FuNGI

F4PD34

Protein Details

Accession

F4PD34

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-32	MQSLEQQSVQKKNKRGRRGGKKQHEPHPDTFV	Hydrophilic
89-116	DDDQNNPPRKKTRRSKRGKTAHFPEPDF	Basic
750-779	SDMTDEKKSLKQKKKNSKKAKIPNEIDDLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-23	KKNKRGRRGGKKQ
96-107	PRKKTRRSKRGK
756-771	KKSLKQKKKNSKKAKI

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR033133 PUM-HD IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0003723 F:RNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM PS50303 PUM_HD

Amino Acid Sequences

MQSLEQQSVQKKNKRGRRGGKKQHEPHPDTFVSSSTVSATHENAAFDHDTTCPTTKNSNESIPLLDIIIDPTGNADSLMDSNHKNDRSDDDQNNPPRKKTRRSKRGKTAHFPEPDFMPQQETVQAAASSEIKWSAASTDPSTLFNQTDTDQKDAIDPVDPDLRQYFENIEKMLEEQEFETPSDLHLFINNVYSEIRGKELLVSGDFATSRVLEKLLRGSSDVQVRLFLKSVNGCALKMFMHQFASHVMQTALGIAAGIVDREVRGESKQAVHDSNDEPVDEEFQALVNDLPSMETLLLSLCEELKTEWSNLLLDPYGSHVVQTLLNVLSGQTLADEIRMRSRKSSNYNKNHNNFSNAKQLGTTLLTPASFAKLQAFIVDSLSTNLKDTDLREMAFHPIANPVLQILLEIPQSSDSLIAAFLKDGSFFDSLLEHHVGSHLAEKLVSKASADTFKILYNQHIRPKFLALCNHQFANFIIQRTVSKVSTESQLVEMLDIVEPHFARMLFQSRAGIILKIVESCITFPNIQPRIMACLYKAFEVDEDEEKKKMFATLVLHLSTYDRFQQFVRLPNVQGALIIQHICSYSAHCSKPCLDSILSISKQDMLKWISDPISSRVIESILSSATIAVKFKRRLIRIFFGSFVDLSIDKYGSHFVDKCWAVASLDARQTIVEELAERLPTLLGNFHAKFIVRNCSVELFKRNRGEWMEKQRIEISRRDKVESERIKEAENSAAANASVDATPVCDDPKASDMTDEKKSLKQKKKNSKKAKIPNEIDDLFAKKLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.84
3	0.85
4	0.87
5	0.9
6	0.93
7	0.94
8	0.95
9	0.94
10	0.93
11	0.92
12	0.88
13	0.82
14	0.79
15	0.69
16	0.61
17	0.53
18	0.44
19	0.37
20	0.3
21	0.26
22	0.18
23	0.18
24	0.16
25	0.17
26	0.17
27	0.18
28	0.19
29	0.19
30	0.18
31	0.22
32	0.21
33	0.19
34	0.19
35	0.16
36	0.16
37	0.2
38	0.22
39	0.19
40	0.21
41	0.27
42	0.3
43	0.36
44	0.39
45	0.4
46	0.42
47	0.42
48	0.41
49	0.36
50	0.32
51	0.26
52	0.22
53	0.16
54	0.14
55	0.13
56	0.1
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.1
66	0.12
67	0.13
68	0.17
69	0.24
70	0.27
71	0.27
72	0.29
73	0.34
74	0.38
75	0.46
76	0.47
77	0.46
78	0.53
79	0.61
80	0.69
81	0.65
82	0.64
83	0.65
84	0.69
85	0.73
86	0.75
87	0.77
88	0.78
89	0.86
90	0.91
91	0.92
92	0.94
93	0.94
94	0.93
95	0.89
96	0.87
97	0.83
98	0.74
99	0.66
100	0.59
101	0.53
102	0.45
103	0.38
104	0.33
105	0.26
106	0.25
107	0.25
108	0.22
109	0.18
110	0.17
111	0.16
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.11
116	0.11
117	0.11
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.1
122	0.13
123	0.16
124	0.17
125	0.21
126	0.22
127	0.24
128	0.25
129	0.26
130	0.22
131	0.2
132	0.19
133	0.16
134	0.22
135	0.22
136	0.24
137	0.22
138	0.22
139	0.23
140	0.22
141	0.22
142	0.18
143	0.16
144	0.16
145	0.21
146	0.21
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.19
151	0.2
152	0.21
153	0.2
154	0.23
155	0.21
156	0.2
157	0.19
158	0.2
159	0.21
160	0.17
161	0.13
162	0.11
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.12
168	0.12
169	0.14
170	0.14
171	0.11
172	0.11
173	0.12
174	0.11
175	0.15
176	0.14
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.13
182	0.14
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.14
187	0.14
188	0.13
189	0.13
190	0.12
191	0.13
192	0.13
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.1
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.16
202	0.17
203	0.17
204	0.18
205	0.2
206	0.23
207	0.28
208	0.28
209	0.22
210	0.25
211	0.25
212	0.24
213	0.22
214	0.18
215	0.16
216	0.16
217	0.17
218	0.19
219	0.19
220	0.17
221	0.17
222	0.18
223	0.15
224	0.16
225	0.17
226	0.13
227	0.14
228	0.14
229	0.15
230	0.16
231	0.19
232	0.16
233	0.15
234	0.13
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.08
239	0.05
240	0.05
241	0.03
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.05
250	0.06
251	0.07
252	0.09
253	0.11
254	0.14
255	0.17
256	0.2
257	0.21
258	0.21
259	0.24
260	0.23
261	0.24
262	0.21
263	0.18
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.12
