FuNGI

A0A6J3LSC2

Protein Details

Accession

A0A6J3LSC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
495-517	RDETSRERADRKRQELKREIGEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
501-535	ERADRKRQELKREIGEGEGARQKAAGAVKKKIRKF

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSSPRRAEWSFFSLKQAREEATSQLPRLLVKTTFENGYEILLSDGCRVWREALSNDKIESRAREIRCAIEPSDPENREALFDLIRKSLSDSQDQKKDAKLGFSADEDGEEFGLRMSAPLVPPLPDLTWVVYLKLLPPSAISTYLLDPLLLYASEVRAQVDLLMTELAAKDHVLERICDRLEASGDSLTAVFPAKAGLRLNRNKSQRLQLGPHVPGLGTFDIASWSERWPKALQESAVDSSARKAEVLQNLPDMNTSQSTQDTSKWWQHIGNSNLGQEGLATAVSQTREQTVKSISASSAPVSHERPHLQRGNLQQPNALDESTNDEGLPGIVRNNPVPSRNPESSEQSSRPPVKKLGAVGGRSRTLALTVPNQTDGRSDIASPNVESDPVVKPKRLGAIGGRKKAVEEVPGPSNEVPATQPTSQLTSPPPKKARLGTIGGRAKHSAPLDVQQSTPKPTHNVDPPPSTASSVKLENHDEETMRGRQISEVPSSRARDETSRERADRKRQELKREIGEGEGARQKAAGAVKKKIRKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.48
4	0.42
5	0.39
6	0.39
7	0.35
8	0.38
9	0.41
10	0.36
11	0.36
12	0.35
13	0.32
14	0.32
15	0.31
16	0.24
17	0.22
18	0.27
19	0.27
20	0.28
21	0.28
22	0.28
23	0.24
24	0.23
25	0.21
26	0.16
27	0.13
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.14
32	0.13
33	0.14
34	0.15
35	0.17
36	0.19
37	0.22
38	0.25
39	0.32
40	0.37
41	0.38
42	0.38
43	0.38
44	0.37
45	0.37
46	0.36
47	0.35
48	0.38
49	0.37
50	0.42
51	0.42
52	0.44
53	0.45
54	0.45
55	0.39
56	0.37
57	0.37
58	0.35
59	0.43
60	0.39
61	0.36
62	0.34
63	0.32
64	0.28
65	0.28
66	0.24
67	0.18
68	0.2
69	0.21
70	0.21
71	0.21
72	0.19
73	0.23
74	0.28
75	0.27
76	0.34
77	0.39
78	0.46
79	0.53
80	0.55
81	0.52
82	0.5
83	0.53
84	0.46
85	0.42
86	0.35
87	0.3
88	0.3
89	0.29
90	0.27
91	0.21
92	0.2
93	0.16
94	0.15
95	0.12
96	0.1
97	0.08
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.05
102	0.05
103	0.07
104	0.08
105	0.1
106	0.11
107	0.12
108	0.13
109	0.15
110	0.14
111	0.14
112	0.14
113	0.14
114	0.17
115	0.17
116	0.17
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.18
121	0.16
122	0.12
123	0.12
124	0.14
125	0.15
126	0.16
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.16
131	0.15
132	0.13
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.07
137	0.07
138	0.05
139	0.06
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.06
149	0.06
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.07
158	0.1
159	0.11
160	0.12
161	0.13
162	0.18
163	0.18
164	0.17
165	0.16
166	0.14
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.09
182	0.11
183	0.14
184	0.23
185	0.31
186	0.38
187	0.44
188	0.49
189	0.51
190	0.53
191	0.57
192	0.54
193	0.52
194	0.49
195	0.48
196	0.49
197	0.45
198	0.42
199	0.34
200	0.28
201	0.23
202	0.22
203	0.16
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.07
211	0.09
212	0.15
213	0.15
214	0.18
215	0.18
