Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M1Y2

Protein Details
Accession A0A6J3M1Y2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-154PLLSDKRKLRRRMREGWRITFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-145RKLRRR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 10, cyto 8, mito 3, pero 2, extr 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MTHQADAKRALDDRGYTGHLIHNDNPLKLLPKPVRDRITDSYYWKEQCFGLNAATLLDRALELTYIGGTHGAAQKPSPFLCLAFKLLQLTPAKGIILFYLGLAGEEFKYLRALAAFYVRLTWEVDEEVYTTLEPLLSDKRKLRRRMREGWRITFVDEFVDELLMGSRVCATPLPKIHPRAFLEDEDRLEERVSALGEELDELDRGGDGDDEEEGRLGSGSDEGEVEEIHVRDLEIRNGFRRGSGSSREEGSEDARRGSNNDEMDDGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.24
4 0.24
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.29
9 0.35
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.32
14 0.31
15 0.28
16 0.36
17 0.33
18 0.39
19 0.47
20 0.54
21 0.58
22 0.58
23 0.64
24 0.61
25 0.62
26 0.57
27 0.54
28 0.52
29 0.52
30 0.51
31 0.45
32 0.4
33 0.33
34 0.32
35 0.31
36 0.26
37 0.2
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.14
43 0.1
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.07
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.18
69 0.2
70 0.18
71 0.19
72 0.19
73 0.19
74 0.23
75 0.21
76 0.2
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.13
81 0.13
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.11
123 0.12
124 0.15
125 0.2
126 0.3
127 0.37
128 0.47
129 0.56
130 0.61
131 0.68
132 0.75
133 0.8
134 0.81
135 0.8
136 0.75
137 0.7
138 0.6
139 0.53
140 0.43
141 0.33
142 0.24
143 0.17
144 0.13
145 0.07
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.13
159 0.17
160 0.23
161 0.28
162 0.34
163 0.37
164 0.43
165 0.43
166 0.45
167 0.45
168 0.41
169 0.39
170 0.36
171 0.34
172 0.3
173 0.29
174 0.23
175 0.2
176 0.17
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.14
219 0.17
220 0.21
221 0.23
222 0.26
223 0.3
224 0.33
225 0.33
226 0.3
227 0.3
228 0.29
229 0.29
230 0.34
231 0.35
232 0.35
233 0.37
234 0.36
235 0.35
236 0.32
237 0.32
238 0.32
239 0.29
240 0.29
241 0.29
242 0.28
243 0.3
244 0.32
245 0.34
246 0.28
247 0.28