62
179 0.57
180 0.5
181 0.45
182 0.41
183 0.34
184 0.3
185 0.22
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.2
201 0.26
202 0.29
203 0.33
204 0.4
205 0.47
206 0.54
207 0.6
208 0.62
209 0.67
210 0.73
211 0.77
212 0.77
213 0.71
214 0.65
215 0.62
216 0.57
217 0.48
218 0.43
219 0.37
220 0.36
221 0.38
222 0.36
223 0.33
224 0.3
225 0.32
226 0.33
227 0.37
228 0.31
229 0.3
230 0.3
231 0.32
232 0.4
233 0.43
234 0.45
235 0.41
236 0.44
237 0.44
238 0.43
239 0.41
240 0.33
241 0.31
242 0.25
243 0.24
244 0.2
245 0.18
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.07
250 0.06
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.08
255 0.08
256 0.12
257 0.15
258 0.16
259 0.21
260 0.24
261 0.28
262 0.36
263 0.47
264 0.49
265 0.54
266 0.56
267 0.56
268 0.53
269 0.49
270 0.39
271 0.3
272 0.24
273 0.18
274 0.15
275 0.11
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.17
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.24
289 0.23
290 0.26
291 0.24
292 0.22
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.1
297 0.09
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.13
304 0.19
305 0.27
306 0.31
307 0.37
308 0.4
309 0.41
310 0.48
311 0.53
312 0.56
313 0.58
314 0.62
315 0.59
316 0.6
317 0.58
318 0.53
319 0.49
320 0.4
321 0.29
322 0.25
323 0.22
324 0.2
325 0.23
326 0.2
327 0.2
328 0.19
329 0.2
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.14
334 0.16
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.17
353 0.19
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.25
358 0.25
359 0.25
360 0.2
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.16
365 0.13
366 0.18
367 0.17
368 0.2
369 0.28
370 0.32
371 0.31
372 0.35
373 0.37
374 0.34
375 0.4
376 0.44
377 0.47
378 0.51
379 0.55
380 0.54
381 0.59
382 0.62
383 0.6
384 0.61
385 0.62
386 0.63
387 0.65
388 0.72
389 0.74
390 0.71
391 0.72
392 0.69
393 0.65
394 0.65
395 0.64
396 0.63
397 0.6
398 0.65
399 0.62
400 0.57
401 0.54
402 0.49
403 0.47
404 0.46
405 0.46
406 0.46
407 0.44
408 0.44
409 0.4
410 0.35