216	0.19
217	0.22
218	0.24
219	0.22
220	0.18
221	0.21
222	0.2
223	0.2
224	0.18
225	0.15
226	0.13
227	0.14
228	0.12
229	0.09
230	0.09
231	0.12
232	0.18
233	0.2
234	0.2
235	0.21
236	0.21
237	0.21
238	0.2
239	0.16
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.14
249	0.17
250	0.21
251	0.21
252	0.22
253	0.21
254	0.23
255	0.3
256	0.29
257	0.3
258	0.27
259	0.26
260	0.25
261	0.23
262	0.2
263	0.12
264	0.1
265	0.05
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.05
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.13
280	0.14
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.14
288	0.15
289	0.17
290	0.19
291	0.22
292	0.24
293	0.29
294	0.33
295	0.31
296	0.34
297	0.39
298	0.46
299	0.45
300	0.43
301	0.38
302	0.33
303	0.35
304	0.31
305	0.24
306	0.13
307	0.11
308	0.17
309	0.16
310	0.16
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.09
320	0.1
321	0.14
322	0.16
323	0.18
324	0.21
325	0.26
326	0.32
327	0.32
328	0.35
329	0.34
330	0.4
331	0.42
332	0.45
333	0.41
334	0.37
335	0.43
336	0.47
337	0.46
338	0.42
339	0.4
340	0.37
341	0.38
342	0.36
343	0.36
344	0.35
345	0.35
346	0.36
347	0.36
348	0.34
349	0.31
350	0.3
351	0.22
352	0.17
353	0.16
354	0.14
355	0.16
356	0.19
357	0.19
358	0.22
359	0.22
360	0.22
361	0.21
362	0.2
363	0.17
364	0.15
365	0.15
366	0.13
367	0.16
368	0.17
369	0.16
370	0.17
371	0.15
372	0.14
373	0.13
374	0.14
375	0.17
376	0.24
377	0.26
378	0.24
379	0.25
380	0.28
381	0.33
382	0.31
383	0.28
384	0.29
385	0.38
386	0.46
387	0.5
388	0.48
389	0.43
390	0.43
391	0.44
392	0.37
393	0.3
394	0.24
395	0.23
396	0.26
397	0.27
398	0.29
399	0.25
400	0.25
401	0.2
402	0.18
403	0.15
404	0.14
405	0.19
406	0.16
407	0.19
408	0.19
409	0.23
410	0.22
411	0.24
412	0.27
413	0.33
414	0.38
415	0.45
416	0.49
417	0.49
418	0.55
419	0.56
420	0.58
421	0.54
422	0.55
423	0.51
424	0.56
425	0.58
426	0.54
427	0.52
428	0.46
429	0.4
430	0.39
431	0.35
432	0.28
433	0.23
434	0.27
435	0.29
436	0.29
437	0.29
438	0.3
439	0.32
440	0.33
441	0.33
442	0.31
443	0.31
444	0.32
445	0.39
446	0.41
447	0.48
448	0.49
449	0.52
450	0.52
451	0.51
452	0.49
453	0.45
454	0.37
455	0.31
456	0.29
457	0.29
458	0.29
459	0.3
460	0.33
461	0.32
462	0.35
463	0.34
464	0.31
465	0.29
466	0.31
467	0.3
468	0.28
469	0.26
470	0.22
471	0.22
472	0.27
473	0.28
474	0.31
475	0.32
476	0.35
477	0.41
478	0.44
479	0.43
480	0.4
481	0.4
482	0.37
483	0.41
484	0.46
485	0.49
486	0.54
487	0.56
488	0.62
489	0.68
490	0.73
491	0.76
492	0.76
493	0.77
494	0.76
495	0.83
496	0.84
497	0.83
498	0.8
499	0.75
500	0.66
501	0.57
502	0.55
503	0.45
504	0.42
505	0.4
506	0.33
507	0.27
508	0.26
509	0.24
510	0.24
511	0.3
512	0.31
513	0.32
514	0.41
515	0.5

A0A6J3LSC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer