FuNGI

A0A6J3MEF6

Protein Details

Accession

A0A6J3MEF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-40	GGVHGLPPKVQRRPRKSKPGGTAPVHDC	Hydrophilic
502-527	AGVVPTKKTRGRPRKNAKQEPKAPLV	Hydrophilic
670-694	VPNKGKRSAAAKKKRSKIGDRSVLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-31	PKVQRRPRKSKP
508-520	KKTRGRPRKNAKQ
673-687	KGKRSAAAKKKRSKI

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPPIVKPPSVRIGGVHGLPPKVQRRPRKSKPGGTAPVHDCCDNPDPQDEDGIKICKNCFTELQNVNITAEVTFEDQAGGRSTVQGGLVGENARFSKTLGAGAYRRIGGGERNSMVEIENAGRRALASLAAPLKVPDNITQQAASVWSLAALNNFMAGRRTDEVAAACMWAACRRQKENDVLLMDMAEILRINVFRLGEVYKDLCEKLFLEGKPVGYQHFIEMEPLIKKYCQKLQFGDKTNQVGYDALRIMKRMNRDWIVSGRHPAGLCGACIILAARMNNFQRSVREVVYVSKVADGTIAKRVEEFRRTKSAALTVEQFREFGNRMLFQHDPPSLLEAEARGQKQQKRRAAREAHIQQSQARQHSVISIADDESDVSSRFSSVGLATPPPTQLSGAESTNVDSQDSYAPPMAQMTTAMTNDVAASDAPNRKRLHDNSDAADDNNTSADDRSKRTRKSPSAPANAASRSGARTYPDQEPRFDAEGFAIPALPIDPELLGDDLAGVVPTKKTRGRPRKNAKQEPKAPLVVELSEEELADENYLEEQINQMLEDGQVEDAQNEVISIKEQERIEAEANRAKVVAAEQQRLDAAKAQQRREEQGFSMGDAPRGEEVTAAELEEEFKDDIEVENCLLNPHEIMTKERIWVTHNEDWLRKQAEREMLQSVANATGVPNKGKRSAAAKKKRSKIGDRSVLADHDTPIESPADAAKAMLDRRAPQKSQHVDFSALQRIYGRTSQTPSRDAGSGDASPTNDFDPRAGRETSEGAGHGKEADPPHDRNRSRDDDGPEQRDDDQISEAPADDADDQDDGAWNNANDEDEDVEDEDPEEADYRTALQASGNFEEDEFGIVDNTHNYDDEYDEYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.36
3	0.32
4	0.31
5	0.32
6	0.39
7	0.41
8	0.46
9	0.54
10	0.6
11	0.67
12	0.76
13	0.85
14	0.88
15	0.9
16	0.9
17	0.91
18	0.91
19	0.9
20	0.84
21	0.82
22	0.76
23	0.72
24	0.65
25	0.55
26	0.45
27	0.41
28	0.41
29	0.35
30	0.32
31	0.31
32	0.31
33	0.31
34	0.39
35	0.34
36	0.31
37	0.33
38	0.34
39	0.3
40	0.31
41	0.31
42	0.29
43	0.31
44	0.31
45	0.31
46	0.32
47	0.41
48	0.41
49	0.45
50	0.43
51	0.42
52	0.39
53	0.34
54	0.3
55	0.2
56	0.17
57	0.13
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.14
65	0.14
66	0.12
67	0.13
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.12
73	0.11
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.14
78	0.14
79	0.14
80	0.14
81	0.13
82	0.16
83	0.16
84	0.19
85	0.18
86	0.23
87	0.23
88	0.27
89	0.29
90	0.25
91	0.24
92	0.21
93	0.21
94	0.21
95	0.25
96	0.28
97	0.26
98	0.27
99	0.28
100	0.27
101	0.26
102	0.21
103	0.18
104	0.15
105	0.17
106	0.16
107	0.16
108	0.15
109	0.15
110	0.15
111	0.13
112	0.11
113	0.09
114	0.13
115	0.15
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.16
120	0.17
121	0.18
122	0.17
123	0.21
124	0.23
125	0.25
126	0.24
127	0.23
128	0.22
129	0.21
130	0.17
131	0.11
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.07
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.11
144	0.14
145	0.15
146	0.17
147	0.16
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.17
152	0.13
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.16
158	0.2
