Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3MDL7

Protein Details
Accession A0A6J3MDL7    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-166GGRPKGRGRGGKSSKRKRSDDEBasic
199-223PMSPPTATKRKRPFRQRNPENAVCKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-162AVRGRGRGGRPKGRGRGGKSSKRKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15502  PHD_Phf1p_Phf2p_like  
Amino Acid Sequences MDVRYSHSFDQVPESSSSLSDAPSHDALTEGFQSRATSLDSSHHSGINTTRNLQSTNSPQNFNAAQGAQTTSHGWDTSIFPAAQQKSTASSTSTPSHVPSQIISATPRRSSTKTTIDSANFSNTKGVAKADEDASRSAVRGRGRGGRPKGRGRGGKSSKRKRSDDEDGDSDSSEVITPVTTVTKSGRSILKPSSFVPPPMSPPTATKRKRPFRQRNPENAVCKTCLRGSSPASNMIVFCDGCNSPYHRYCHKPPIDQAVVDEVDKEWFCRNCRVDVVVPDPVPVPVQVSIPDIDPAGLVSVEGATLEQRQRYFSTLPSDVLVSLLTRATTIQPDLPLFTREFKASADPRISPSADQRLIADQISQQPPIASPPLQSSTNAAKPSSHGGDPVDYESDSKEDELSGDGSRTHPANYPLPGQGLMSTLKDRQNFQWLVDPDDAKNGVYTHVYRAPHNGKMYPATPPVRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.24
4 0.25
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.16
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.2
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.14
25 0.14
26 0.19
27 0.23
28 0.28
29 0.29
30 0.3
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.35
35 0.33
36 0.31
37 0.33
38 0.33
39 0.35
40 0.34
41 0.36
42 0.37
43 0.45
44 0.46
45 0.45
46 0.43
47 0.47
48 0.45
49 0.4
50 0.34
51 0.24
52 0.2
53 0.19
54 0.21
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.17
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.24
69 0.26
70 0.26
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.25
75 0.25
76 0.2
77 0.2
78 0.23
79 0.25
80 0.26
81 0.23
82 0.24
83 0.27
84 0.26
85 0.25
86 0.21
87 0.22
88 0.21
89 0.22
90 0.22
91 0.24
92 0.26
93 0.27
94 0.3
95 0.32
96 0.33
97 0.38
98 0.42
99 0.45
100 0.45
101 0.46
102 0.48
103 0.45
104 0.45
105 0.41
106 0.41
107 0.32
108 0.29
109 0.27
110 0.22
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.22
129 0.28
130 0.34
131 0.43
132 0.49
133 0.54
134 0.6
135 0.66
136 0.7
137 0.69
138 0.7
139 0.67
140 0.7
141 0.7
142 0.73
143 0.75
144 0.79
145 0.8
146 0.82
147 0.8
148 0.75
149 0.74
150 0.74
151 0.7
152 0.65
153 0.59
154 0.53
155 0.49
156 0.43
157 0.35
158 0.24
159 0.17
160 0.11
161 0.08
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.06
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.12
171 0.12
172 0.16
173 0.2
174 0.21
175 0.25
176 0.29
177 0.31
178 0.3
179 0.3
180 0.33
181 0.29
182 0.29
183 0.3
184 0.25
185 0.26
186 0.28
187 0.28
188 0.23
189 0.26
190 0.32
191 0.38
192 0.4
193 0.45
194 0.51
195 0.6
196 0.68
197 0.76
198 0.8
199 0.81
200 0.89
201 0.89
202 0.89
203 0.88
204 0.86
205 0.79
206 0.71
207 0.62
208 0.53
209 0.44
210 0.35
211 0.28
212 0.23
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.25
217 0.26
218 0.27
219 0.26
220 0.24
221 0.22
222 0.18
223 0.17
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.16
232 0.21
233 0.25
234 0.27
235 0.33
236 0.38
237 0.46
238 0.48
239 0.49
240 0.47
241 0.52
242 0.49
243 0.43
244 0.38
245 0.32
246 0.27
247 0.23
248 0.2
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.16
256 0.24
257 0.25
258 0.26
259 0.27
260 0.3
261 0.28
262 0.28
263 0.3
264 0.27
265 0.25
266 0.23
267 0.22
268 0.19
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.07
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.15
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.25
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.13
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.17
330 0.24
331 0.24
332 0.29
333 0.29
334 0.28
335 0.31
336 0.34
337 0.34
338 0.28
339 0.31
340 0.34
341 0.32
342 0.31
343 0.29
344 0.28
345 0.29
346 0.27
347 0.22
348 0.16
349 0.23
350 0.25
351 0.24
352 0.21
353 0.2
354 0.2
355 0.22
356 0.23
357 0.16
358 0.15
359 0.2
360 0.23
361 0.24
362 0.24
363 0.25
364 0.29
365 0.34
366 0.34
367 0.3
368 0.27
369 0.28
370 0.34
371 0.33
372 0.26
373 0.23
374 0.22
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.21
379 0.17
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.19
398 0.23
399 0.27
400 0.29
401 0.32
402 0.31
403 0.32
404 0.3
405 0.26
406 0.22
407 0.19
408 0.18
409 0.17
410 0.18
411 0.21
412 0.27
413 0.29
414 0.32
415 0.34
416 0.42
417 0.41
418 0.4
419 0.44
420 0.4
421 0.42
422 0.44
423 0.42
424 0.33
425 0.37
426 0.36
427 0.27
428 0.27
429 0.22
430 0.18
431 0.21
432 0.22
433 0.22
434 0.28
435 0.29
436 0.29
437 0.39
438 0.42
439 0.45
440 0.48
441 0.45
442 0.43
443 0.47
444 0.47
445 0.43
446 0.46