Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M6I7

Protein Details
Accession A0A6J3M6I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-189AFSKAKYMLRKHKKYLKRFTVLHydrophilic
394-421STWKSGKRGTYFKKRRRWERCRAIVDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-409KKRR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13, nucl 8.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSANRGEIRPDAYVFLRLPNETLKLVQIKLNSIIDAGKIGSFPASSLIGRPYYYTYEFLEKQSGESYSRLRIVSPAELNAEAGLDDADTIDDSTDADTTGASNGLPEGHDLTVTDAKTVSKDNRMTIDHAGRQVLTQADIEELKKSTDGKEIIEKILANHTGLDEKTAFSKAKYMLRKHKKYLKRFTVLPMDLSHLIDHLIDKEASRIMEIREEALGLITAWSNAHYSGLDGLSSEQALTATDRGKWLVVDDTGGLVVAALAERMDILHVPEREREIPISETTNVTDAAANGNTAESGEAAAGQEISDTPVKVHRDFPIPASTNTITLIHPAVQPNVSLLKYFGYDTSNPGSGTEELEHPLHNHLKPLSWLQLLHPEDDPTYQEPEIISESLLSTWKSGKRGTYFKKRRRWERCRAIVDSTRQEGTFDGLVIATHLELSAVFRHALPLIRGGGTIVVYSPTAEPLVRLMDFYSKERRAAYIAHLIKGEIPDAQDFPLDPRLLLGPHLQTSRVRNWQCLPGRTHPLMTSRGGAEGFVFTARRVIPLEGGVEARGNFSTKKRKVVGSDVEAVVIATTPEPGEPMVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.28
4 0.26
5 0.27
6 0.27
7 0.29
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.28
12 0.29
13 0.3
14 0.28
15 0.29
16 0.32
17 0.33
18 0.27
19 0.23
20 0.23
21 0.19
22 0.18
23 0.16
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.12
32 0.11
33 0.13
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.2
38 0.2
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.25
43 0.31
44 0.32
45 0.33
46 0.35
47 0.3
48 0.3
49 0.3
50 0.29
51 0.24
52 0.26
53 0.26
54 0.26
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.28
60 0.31
61 0.3
62 0.27
63 0.26
64 0.26
65 0.25
66 0.22
67 0.19
68 0.12
69 0.1
70 0.07
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.21
106 0.21
107 0.25
108 0.28
109 0.3
110 0.34
111 0.36
112 0.38
113 0.4
114 0.43
115 0.38
116 0.38
117 0.36
118 0.31
119 0.28
120 0.28
121 0.22
122 0.16
123 0.13
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.28
138 0.29
139 0.29
140 0.3
141 0.28
142 0.23
143 0.27
144 0.25
145 0.17
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.16
155 0.16
156 0.13
157 0.19
158 0.21
159 0.28
160 0.35
161 0.42
162 0.5
163 0.61
164 0.68
165 0.72
166 0.77
167 0.79
168 0.82
169 0.85
170 0.83
171 0.78
172 0.73
173 0.7
174 0.7
175 0.61
176 0.52
177 0.42
178 0.36
179 0.32
180 0.29
181 0.23
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.05
243 0.03
244 0.03
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.11
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.18
302 0.22
303 0.23
304 0.25
305 0.28
306 0.28
307 0.27
308 0.3
309 0.28
310 0.24
311 0.24
312 0.23
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.14
340 0.15
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.15
348 0.18
349 0.17
350 0.19
351 0.18
352 0.19
353 0.2
354 0.22
355 0.22
356 0.18
357 0.19
358 0.17
359 0.25
360 0.25
361 0.25
362 0.23
363 0.2
364 0.19
365 0.2
366 0.21
367 0.14
368 0.16
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.13
375 0.11
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.12
383 0.16
384 0.18
385 0.2
386 0.24
387 0.29
388 0.39
389 0.47
390 0.54
391 0.62
392 0.69
393 0.77
394 0.81
395 0.86
396 0.88
397 0.89
398 0.88
399 0.89
400 0.89
401 0.86
402 0.8
403 0.77
404 0.72
405 0.69
406 0.63
407 0.55
408 0.46
409 0.39
410 0.35
411 0.28
412 0.24
413 0.18
414 0.13
415 0.1
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.12
432 0.14
433 0.13
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.11
441 0.11
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.16
457 0.19
458 0.22
459 0.3
460 0.29
461 0.31
462 0.32
463 0.32
464 0.29
465 0.29
466 0.3
467 0.31
468 0.32
469 0.31
470 0.31
471 0.29
472 0.29
473 0.27
474 0.23
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.15
483 0.2
484 0.19
485 0.17
486 0.17
487 0.18
488 0.18
489 0.19
490 0.2
491 0.17
492 0.21
493 0.23
494 0.24
495 0.26
496 0.32
497 0.38
498 0.44
499 0.42
500 0.44
501 0.47
502 0.55
503 0.58
504 0.59
505 0.57
506 0.56
507 0.62
508 0.59
509 0.58
510 0.51
511 0.48
512 0.46
513 0.41
514 0.36
515 0.29
516 0.28
517 0.25
518 0.22
519 0.18
520 0.15
521 0.14
522 0.12
523 0.12
524 0.1
525 0.14
526 0.14
527 0.16
528 0.17
529 0.18
530 0.18
531 0.19
532 0.2
533 0.17
534 0.18
535 0.16
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.14
540 0.15
541 0.17
542 0.24
543 0.35
544 0.38
545 0.47
546 0.5
547 0.55
548 0.59
549 0.66
550 0.67
551 0.62
552 0.64
553 0.55
554 0.51
555 0.44
556 0.38
557 0.28
558 0.19
559 0.13
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.08