Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M5J6

Protein Details
Accession A0A6J3M5J6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-258GLEIVTKKRRRENVRRLGKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-252KRRRENVR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MTRWHGSNAVREPPIVRTATGYKAPTTKDIPPVTLTNIAHRIGPLFETFQRGRADAEQASTDGGDRGSTAAEPGRGRDLSMSPAARRPSSLSKTMSPAGRPSQPARRGSGQSRRNRNEPTPLSTIPGVYFDEAFRLENPQRAEIVRPLSHAEQNPANGSAQAPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKGLQTEAEQSIAKIQRLRDDLHRLDQDVAISGLEIVTKKRRRENVRRLGKAAAQVQRVVDNVRTADELVECERYDDAADQMDRVGRLVRGKVEPGAPSEDLIDLRQLKALQGLESGLQELQLRIGSGFSSRFTKTLLSDIRQHVEKVPSTETLKRLSRQRGIPPTYMESNEDFRKELLNALNGLARAGHTAPATAAYREAVNREMKSLIRKHMPSSNDDDADSMVSISTRGGRQLTQQDKSSILARNLRALDPEDAEDLLAKVYCSISEALRRVSTQTKILLDVTSSVNESEPRSPPRINSLASVDSKGMNGSPKAAVRPSVQEDLSQALDMSSLLGQAVDTAQLQITRVLKVRNEQIIRLSRDSFLRYFTLNRLFADECEAVSGRGGSQLKTIINAQISGFVQVLGTTETERIANLLHADTWNAEDFSETDNVYLQRILVSMSTDPPEWTTGLTPIWESVKPSTANDTEAAKNNALEAQTTNGTTPAAKSQVKAAYIDDNRYILVSSAASLLSTVDMFLSLTATFPTITPQIATCLLEVLRMFNSRSCQLILGAGARAEGGLKTITTKHLALASQALSFVIALIPYMRECVRRHTPGGQAAALTDFDKTKRLYQDHQTEIHDKLVEIMTSRSQTHARAMRAINYDAIDTTEEKASPYMETLTKETLTLQRVLGRHLSEMYVGLIMQQIFQSYKEQWTKTFSEADVKTPEGQKRLLRDANALDARLGKDIVAIVKAKMTDAPKPNEGQAETAGTTTESTVAEAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.35
3 0.29
4 0.27
5 0.3
6 0.34
7 0.38
8 0.36
9 0.34
10 0.37
11 0.4
12 0.4
13 0.41
14 0.41
15 0.45
16 0.45
17 0.44
18 0.43
19 0.43
20 0.42
21 0.44
22 0.39
23 0.37
24 0.39
25 0.37
26 0.34
27 0.32
28 0.29
29 0.23
30 0.24
31 0.19
32 0.18
33 0.2
34 0.27
35 0.27
36 0.31
37 0.32
38 0.31
39 0.32
40 0.3
41 0.34
42 0.28
43 0.3
44 0.26
45 0.24
46 0.24
47 0.21
48 0.18
49 0.14
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.24
62 0.24
63 0.24
64 0.26
65 0.24
66 0.25
67 0.31
68 0.32
69 0.28
70 0.34
71 0.38
72 0.35
73 0.35
74 0.37
75 0.4
76 0.42
77 0.47
78 0.46
79 0.46
80 0.5
81 0.54
82 0.51
83 0.44
84 0.44
85 0.43
86 0.44
87 0.46
88 0.47
89 0.52
90 0.55
91 0.57
92 0.57
93 0.58
94 0.59
95 0.63
96 0.67
97 0.66
98 0.68
99 0.75
100 0.76
101 0.76
102 0.77
103 0.73
104 0.73
105 0.69
106 0.66
107 0.62
108 0.56
109 0.52
110 0.45
111 0.41
112 0.31
113 0.28
114 0.23
115 0.17
116 0.17
117 0.13
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.19
123 0.2
124 0.24
125 0.27
126 0.26
127 0.28
128 0.28
129 0.31
130 0.29
131 0.34
132 0.3
133 0.29
134 0.31
135 0.33
136 0.37
137 0.36
138 0.35
139 0.31
140 0.32
141 0.33
142 0.3
143 0.27
144 0.21
145 0.2
146 0.23
147 0.26
148 0.28
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.27
153 0.27
154 0.26
155 0.23
156 0.23
157 0.27
158 0.28
159 0.26
160 0.26
161 0.26
162 0.22
163 0.21
164 0.18
165 0.13
166 0.12
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.19
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.24
208 0.29
209 0.32
210 0.35
211 0.35
212 0.41
213 0.42
214 0.46
215 0.47
216 0.42
217 0.4
218 0.38
219 0.31
220 0.23
221 0.2
222 0.12
223 0.1
224 0.08
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.18
230 0.25
231 0.3
232 0.38
233 0.48
234 0.57
235 0.68
236 0.76
237 0.77
238 0.82
239 0.82
240 0.77
241 0.71
242 0.64
243 0.58
244 0.54
245 0.49
246 0.4
247 0.37
248 0.35
249 0.32
250 0.3
251 0.26
252 0.2
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.11
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.13
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.23
286 0.22
287 0.22
288 0.24
289 0.2
290 0.19
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.14
295 0.15
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.16
302 0.16
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.21
329 0.24
330 0.23
331 0.29
332 0.32
333 0.34
334 0.33
335 0.33
336 0.29
337 0.3
338 0.29
339 0.25
340 0.24
341 0.24
342 0.26
343 0.3
344 0.28
345 0.3
346 0.32
347 0.34
348 0.39
349 0.43
350 0.46
351 0.48
352 0.55
353 0.58
354 0.59
355 0.57
356 0.52
357 0.49
358 0.45
359 0.4
360 0.33
361 0.26
362 0.25
363 0.25
364 0.23
365 0.2
366 0.18
367 0.18
368 0.16
369 0.18
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.1
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.15
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.18
399 0.24
400 0.26
401 0.27
402 0.3
403 0.31
404 0.32
405 0.36
406 0.36
407 0.33
408 0.37
409 0.36
410 0.3
411 0.29
412 0.27
413 0.22
414 0.2
415 0.17
416 0.09
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.13
427 0.22
428 0.27
429 0.28
430 0.3
431 0.3
432 0.3
433 0.3
434 0.3
435 0.24
436 0.22
437 0.24
438 0.23
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.23
443 0.22
444 0.2
445 0.15
446 0.16
447 0.12
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.07
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.06
460 0.07
461 0.11
462 0.12
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.18
468 0.19
469 0.17
470 0.18
471 0.18
472 0.18
473 0.18
474 0.16
475 0.12
476 0.13
477 0.11
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.12
485 0.14
486 0.17
487 0.21
488 0.21
489 0.21
490 0.27
491 0.29
492 0.26
493 0.24
494 0.24
495 0.24
496 0.24
497 0.25
498 0.19
499 0.16
500 0.15
501 0.13
502 0.11
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.17
513 0.2
514 0.21
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.19
519 0.18
520 0.14
521 0.1
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.08
540 0.09
541 0.11
542 0.13
543 0.14
544 0.15
545 0.18
546 0.23
547 0.28
548 0.28
549 0.27
550 0.31
551 0.37
552 0.39
553 0.38
554 0.34
555 0.28
556 0.29
557 0.31
558 0.25
559 0.21
560 0.18
561 0.17
562 0.18
563 0.2
564 0.25
565 0.23
566 0.23
567 0.24
568 0.23
569 0.22
570 0.25
571 0.21
572 0.15
573 0.15
574 0.15
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.06
579 0.11
580 0.12
581 0.1
582 0.11
583 0.14
584 0.14
585 0.15
586 0.16
587 0.13
588 0.13
589 0.14
590 0.12
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.12
595 0.09
596 0.09
597 0.08
598 0.09
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.08
614 0.08
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.08
619 0.07
620 0.08
621 0.1
622 0.11
623 0.1
624 0.09
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.08
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.09
637 0.11
638 0.11
639 0.11
640 0.12
641 0.13
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.09
649 0.1
650 0.12
651 0.12
652 0.13
653 0.13
654 0.18
655 0.18
656 0.19
657 0.23
658 0.21
659 0.22
660 0.22
661 0.24
662 0.22
663 0.26
664 0.28
665 0.23
666 0.22
667 0.2
668 0.21
669 0.17
670 0.15
671 0.11
672 0.11
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.1
679 0.11
680 0.11
681 0.16
682 0.17
683 0.17
684 0.23
685 0.26
686 0.27
687 0.27
688 0.25
689 0.28
690 0.29
691 0.31
692 0.27
693 0.23
694 0.22
695 0.21
696 0.2
697 0.11
698 0.1
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.07
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.05
708 0.05
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.1
724 0.1
725 0.12
726 0.14
727 0.14
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.13
732 0.13
733 0.12
734 0.13
735 0.14
736 0.15
737 0.16
738 0.19
739 0.19
740 0.21
741 0.2
742 0.18
743 0.17
744 0.17
745 0.16
746 0.14
747 0.13
748 0.11
749 0.1
750 0.09
751 0.08
752 0.08
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.08
758 0.1
759 0.12
760 0.15
761 0.16
762 0.16
763 0.19
764 0.19
765 0.18
766 0.2
767 0.19
768 0.16
769 0.16
770 0.14
771 0.11
772 0.1
773 0.09
774 0.06
775 0.04
776 0.04
777 0.05
778 0.06
779 0.06
780 0.09
781 0.1
782 0.15
783 0.16
784 0.25
785 0.33
786 0.37
787 0.41
788 0.44
789 0.5
790 0.51
791 0.53
792 0.45
793 0.37
794 0.32
795 0.29
796 0.24
797 0.18
798 0.13
799 0.11
800 0.11
801 0.16
802 0.17
803 0.22
804 0.29
805 0.34
806 0.39
807 0.48
808 0.56
809 0.58
810 0.6
811 0.59
812 0.54
813 0.51
814 0.48
815 0.39
816 0.29
817 0.27
818 0.24
819 0.2
820 0.17
821 0.18
822 0.18
823 0.2
824 0.2
825 0.2
826 0.21
827 0.22
828 0.3
829 0.34
830 0.33
831 0.37
832 0.39
833 0.42
834 0.44
835 0.44
836 0.38
837 0.32
838 0.3
839 0.23
840 0.23
841 0.17
842 0.14
843 0.15
844 0.15
845 0.14
846 0.15
847 0.15
848 0.15
849 0.14
850 0.14
851 0.16
852 0.16
853 0.19
854 0.21
855 0.24
856 0.23
857 0.23
858 0.25
859 0.26
860 0.27
861 0.26
862 0.25
863 0.27
864 0.27
865 0.31
866 0.32
867 0.28
868 0.27
869 0.26
870 0.25
871 0.2
872 0.2
873 0.17
874 0.13
875 0.11
876 0.09
877 0.11
878 0.1
879 0.1
880 0.1
881 0.11
882 0.11
883 0.13
884 0.16
885 0.16
886 0.25
887 0.32
888 0.33
889 0.35
890 0.4
891 0.42
892 0.42
893 0.44
894 0.36
895 0.39
896 0.38
897 0.4
898 0.38
899 0.37
900 0.38
901 0.4
902 0.44
903 0.39
904 0.43
905 0.43
906 0.46
907 0.53
908 0.53
909 0.49
910 0.49
911 0.48
912 0.52
913 0.5
914 0.44
915 0.35
916 0.34
917 0.33
918 0.29
919 0.26
920 0.16
921 0.15
922 0.16
923 0.17
924 0.17
925 0.17
926 0.15
927 0.18
928 0.19
929 0.18
930 0.21
931 0.23
932 0.28
933 0.36
934 0.41
935 0.43
936 0.46
937 0.49
938 0.5
939 0.47
940 0.41
941 0.35
942 0.33
943 0.29
944 0.26
945 0.23
946 0.17
947 0.17
948 0.14
949 0.14
950 0.1