Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3LX89

Protein Details
Accession A0A6J3LX89    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-40QTEPDQPRKTRFDRRSQSPVTRDRNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-224RGRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR031121  RIK/BLOM7  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
CDD cd22385  KH-I_KHDC4_rpt1  
cd22386  KH-I_KHDC4_rpt2  
Amino Acid Sequences MSEEAPRPKRSRFDQTEPDQPRKTRFDRRSQSPVTRDRNTRSRSPLKSPSSAGGKMDAAAAAMAAAAKINAELAKKAPVRQGEVPIIRQRTNPDGAGSPSGPSSTLQADIYQQDGDYIKDIEVNDLRNRYTLTKGATQKMIKDETGADVTTRGNYYPDKSMATPAKPPLYLHVTSQTKEGLEKAIEKIEELMKQDLPDLIDQRRFRRPEREERPPPDLDSRGRRKWPEEKIPIDLEPIPGFNLRANVVGQQGMNVKHIQAETRCRVQIKGYGSGFLEQDTNAESDEPMYLHVTSPDEAMVAKAKELCLSLLESIHNNYREFKERGPQNGGDRGGFRGGRDRGGDRGGYGGGDRYGGGGGPAQQPTDPVEAQRQYEAWCAYYAQNPQLDPYAAYGGYAAAMAQYQQQAAAAAAQPGYGQQHGDDGAPPPPPPPPPPGSAAPGGYHAVSFSHIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.75
3 0.8
4 0.78
5 0.79
6 0.75
7 0.7
8 0.68
9 0.67
10 0.69
11 0.7
12 0.72
13 0.74
14 0.76
15 0.81
16 0.83
17 0.83
18 0.84
19 0.82
20 0.83
21 0.8
22 0.79
23 0.78
24 0.76
25 0.77
26 0.74
27 0.72
28 0.72
29 0.74
30 0.72
31 0.73
32 0.75
33 0.72
34 0.71
35 0.66
36 0.63
37 0.6
38 0.56
39 0.48
40 0.41
41 0.34
42 0.29
43 0.27
44 0.2
45 0.13
46 0.1
47 0.09
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.05
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.2
62 0.22
63 0.26
64 0.3
65 0.32
66 0.37
67 0.4
68 0.44
69 0.45
70 0.46
71 0.48
72 0.5
73 0.51
74 0.46
75 0.44
76 0.42
77 0.4
78 0.4
79 0.35
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.27
85 0.22
86 0.18
87 0.17
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.15
109 0.16
110 0.2
111 0.22
112 0.23
113 0.23
114 0.22
115 0.24
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.29
121 0.33
122 0.36
123 0.41
124 0.4
125 0.4
126 0.42
127 0.41
128 0.32
129 0.29
130 0.26
131 0.22
132 0.22
133 0.19
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.25
148 0.28
149 0.28
150 0.3
151 0.3
152 0.31
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.28
157 0.27
158 0.24
159 0.29
160 0.28
161 0.28
162 0.3
163 0.26
164 0.2
165 0.2
166 0.19
167 0.13
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.15
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.2
188 0.22
189 0.26
190 0.32
191 0.35
192 0.36
193 0.44
194 0.48
195 0.53
196 0.59
197 0.65
198 0.67
199 0.68
200 0.71
201 0.62
202 0.57
203 0.5
204 0.46
205 0.4
206 0.4
207 0.43
208 0.43
209 0.46
210 0.46
211 0.47
212 0.52
213 0.56
214 0.56
215 0.56
216 0.53
217 0.52
218 0.52
219 0.47
220 0.41
221 0.33
222 0.24
223 0.17
224 0.15
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.21
248 0.23
249 0.27
250 0.29
251 0.28
252 0.28
253 0.28
254 0.3
255 0.26
256 0.3
257 0.26
258 0.26
259 0.25
260 0.26
261 0.24
262 0.19
263 0.16
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.3
307 0.31
308 0.31
309 0.35
310 0.38
311 0.44
312 0.46
313 0.47
314 0.45
315 0.48
316 0.48
317 0.4
318 0.36
319 0.32
320 0.3
321 0.27
322 0.22
323 0.24
324 0.24
325 0.26
326 0.28
327 0.28
328 0.26
329 0.29
330 0.28
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.11
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.1
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.18
352 0.22
353 0.19
354 0.17
355 0.24
356 0.26
357 0.28
358 0.28
359 0.26
360 0.24
361 0.28
362 0.27
363 0.21
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.24
368 0.26
369 0.25
370 0.27
371 0.26
372 0.27
373 0.28
374 0.27
375 0.22
376 0.21
377 0.19
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.07
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.1
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.14
403 0.12
404 0.11
405 0.1
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.15
411 0.17
412 0.19
413 0.19
414 0.17
415 0.21
416 0.25
417 0.27
418 0.32
419 0.34
420 0.36
421 0.41
422 0.44
423 0.45
424 0.44
425 0.42
426 0.36
427 0.34
428 0.32
429 0.27
430 0.22
431 0.18
432 0.14