159	0.26
160	0.31
161	0.37
162	0.43
163	0.5
164	0.52
165	0.54
166	0.5
167	0.44
168	0.39
169	0.33
170	0.26
171	0.19
172	0.13
173	0.07
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.15
189	0.16
190	0.14
191	0.15
192	0.14
193	0.16
194	0.21
195	0.2
196	0.23
197	0.24
198	0.25
199	0.26
200	0.26
201	0.23
202	0.19
203	0.19
204	0.16
205	0.16
206	0.15
207	0.14
208	0.14
209	0.16
210	0.15
211	0.16
212	0.16
213	0.15
214	0.19
215	0.22
216	0.3
217	0.33
218	0.35
219	0.41
220	0.49
221	0.57
222	0.59
223	0.6
224	0.56
225	0.53
226	0.49
227	0.44
228	0.34
229	0.26
230	0.21
231	0.2
232	0.17
233	0.16
234	0.16
235	0.16
236	0.18
237	0.2
238	0.25
239	0.24
240	0.3
241	0.31
242	0.32
243	0.35
244	0.38
245	0.41
246	0.38
247	0.38
248	0.31
249	0.31
250	0.29
251	0.26
252	0.25
253	0.19
254	0.17
255	0.14
256	0.12
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.13
265	0.15
266	0.17
267	0.18
268	0.19
269	0.19
270	0.23
271	0.26
272	0.22
273	0.22
274	0.21
275	0.22
276	0.24
277	0.23
278	0.19
279	0.17
280	0.16
281	0.14
282	0.15
283	0.13
284	0.11
285	0.16
286	0.17
287	0.15
288	0.16
289	0.2
290	0.23
291	0.31
292	0.33
293	0.32
294	0.39
295	0.41
296	0.41
297	0.39
298	0.39
299	0.33
300	0.31
301	0.31
302	0.26
303	0.27
304	0.26
305	0.24
306	0.19
307	0.19
308	0.19
309	0.16
310	0.17
311	0.16
312	0.17
313	0.2
314	0.21
315	0.19
316	0.23
317	0.21
318	0.19
319	0.17
320	0.19
321	0.15
322	0.14
323	0.14
324	0.09
325	0.12
326	0.15
327	0.15
328	0.16
329	0.22
330	0.27
331	0.35
332	0.44
333	0.49
334	0.55
335	0.59
336	0.65
337	0.67
338	0.66
339	0.68
340	0.66
341	0.63
342	0.55
343	0.51
344	0.44
345	0.43
346	0.43
347	0.35
348	0.29
349	0.24
350	0.21
351	0.21
352	0.21
353	0.15
354	0.11
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.13
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.05
410	0.03
411	0.04
412	0.08
413	0.13
414	0.14
415	0.21
416	0.21
417	0.24
418	0.31
419	0.33
420	0.36
421	0.39
422	0.41
423	0.36
424	0.39
425	0.37
426	0.31
427	0.28
428	0.21
429	0.13
430	0.11
431	0.09
432	0.06
433	0.06
434	0.09
435	0.11
436	0.14
437	0.23
438	0.3
439	0.33
440	0.39
441	0.49
442	0.52
443	0.57
444	0.64
445	0.65
446	0.66
447	0.64
448	0.59
449	0.53
450	0.46
451	0.4
452	0.3
453	0.21
454	0.15
455	0.15
456	0.14
457	0.12
458	0.14
459	0.17
460	0.24
461	0.31
462	0.32
463	0.32
464	0.34
465	0.36
466	0.36
467	0.32
468	0.25
469	0.17
470	0.17
471	0.16
472	0.13
473	0.09
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.05
494	0.09
495	0.13
496	0.21
497	0.32
498	0.44
499	0.54
500	0.64
501	0.75
502	0.82
503	0.89
504	0.93
505	0.92
506	0.91
507	0.89
508	0.84
509	0.78
510	0.69
511	0.58
512	0.49
513	0.4
514	0.3
515	0.22
516	0.16
517	0.13
518	0.11
519	0.1
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.04
