Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M2N4

Protein Details
Accession A0A6J3M2N4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
600-623QVQEIYKKTGKKRRVDYDTQAPPGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005607  BSD_dom  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
IPR013876  TFIIH_BTF_p62_N  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03909  BSD  
PF08567  PH_TFIIH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50858  BSD  
CDD cd13229  PH_TFIIH  
Amino Acid Sequences MQTATSNVAYKKKDGTLAVSEDGKYLFWTPSSPSGAPPAVTVPLADITNLQQTPATSPKALLKVLVQEESYTFSFTHVTNARKDQGDITGVLQDRIAALKASSAAALAAKVAVTPGNSVDDRMQPAAMAIAKAVASKANDESWYDDRKLLEDISLQKSLLDSDKALQDRLTQAIRDKPESVSIPQLTSLFWSARLHLLRAHAVESAQTQGEYNVLPEIKFVIKRAEKEGEPDTRQLNITKEQIKLIFKQYPVVAEAYNAHSPPMSAAEFWTRFFGSRLLKKLKGEKIMHYDNTDAILDKYLDRSDGGPASSAHVPHFIDLEGNEQNHSQQKGNRPDLDMRPSSIDKVPILRILNNLSKKMIAHVAPEGGEAHAPIGIDEEKFEELRLRDLALNDVDNRIRLNVRQQRTVSGDADGLSTDAKIYAQQNPQEVLSTVRAELQPPVLGADRAGILRLDTAIGFHSDDDDDDSDEEEHTEQQANGGASKVHKVANTRIGSKAALTSASTAVFSSIRQHAQSEALDTTSLGGLDQATFDTLTITHNTTTFFLHYFWTIFLSGDASRSTELAQIVSTLDRSIDRINAVAVAAEAARTAKIALIQKQVQEIYKKTGKKRRVDYDTQAPPGRKVVDVMIRPTVLAVARATSAYRTALEEQSKDIAAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.41
4 0.43
5 0.43
6 0.4
7 0.37
8 0.32
9 0.31
10 0.25
11 0.2
12 0.17
13 0.15
14 0.13
15 0.14
16 0.17
17 0.24
18 0.3
19 0.28
20 0.28
21 0.33
22 0.34
23 0.32
24 0.3
25 0.25
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.13
35 0.2
36 0.2
37 0.18
38 0.17
39 0.18
40 0.23
41 0.27
42 0.29
43 0.22
44 0.25
45 0.31
46 0.34
47 0.33
48 0.29
49 0.26
50 0.3
51 0.33
52 0.33
53 0.27
54 0.23
55 0.24
56 0.27
57 0.25
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.16
62 0.15
63 0.23
64 0.24
65 0.27
66 0.31
67 0.37
68 0.41
69 0.4
70 0.42
71 0.36
72 0.34
73 0.33
74 0.28
75 0.24
76 0.25
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.17
107 0.19
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.15
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.21
129 0.23
130 0.27
131 0.27
132 0.27
133 0.26
134 0.26
135 0.27
136 0.22
137 0.19
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.22
144 0.22
145 0.22
146 0.2
147 0.16
148 0.12
149 0.13
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.19
154 0.19
155 0.2
156 0.23
157 0.22
158 0.18
159 0.21
160 0.27
161 0.3
162 0.3
163 0.3
164 0.27
165 0.3
166 0.31
167 0.3
168 0.3
169 0.28
170 0.25
171 0.25
172 0.24
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.22
187 0.21
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.2
209 0.23
210 0.25
211 0.3
212 0.32
213 0.3
214 0.34
215 0.38
216 0.36
217 0.35
218 0.35
219 0.31
220 0.29
221 0.3
222 0.28
223 0.25
224 0.22
225 0.26
226 0.27
227 0.27
228 0.27
229 0.3
230 0.31
231 0.3
232 0.32
233 0.31
234 0.27
235 0.29
236 0.27
237 0.24
238 0.23
239 0.22
240 0.16
241 0.12
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.09
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.2
262 0.2
263 0.24
264 0.31
265 0.35
266 0.37
267 0.4
268 0.47
269 0.48
270 0.51
271 0.49
272 0.46
273 0.48
274 0.5
275 0.48
276 0.41
277 0.36
278 0.27
279 0.26
280 0.21
281 0.15
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.12
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.15
314 0.16
315 0.15
316 0.18
317 0.26
318 0.35
319 0.39
320 0.39
321 0.38
322 0.42
323 0.44
324 0.45
325 0.37
326 0.29
327 0.28
328 0.27
329 0.27
330 0.23
331 0.2
332 0.15
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.16
338 0.16
339 0.19
340 0.25
341 0.24
342 0.24
343 0.21
344 0.21
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.14
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.16
378 0.13
379 0.14
380 0.12
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.21
389 0.27
390 0.3
391 0.36
392 0.37
393 0.4
394 0.43
395 0.45
396 0.36
397 0.28
398 0.26
399 0.19
400 0.19
401 0.15
402 0.11
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.07
409 0.08
410 0.15
411 0.19
412 0.22
413 0.24
414 0.25
415 0.25
416 0.24
417 0.22
418 0.18
419 0.16
420 0.15
421 0.13
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.15
426 0.14
427 0.12
428 0.11
429 0.13
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.09
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.14
472 0.16
473 0.14
474 0.16
475 0.19
476 0.25
477 0.33
478 0.35
479 0.35
480 0.35
481 0.35
482 0.33
483 0.3
484 0.26
485 0.17
486 0.15
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.13
497 0.16
498 0.18
499 0.18
500 0.19
501 0.19
502 0.23
503 0.23
504 0.21
505 0.18
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.14
510 0.1
511 0.1
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.08
524 0.1
525 0.12
526 0.12
527 0.13
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.14
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.12
553 0.12
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.11
562 0.13
563 0.14
564 0.14
565 0.14
566 0.15
567 0.14
568 0.14
569 0.11
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.12
581 0.18
582 0.23
583 0.31
584 0.34
585 0.36
586 0.4
587 0.42
588 0.41
589 0.42
590 0.39
591 0.4
592 0.44
593 0.5
594 0.55
595 0.62
596 0.67
597 0.7
598 0.77
599 0.8
600 0.81
601 0.83
602 0.81
603 0.82
604 0.81
605 0.79
606 0.75
607 0.66
608 0.59
609 0.56
610 0.5
611 0.4
612 0.33
613 0.32
614 0.35
615 0.37
616 0.39
617 0.38
618 0.36
619 0.35
620 0.33
621 0.29
622 0.21
623 0.19
624 0.15
625 0.12
626 0.13
627 0.14
628 0.15
629 0.14
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.18
634 0.22
635 0.28
636 0.32
637 0.32
638 0.33
639 0.35