Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M4M6

Protein Details
Accession A0A6J3M4M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-289IKKAEEVRLKKRRDRGRADDNGGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-280RLKKRRDR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSSSLKRKGSPTIDASEESSKRRFAEATEGAKSDNDNATESQKEPQSTDLEADETISTAGSSTAATTTTADPVTDRLARFAALRARNQASRKSNLHETKHEAKRASTDLSQLSSLNRKKEIAAHKLLKAEIEDGGEDFERKRAWDWTIEESERWDARKAEKANNRDKNAFADWSQEAEKIYSRQVGSLEKNGGMDERRSAYEAEKSAAIKRAVQSGGLELVETKNGELIAVDRDGTFYSTADQQTTFAGNSSKPSRAAVDRLVDDIKKAEEVRLKKRRDRGRADDNGGDITFINEKNKQFNLKLARFYNKYTADIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.46
4 0.44
5 0.4
6 0.38
7 0.36
8 0.34
9 0.35
10 0.32
11 0.26
12 0.33
13 0.37
14 0.4
15 0.41
16 0.4
17 0.38
18 0.38
19 0.36
20 0.3
21 0.26
22 0.21
23 0.19
24 0.2
25 0.24
26 0.26
27 0.26
28 0.27
29 0.27
30 0.28
31 0.26
32 0.29
33 0.28
34 0.26
35 0.27
36 0.22
37 0.19
38 0.18
39 0.18
40 0.14
41 0.11
42 0.1
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.2
68 0.24
69 0.25
70 0.28
71 0.32
72 0.35
73 0.4
74 0.43
75 0.47
76 0.45
77 0.48
78 0.49
79 0.48
80 0.54
81 0.57
82 0.59
83 0.55
84 0.57
85 0.6
86 0.63
87 0.63
88 0.54
89 0.47
90 0.46
91 0.44
92 0.4
93 0.31
94 0.28
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.2
99 0.19
100 0.24
101 0.26
102 0.26
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.32
107 0.38
108 0.37
109 0.42
110 0.43
111 0.43
112 0.45
113 0.44
114 0.37
115 0.3
116 0.24
117 0.16
118 0.12
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.17
132 0.2
133 0.23
134 0.27
135 0.27
136 0.26
137 0.25
138 0.26
139 0.23
140 0.21
141 0.18
142 0.15
143 0.17
144 0.25
145 0.27
146 0.32
147 0.38
148 0.44
149 0.52
150 0.58
151 0.59
152 0.53
153 0.51
154 0.46
155 0.42
156 0.35
157 0.25
158 0.21
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.18
173 0.19
174 0.22
175 0.22
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.17
189 0.18
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.19
194 0.23
195 0.22
196 0.2
197 0.2
198 0.24
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.16
203 0.17
204 0.14
205 0.13
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.09
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.17
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.25
243 0.27
244 0.3
245 0.3
246 0.31
247 0.3
248 0.32
249 0.33
250 0.29
251 0.26
252 0.24
253 0.2
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.24
258 0.31
259 0.42
260 0.49
261 0.56
262 0.6
263 0.69
264 0.75
265 0.78
266 0.8
267 0.79
268 0.81
269 0.82
270 0.81
271 0.75
272 0.66
273 0.58
274 0.48
275 0.39
276 0.28
277 0.21
278 0.19
279 0.17
280 0.2
281 0.22
282 0.24
283 0.3
284 0.35
285 0.4
286 0.38
287 0.45
288 0.51
289 0.51
290 0.57
291 0.57
292 0.62
293 0.58
294 0.61
295 0.62
296 0.55
297 0.53
298 0.49
299 0.48
300 0.46
301 0.45
302 0.44
303 0.42
304 0.4
305 0.37