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.06
551	0.07
552	0.12
553	0.12
554	0.13
555	0.15
556	0.17
557	0.19
558	0.2
559	0.23
560	0.21
561	0.22
562	0.21
563	0.2
564	0.17
565	0.14
566	0.13
567	0.17
568	0.18
569	0.21
570	0.2
571	0.21
572	0.22
573	0.22
574	0.21
575	0.18
576	0.19
577	0.22
578	0.29
579	0.31
580	0.35
581	0.38
582	0.43
583	0.42
584	0.4
585	0.34
586	0.34
587	0.32
588	0.28
589	0.3
590	0.25
591	0.23
592	0.2
593	0.2
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.08
603	0.07
604	0.08
605	0.08
606	0.09
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.08
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.08
620	0.08
621	0.08
622	0.11
623	0.11
624	0.14
625	0.18
626	0.19
627	0.21
628	0.22
629	0.22
630	0.22
631	0.26
632	0.31
633	0.31
634	0.35
635	0.36
636	0.38
637	0.39
638	0.43
639	0.41
640	0.34
641	0.32
642	0.33
643	0.38
644	0.38
645	0.38
646	0.34
647	0.32
648	0.31
649	0.29
650	0.24
651	0.16
652	0.13
653	0.11
654	0.08
655	0.12
656	0.14
657	0.17
658	0.2
659	0.22
660	0.26
661	0.27
662	0.3
663	0.34
664	0.42
665	0.5
666	0.57
667	0.65
668	0.7
669	0.78
670	0.83
671	0.83
672	0.83
673	0.82
674	0.82
675	0.82
676	0.73
677	0.68
678	0.62
679	0.55
680	0.47
681	0.38
682	0.28
683	0.2
684	0.19
685	0.16
686	0.15
687	0.14
688	0.11
689	0.1
690	0.11
691	0.1
692	0.09
693	0.08
694	0.08
695	0.12
696	0.13
697	0.15
698	0.17
699	0.2
700	0.28
701	0.35
702	0.36
703	0.38
704	0.48
705	0.53
706	0.55
707	0.56
708	0.52
709	0.49
710	0.5
711	0.49
712	0.48
713	0.39
714	0.35
715	0.31
716	0.29
717	0.29
718	0.3
719	0.29
720	0.24
721	0.29
722	0.36
723	0.38
724	0.4
725	0.37
726	0.37
727	0.34
728	0.31
729	0.28
730	0.25
731	0.22
732	0.21
733	0.21
734	0.19
735	0.18
736	0.19
737	0.18
738	0.16
739	0.16
740	0.16
741	0.19
742	0.22
743	0.25
744	0.25
745	0.24
746	0.24
747	0.27
748	0.26
749	0.22
750	0.2
751	0.17
752	0.17
753	0.16
754	0.15
755	0.13
756	0.16
757	0.17
758	0.22
759	0.26
760	0.3
761	0.38
762	0.47
763	0.49
764	0.5
765	0.57
766	0.59
767	0.59
768	0.61
769	0.6
770	0.6
771	0.67
772	0.66
773	0.59
774	0.54
775	0.49
776	0.45
777	0.39
778	0.3
779	0.24
780	0.2
781	0.2
782	0.18
783	0.18
784	0.15
785	0.13
786	0.14
787	0.11
788	0.1
789	0.1
790	0.1
791	0.09
792	0.09
793	0.11
794	0.1
795	0.11
796	0.13
797	0.12
798	0.13
799	0.14
800	0.14
801	0.13
802	0.14
803	0.14
804	0.12
805	0.14
806	0.14
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.11
811	0.1
812	0.1
813	0.09
814	0.08
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.11
819	0.12
820	0.11
821	0.12
822	0.15
823	0.2
824	0.23
825	0.23
826	0.22
827	0.21
828	0.22
829	0.2
830	0.18
831	0.13
832	0.11
833	0.09
834	0.1
835	0.11
836	0.12
837	0.14
838	0.13
839	0.13
840	0.14
841	0.14
842	0.16

A0A6J3MEF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer