Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M6S9

Protein Details
Accession A0A6J3M6S9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ETPSKRQRTHSPASRLENTSHydrophilic
477-496EQRLEDERRREDRRHREQALBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR045148  TCRG1-like  
Gene Ontology GO:0070063  F:RNA polymerase binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
Amino Acid Sequences METPSKRQRTHSPASRLENTSHTRRNHANAGGRDQQRPYDRRDATDRPHSKHVLPGYEPWILIKTKLRRQFVHNTETKQSSWHVPAAVVPGVVAFGQRERERKEERGNASQPQPQIKSTHQSGKIYEPRAANDAESRARRRRSESLQREDEAAMLAELAAQTEVVDDQDPRLSENAIDRTNAKVAYDSEGSYDEIEVTDSEFEDDEDQAQTSAPGGDAEQKNDLDNNDDDAPVEFGEDDIAYQLAAMGEDYGLDPGEYGSPGENWEEGDEGLPLSEEDAANLFRDLLDDYRISPFTPWDNLIADQSETSIMNDDRYIVLPNMRARREVWDAWTKDKAAQIQKDRQAMNKLDPRIPYLAFLDSKATSKLYWPEFKRKYKREAELNDRKMSDKDREKLYRDHVNRLKLPESARKADLMTLLKSVPVKEFNRDTTIDALPQKVLSHLHFISLPSSTRNLVIESHIRKLPPAPTDSDMTDEQRLEDERRREDRRHREQALAERERKVEEQRRVIERQEARARRDLREEERELESAMAVGKQGLDSQLRETHLEAAKAGPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.81
3 0.73
4 0.67
5 0.65
6 0.61
7 0.61
8 0.6
9 0.55
10 0.54
11 0.58
12 0.61
13 0.6
14 0.61
15 0.61
16 0.59
17 0.63
18 0.65
19 0.63
20 0.61
21 0.56
22 0.56
23 0.56
24 0.55
25 0.55
26 0.56
27 0.54
28 0.56
29 0.62
30 0.62
31 0.6
32 0.68
33 0.68
34 0.63
35 0.69
36 0.67
37 0.6
38 0.59
39 0.58
40 0.53
41 0.48
42 0.47
43 0.44
44 0.42
45 0.4
46 0.34
47 0.32
48 0.26
49 0.27
50 0.3
51 0.34
52 0.41
53 0.49
54 0.55
55 0.55
56 0.62
57 0.69
58 0.68
59 0.69
60 0.66
61 0.63
62 0.63
63 0.62
64 0.55
65 0.47
66 0.42
67 0.38
68 0.36
69 0.33
70 0.28
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.25
75 0.19
76 0.15
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.06
82 0.07
83 0.14
84 0.18
85 0.24
86 0.28
87 0.37
88 0.42
89 0.49
90 0.57
91 0.59
92 0.62
93 0.66
94 0.65
95 0.64
96 0.63
97 0.6
98 0.55
99 0.53
100 0.49
101 0.42
102 0.42
103 0.39
104 0.41
105 0.42
106 0.48
107 0.45
108 0.46
109 0.46
110 0.52
111 0.55
112 0.5
113 0.5
114 0.42
115 0.39
116 0.39
117 0.37
118 0.28
119 0.24
120 0.26
121 0.27
122 0.32
123 0.36
124 0.41
125 0.47
126 0.5
127 0.53
128 0.58
129 0.61
130 0.67
131 0.7
132 0.71
133 0.71
134 0.68
135 0.63
136 0.55
137 0.45
138 0.34
139 0.24
140 0.14
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.16
162 0.2
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.21
167 0.23
168 0.21
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.09
181 0.07
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.09
220 0.09
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.08
305 0.1
306 0.13
307 0.18
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.28
313 0.32
314 0.29
315 0.29
316 0.32
317 0.33
318 0.35
319 0.37
320 0.32
321 0.29
322 0.31
323 0.32
324 0.3
325 0.35
326 0.39
327 0.45
328 0.49
329 0.53
330 0.51
331 0.49
332 0.49
333 0.44
334 0.45
335 0.43
336 0.41
337 0.39
338 0.39
339 0.38
340 0.34
341 0.32
342 0.26
343 0.21
344 0.21
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.12
353 0.14
354 0.2
355 0.22
356 0.3
357 0.33
358 0.43
359 0.52
360 0.62
361 0.69
362 0.7
363 0.74
364 0.75
365 0.77
366 0.76
367 0.76
368 0.77
369 0.77
370 0.77
371 0.72
372 0.64
373 0.58
374 0.51
375 0.46
376 0.45
377 0.42
378 0.42
379 0.47
380 0.52
381 0.54
382 0.58
383 0.6
384 0.61
385 0.56
386 0.61
387 0.57
388 0.59
389 0.59
390 0.57
391 0.53
392 0.46
393 0.48
394 0.46
395 0.47
396 0.44
397 0.41
398 0.38
399 0.36
400 0.34
401 0.35
402 0.28
403 0.23
404 0.21
405 0.2
406 0.2
407 0.21
408 0.2
409 0.18
410 0.22
411 0.23
412 0.28
413 0.32
414 0.34
415 0.37
416 0.37
417 0.36
418 0.32
419 0.32
420 0.3
421 0.27
422 0.25
423 0.22
424 0.21
425 0.19
426 0.17
427 0.18
428 0.15
429 0.2
430 0.19
431 0.2
432 0.2
433 0.21
434 0.2
435 0.19
436 0.19
437 0.15
438 0.17
439 0.16
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.16
444 0.19
445 0.26
446 0.27
447 0.31
448 0.32
449 0.31
450 0.31
451 0.34
452 0.35
453 0.32
454 0.32
455 0.32
456 0.32
457 0.35
458 0.35
459 0.35
460 0.32
461 0.3
462 0.29
463 0.25
464 0.23
465 0.23
466 0.25
467 0.26
468 0.31
469 0.34
470 0.4
471 0.48
472 0.54
473 0.59
474 0.67
475 0.74
476 0.77
477 0.8
478 0.76
479 0.74
480 0.75
481 0.76
482 0.76
483 0.75
484 0.69
485 0.62
486 0.6
487 0.57
488 0.53
489 0.53
490 0.52
491 0.52
492 0.56
493 0.6
494 0.65
495 0.65
496 0.65
497 0.64
498 0.59
499 0.6
500 0.61
501 0.6
502 0.59
503 0.65
504 0.66
505 0.61
506 0.65
507 0.63
508 0.61
509 0.63
510 0.62
511 0.57
512 0.57
513 0.53
514 0.45
515 0.37
516 0.29
517 0.2
518 0.17
519 0.13
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.13
526 0.15
527 0.16
528 0.2
529 0.25
530 0.27
531 0.28
532 0.28
533 0.33
534 0.33
535 0.33
536 0.29
537 0.26