268	0.11
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.11
297	0.1
298	0.11
299	0.09
300	0.07
301	0.07
302	0.09
303	0.1
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.14
325	0.18
326	0.19
327	0.22
328	0.27
329	0.32
330	0.4
331	0.5
332	0.53
333	0.6
334	0.69
335	0.74
336	0.75
337	0.75
338	0.68
339	0.63
340	0.56
341	0.49
342	0.49
343	0.4
344	0.36
345	0.29
346	0.27
347	0.22
348	0.2
349	0.17
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.14
380	0.16
381	0.15
382	0.15
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.04
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.11
418	0.12
419	0.09
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.11
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.08
433	0.08
434	0.1
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.12
439	0.13
440	0.16
441	0.16
442	0.19
443	0.22
444	0.27
445	0.33
446	0.35
447	0.36
448	0.34
449	0.38
450	0.36
451	0.34
452	0.36
453	0.34
454	0.37
455	0.38
456	0.37
457	0.33
458	0.31
459	0.27
460	0.28
461	0.24
462	0.19
463	0.17
464	0.17
465	0.18
466	0.2
467	0.22
468	0.15
469	0.13
470	0.14
471	0.15
472	0.17
473	0.18
474	0.15
475	0.13
476	0.14
477	0.13
478	0.12
479	0.1
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.07
489	0.08
490	0.1
491	0.15
492	0.14
493	0.15
494	0.16
495	0.14
496	0.17
497	0.17
498	0.14
499	0.09
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.08
505	0.07
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.21
512	0.23
513	0.23
514	0.23
515	0.22
516	0.26
517	0.26
518	0.26
519	0.17
520	0.2
521	0.21
522	0.21
523	0.2
524	0.14
525	0.14
526	0.16
527	0.18
528	0.17
529	0.21
530	0.22
531	0.22
532	0.22
533	0.22
534	0.2
535	0.18
536	0.13
537	0.13
538	0.15
539	0.19
540	0.23
541	0.23
542	0.22
543	0.21
544	0.22
545	0.19
546	0.17
547	0.18
548	0.15
549	0.16
550	0.16
551	0.23
552	0.26
553	0.33
554	0.36
555	0.33
556	0.33
557	0.35
558	0.36
559	0.28
560	0.24
561	0.17
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.08
566	0.08
567	0.08
568	0.09
569	0.09
570	0.1
571	0.16
572	0.21
573	0.24
574	0.24
575	0.27
576	0.29
577	0.32
578	0.31
579	0.28
580	0.23
581	0.22
582	0.26
583	0.31
584	0.29
585	0.27
586	0.25
587	0.26
588	0.26
589	0.25
590	0.26
591	0.19
592	0.2
593	0.2
594	0.23
595	0.2
596	0.21
597	0.23
598	0.21
599	0.24
600	0.23
601	0.22
602	0.2
603	0.19
604	0.18
605	0.16
606	0.14
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.09
612	0.1
613	0.11
614	0.14
615	0.22
616	0.25
617	0.31
618	0.39
619	0.42
620	0.48
621	0.55
622	0.59
623	0.58
624	0.57
625	0.52
626	0.45
627	0.42
628	0.35
629	0.27
630	0.21
631	0.14
632	0.13
633	0.14
634	0.12
635	0.11
636	0.12
637	0.15
638	0.13
639	0.18
640	0.17
641	0.17
642	0.25
643	0.25
644	0.25
645	0.23
646	0.23
647	0.18
648	0.21
649	0.23
650	0.2
651	0.23
652	0.23
653	0.22
654	0.21
655	0.21
656	0.19
657	0.17
658	0.11
659	0.09
660	0.11
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.11
666	0.11
667	0.11
668	0.1
669	0.11
670	0.18
671	0.19
672	0.19
673	0.21
674	0.21
675	0.24
676	0.26
677	0.33
678	0.27
679	0.28
680	0.29
681	0.33
682	0.35
683	0.37
684	0.42
685	0.4
686	0.46
687	0.51
688	0.5
689	0.51
690	0.55
691	0.58
692	0.58
693	0.63
694	0.65
695	0.6
696	0.63
697	0.63
698	0.63
699	0.59
700	0.57
701	0.55
702	0.53
703	0.55
704	0.56
705	0.53
706	0.53
707	0.6
708	0.6
709	0.58
710	0.57
711	0.55
712	0.53
713	0.51
714	0.47
715	0.42
716	0.34
717	0.29
718	0.21
719	0.21
720	0.18
721	0.17
722	0.14
723	0.1
724	0.09
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.14
734	0.18
735	0.19
736	0.18
737	0.23
738	0.26
739	0.31
740	0.37
741	0.38
742	0.37
743	0.41
744	0.51
745	0.56
746	0.63
747	0.67
748	0.72
749	0.79
750	0.88
751	0.92
752	0.94
753	0.94
754	0.94
755	0.95
756	0.95
757	0.95
758	0.9
759	0.87
760	0.83
761	0.73
762	0.65
763	0.58
764	0.5

F4PD34

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer