Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3MDM2

Protein Details
Accession A0A6J3MDM2    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23SSSVQSKRSPRANKSTPIERSHydrophilic
93-119GKDNTTVKSPPRPRKPRTEGERRTADYHydrophilic
561-588TAFGRRGTRESARRRRSRQTAQAPVDSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-110RRAVAPSPSRGSTSRRRALSERSAGKDNTTVKSPPRPRKPRT
573-575RRR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22584  Rcat_RBR_unk  
Amino Acid Sequences MASSSVQSKRSPRANKSTPIERSNPSSTRRRSAASKYAAKADDVPARPDIEALRQSRLAYFTLRPVERRRAVAPSPSRGSTSRRRALSERSAGKDNTTVKSPPRPRKPRTEGERRTADYVYGMRDIPAQDAGKRWERPSSSRSDASRAQGLSSIGEDDIGPDDSVSVVASRRRRRSTMTDRPSLRRSNTVSAKLTPVAEADAKVENASTHTPNKTGNRVSSFLGSLMRRNTTSAVPTPPRLVECLTCGSDDVPAVKTAKLGCGHRMCHDCLRRIFEMSVKDPAHMPPKCCTSEHIPLKHVDKLFDTKFKVRWNRRYQEYNTKNRIYCPAPKCGTWIRPGQVHSFQGRKFAQCLRCETKVCVLCHTKMHRSRECPKDPEIQKLVEEGKKSGWQSCYSCHAMIELKEGCNHMTCRCQAQFCMMCGKKWKTCDCPWFNHNGVSDGDRLVDMRIPQGLDHVVRRLGIQHLFPAADTPAAEPGNTQRQPPRTFHNEMDQRRHQEREDENLARRMQLGLVLTQNEPEDDARQGTTEIWGLGNAGEHHMNENFVQNSTNTRLDVPDDTAFGRRGTRESARRRRSRQTAQAPVDSGLAMNFLGDESILGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.8
4 0.81
5 0.8
6 0.77
7 0.74
8 0.67
9 0.66
10 0.64
11 0.63
12 0.59
13 0.61
14 0.61
15 0.63
16 0.63
17 0.61
18 0.6
19 0.62
20 0.66
21 0.65
22 0.67
23 0.62
24 0.66
25 0.62
26 0.56
27 0.5
28 0.46
29 0.46
30 0.39
31 0.39
32 0.34
33 0.35
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.25
38 0.3
39 0.29
40 0.32
41 0.32
42 0.33
43 0.34
44 0.34
45 0.29
46 0.26
47 0.25
48 0.28
49 0.34
50 0.36
51 0.39
52 0.44
53 0.53
54 0.53
55 0.55
56 0.52
57 0.51
58 0.52
59 0.56
60 0.56
61 0.55
62 0.55
63 0.52
64 0.52
65 0.47
66 0.51
67 0.51
68 0.54
69 0.53
70 0.52
71 0.56
72 0.57
73 0.63
74 0.66
75 0.65
76 0.62
77 0.59
78 0.61
79 0.56
80 0.53
81 0.51
82 0.46
83 0.39
84 0.35
85 0.34
86 0.34
87 0.44
88 0.52
89 0.56
90 0.63
91 0.71
92 0.73
93 0.81
94 0.85
95 0.85
96 0.85
97 0.86
98 0.83
99 0.82
100 0.83
101 0.75
102 0.7
103 0.6
104 0.5
105 0.42
106 0.36
107 0.3
108 0.23
109 0.2
110 0.16
111 0.18
112 0.19
113 0.16
114 0.2
115 0.18
116 0.17
117 0.21
118 0.26
119 0.31
120 0.33
121 0.34
122 0.36
123 0.38
124 0.43
125 0.44
126 0.47
127 0.46
128 0.49
129 0.49
130 0.48
131 0.49
132 0.46
133 0.47
134 0.39
135 0.33
136 0.29
137 0.28
138 0.22
139 0.18
140 0.16
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.12
156 0.21
157 0.29
158 0.38
159 0.43
160 0.45
161 0.51
162 0.59
163 0.65
164 0.68
165 0.67
166 0.68
167 0.68
168 0.71
169 0.71
170 0.67
171 0.58
172 0.54
173 0.51
174 0.51
175 0.53
176 0.53
177 0.5
178 0.45
179 0.45
180 0.4
181 0.35
182 0.27
183 0.2
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.24
200 0.28
201 0.32
202 0.33
203 0.34
204 0.34
205 0.35
206 0.35
207 0.32
208 0.28
209 0.23
210 0.24
211 0.2
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.17
219 0.19
220 0.19
221 0.23
222 0.24
223 0.25
224 0.26
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.21
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.14
246 0.16
247 0.17
248 0.22
249 0.25
250 0.27
251 0.3
252 0.33
253 0.32
254 0.36
255 0.4
256 0.39
257 0.37
258 0.41
259 0.37
260 0.36
261 0.34
262 0.29
263 0.29
264 0.25
265 0.29
266 0.24
267 0.24
268 0.23
269 0.25
270 0.3
271 0.28
272 0.28
273 0.24
274 0.29
275 0.3
276 0.3
277 0.3
278 0.28
279 0.36
280 0.41
281 0.41
282 0.37
283 0.38
284 0.41
285 0.42
286 0.36
287 0.27
288 0.22
289 0.24
290 0.25
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.29
295 0.36
296 0.44
297 0.47
298 0.55
299 0.6
300 0.65
301 0.67
302 0.71
303 0.7
304 0.71
305 0.71
306 0.71
307 0.68
308 0.66
309 0.6
310 0.54
311 0.54
312 0.46
313 0.47
314 0.4
315 0.41
316 0.38
317 0.37
318 0.4
319 0.4
320 0.4
321 0.35
322 0.36
323 0.3
324 0.32
325 0.34
326 0.34
327 0.33
328 0.32
329 0.31
330 0.32
331 0.3
332 0.34
333 0.33
334 0.3
335 0.29
336 0.33
337 0.36
338 0.34
339 0.42
340 0.4
341 0.43
342 0.43
343 0.42
344 0.43
345 0.43
346 0.4
347 0.39
348 0.37
349 0.34
350 0.39
351 0.43
352 0.44
353 0.45
354 0.53
355 0.53
356 0.57
357 0.64
358 0.67
359 0.69
360 0.64
361 0.61
362 0.63
363 0.58
364 0.59
365 0.54
366 0.45
367 0.38
368 0.37
369 0.38
370 0.31
371 0.3
372 0.22
373 0.21
374 0.24
375 0.25
376 0.26
377 0.24
378 0.26
379 0.26
380 0.28
381 0.32
382 0.31
383 0.3
384 0.25
385 0.24
386 0.22
387 0.21
388 0.24
389 0.2
390 0.18
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.19
395 0.2
396 0.17
397 0.2
398 0.21
399 0.26
400 0.28
401 0.29
402 0.26
403 0.33
404 0.34
405 0.3
406 0.39
407 0.33
408 0.33
409 0.4
410 0.45
411 0.41
412 0.44
413 0.5
414 0.47
415 0.55
416 0.63
417 0.61
418 0.62
419 0.61
420 0.62
421 0.57
422 0.53
423 0.46
424 0.38
425 0.33
426 0.28
427 0.26
428 0.18
429 0.17
430 0.13
431 0.12
432 0.1
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.18
453 0.18
454 0.18
455 0.17
456 0.13
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.17
465 0.26
466 0.27
467 0.29
468 0.31
469 0.4
470 0.45
471 0.47
472 0.5
473 0.48
474 0.52
475 0.52
476 0.56
477 0.57
478 0.6
479 0.66
480 0.65
481 0.65
482 0.64
483 0.65
484 0.56
485 0.55
486 0.53
487 0.52
488 0.53
489 0.51
490 0.51
491 0.53
492 0.52
493 0.44
494 0.4
495 0.33
496 0.24
497 0.21
498 0.18
499 0.14
500 0.17
501 0.18
502 0.18
503 0.18
504 0.18
505 0.16
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.13
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.15
514 0.13
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.11
519 0.1
520 0.1
521 0.09
522 0.11
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.13
527 0.16
528 0.16
529 0.17
530 0.16
531 0.21
532 0.19
533 0.18
534 0.19
535 0.17
536 0.22
537 0.26
538 0.27
539 0.23
540 0.23
541 0.23
542 0.25
543 0.28
544 0.27
545 0.23
546 0.23
547 0.23
548 0.26
549 0.26
550 0.23
551 0.24
552 0.22
553 0.23
554 0.28
555 0.36
556 0.43
557 0.52
558 0.62
559 0.69
560 0.78
561 0.83
562 0.87
563 0.88
564 0.89
565 0.89
566 0.88
567 0.88
568 0.84
569 0.82
570 0.74
571 0.64
572 0.54
573 0.43
574 0.33
575 0.22
576 0.16
577 0.1
578 0.08
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05