Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PA36

Protein Details
Accession F4PA36    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
210-271SKDRYRHSRARSPVDRRRRSRSRSPIDRHRFDRDDSHSKRDHDRSRHRSHSRSPRRSHDDHYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-265RSVSPPPRRRSRESSREPSSSRRFSKDRYRHSRARSPVDRRRRSRSRSPIDRHRFDRDDSHSKRDHDRSRHRSHSRSPRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MNIHNILYLNIMSSRYFKSLYEKKTYHEVIDEIYYNVSSLEPFFKGTNATSAFCLLYKLFTLKLTEKQLEGLLDHPDSPHIRALGFLYLRYAGQPSQIWDWFEPYLDDTEELPVRGGPHPKTMTIGTFCKALLTEQKWFETMLPRIPIPIAREIEQKLKDRENSKTGPPADVERMSRDNDRTVSRRSVSPPPRRRSRESSREPSSSRRFSKDRYRHSRARSPVDRRRRSRSRSPIDRHRFDRDDSHSKRDHDRSRHRSHSRSPRRSHDDHYSDTFGSSREKSPHQDSRSSAQERLAALKDRYGDSSDSIKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.29
6 0.37
7 0.42
8 0.49
9 0.47
10 0.48
11 0.56
12 0.58
13 0.5
14 0.44
15 0.38
16 0.31
17 0.33
18 0.31
19 0.22
20 0.2
21 0.18
22 0.14
23 0.14
24 0.11
25 0.08
26 0.08
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.21
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.19
41 0.2
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.18
49 0.2
50 0.26
51 0.32
52 0.32
53 0.3
54 0.31
55 0.31
56 0.27
57 0.24
58 0.2
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.14
83 0.17
84 0.19
85 0.21
86 0.19
87 0.22
88 0.19
89 0.18
90 0.16
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.12
95 0.09
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.18
104 0.17
105 0.24
106 0.25
107 0.25
108 0.26
109 0.25
110 0.25
111 0.24
112 0.24
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.12
119 0.15
120 0.16
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.18
135 0.15
136 0.19
137 0.17
138 0.16
139 0.2
140 0.21
141 0.27
142 0.29
143 0.31
144 0.29
145 0.31
146 0.34
147 0.34
148 0.37
149 0.37
150 0.35
151 0.34
152 0.37
153 0.34
154 0.31
155 0.29
156 0.27
157 0.25
158 0.24
159 0.23
160 0.2
161 0.21
162 0.22
163 0.24
164 0.23
165 0.22
166 0.22
167 0.26
168 0.26
169 0.28
170 0.3
171 0.29
172 0.31
173 0.33
174 0.4
175 0.46
176 0.54
177 0.6
178 0.63
179 0.72
180 0.75
181 0.78
182 0.77
183 0.77
184 0.77
185 0.77
186 0.78
187 0.74
188 0.73
189 0.69
190 0.68
191 0.66
192 0.64
193 0.58
194 0.56
195 0.53
196 0.54
197 0.62
198 0.63
199 0.66
200 0.67
201 0.72
202 0.73
203 0.77
204 0.8
205 0.76
206 0.77
207 0.75
208 0.75
209 0.77
210 0.8
211 0.83
212 0.8
213 0.83
214 0.83
215 0.81
216 0.82
217 0.83
218 0.83
219 0.83
220 0.86
221 0.87
222 0.87
223 0.87
224 0.81
225 0.79
226 0.72
227 0.64
228 0.63
229 0.6
230 0.61
231 0.58
232 0.6
233 0.56
234 0.57
235 0.63
236 0.64
237 0.65
238 0.65
239 0.72
240 0.74
241 0.78
242 0.85
243 0.85
244 0.82
245 0.83
246 0.84
247 0.85
248 0.85
249 0.83
250 0.83
251 0.83
252 0.81
253 0.77
254 0.76
255 0.71
256 0.66
257 0.64
258 0.58
259 0.49
260 0.45
261 0.39
262 0.3
263 0.28
264 0.26
265 0.26
266 0.27
267 0.31
268 0.37
269 0.45
270 0.54
271 0.54
272 0.58
273 0.57
274 0.58
275 0.63
276 0.61
277 0.54
278 0.47
279 0.46
280 0.41
281 0.42
282 0.4
283 0.37
284 0.34
285 0.35
286 0.35
287 0.33
288 0.34
289 0.31
290 0.28
291 0.25
292 0.34