Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M8V0

Protein Details
Accession A0A6J3M8V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-33AAPAPEQKRLSKRRHIIKELIDTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-401RKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR004148  BAR_dom  
IPR035899  DBL_dom_sf  
IPR000219  DH-domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF03114  BAR  
PF00621  RhoGEF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50010  DH_2  
CDD cd07589  BAR_DNMBP  
cd00160  RhoGEF  
Amino Acid Sequences EKLAKTTSPAAPAPEQKRLSKRRHIIKELIDTENSYHQDLKIIEDIYKATCTPELVAPEDKKILFGNCDEIEKFAIYFYDELRKAATQVYVPPKSQRWGTRRNSFSTTQSDNTTNAFTDAVDDEKDRTSLIGSVFLANMVTMEQVYGTYLKNHDAANQRLAALQGTPTVKCWLDECHANASDITAAWDLDSLLVKPTQRVAKYPMLLQQLLETTPADHPDHENLKTAVKDSIAMLTRINDAKKRADLVDSIVNGRRRKESDLRGGLVKAFGRRTDRLKERVGLQEAFQDPDFDDLAHKFGGHFIRLQICMRDVQDYMNRTDKAVEIINNYASALELFTDVAPSSLPEIESKWRRYGQTIRDLNLVAFTEHKTAVQKRVLTPMIACIKLHEGPQNAIAKRKKRIVDYAKCKGDEKRGIKPDKKTLEAAEIYVALNDQLKIELPKLYSLTASLVQRCLHCFLDIQLQWNSTWERKLRPLLEASDIPVDVSQIEHAFKADYGEIERKCMELSVCNGNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.53
3 0.56
4 0.65
5 0.7
6 0.73
7 0.74
8 0.78
9 0.79
10 0.85
11 0.85
12 0.83
13 0.82
14 0.83
15 0.77
16 0.71
17 0.62
18 0.53
19 0.47
20 0.46
21 0.39
22 0.31
23 0.27
24 0.23
25 0.27
26 0.26
27 0.28
28 0.26
29 0.25
30 0.24
31 0.23
32 0.25
33 0.21
34 0.23
35 0.19
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.19
41 0.2
42 0.22
43 0.29
44 0.29
45 0.31
46 0.34
47 0.32
48 0.3
49 0.29
50 0.27
51 0.23
52 0.23
53 0.26
54 0.23
55 0.27
56 0.25
57 0.24
58 0.24
59 0.21
60 0.2
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.23
73 0.23
74 0.16
75 0.23
76 0.32
77 0.34
78 0.35
79 0.39
80 0.4
81 0.42
82 0.47
83 0.49
84 0.47
85 0.54
86 0.61
87 0.66
88 0.68
89 0.69
90 0.68
91 0.62
92 0.59
93 0.55
94 0.51
95 0.44
96 0.43
97 0.39
98 0.35
99 0.34
100 0.3
101 0.23
102 0.18
103 0.16
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.08
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.2
141 0.26
142 0.28
143 0.29
144 0.29
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.21
149 0.13
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.2
162 0.21
163 0.24
164 0.24
165 0.24
166 0.23
167 0.2
168 0.17
169 0.14
170 0.13
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.13
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.25
188 0.3
189 0.31
190 0.32
191 0.34
192 0.32
193 0.32
194 0.29
195 0.24
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.17
207 0.2
208 0.19
209 0.21
210 0.19
211 0.21
212 0.21
213 0.2
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.15
227 0.17
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.19
236 0.17
237 0.17
238 0.2
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.26
243 0.24
244 0.29
245 0.35
246 0.37
247 0.42
248 0.44
249 0.44
250 0.42
251 0.4
252 0.35
253 0.29
254 0.24
255 0.17
256 0.14
257 0.15
258 0.18
259 0.2
260 0.25
261 0.31
262 0.36
263 0.39
264 0.4
265 0.4
266 0.4
267 0.43
268 0.42
269 0.34
270 0.29
271 0.29
272 0.27
273 0.26
274 0.22
275 0.17
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.16
292 0.18
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.13
300 0.15
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.26
305 0.25
306 0.23
307 0.24
308 0.22
309 0.2
310 0.2
311 0.18
312 0.14
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.09
319 0.08
320 0.06
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.18
336 0.25
337 0.28
338 0.31
339 0.35
340 0.35
341 0.41
342 0.47
343 0.47
344 0.51
345 0.52
346 0.48
347 0.47
348 0.46
349 0.4
350 0.34
351 0.26
352 0.16
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.18
359 0.21
360 0.27
361 0.31
362 0.33
363 0.32
364 0.4
365 0.4
366 0.35
367 0.32
368 0.33
369 0.33
370 0.3
371 0.28
372 0.22
373 0.25
374 0.26
375 0.28
376 0.25
377 0.22
378 0.22
379 0.29
380 0.35
381 0.32
382 0.38
383 0.43
384 0.45
385 0.5
386 0.56
387 0.55
388 0.53
389 0.63
390 0.65
391 0.69
392 0.72
393 0.75
394 0.74
395 0.71
396 0.68
397 0.63
398 0.62
399 0.61
400 0.56
401 0.57
402 0.6
403 0.68
404 0.72
405 0.75
406 0.75
407 0.72
408 0.7
409 0.63
410 0.56
411 0.54
412 0.48
413 0.41
414 0.32
415 0.26
416 0.22
417 0.19
418 0.16
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.11
426 0.13
427 0.16
428 0.15
429 0.18
430 0.19
431 0.19
432 0.18
433 0.17
434 0.19
435 0.2
436 0.23
437 0.22
438 0.24
439 0.26
440 0.27
441 0.29
442 0.3
443 0.26
444 0.23
445 0.22
446 0.21
447 0.29
448 0.28
449 0.3
450 0.29
451 0.29
452 0.28
453 0.31
454 0.33
455 0.26
456 0.32
457 0.32
458 0.35
459 0.42
460 0.51
461 0.5
462 0.51
463 0.52
464 0.49
465 0.51
466 0.46
467 0.41
468 0.36
469 0.33
470 0.28
471 0.23
472 0.19
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.16
483 0.15
484 0.14
485 0.19
486 0.26
487 0.26
488 0.29
489 0.3
490 0.27
491 0.26
492 0.27
493 0.24
494 0.21
495 0.25