Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3MDL4

Protein Details
Accession A0A6J3MDL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-358EEEERHRREKLERKKRLQALNKNAAAKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-208GIKHKPKPVERVSRREREKMHKEAMQEAQKAKKAGKP
335-360RHRREKLERKKRLQALNKNAAAKRRI
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSAFTSLLSSISGQPQAPQTRPSSVARPAQGAPKPTDRFRLSSSNPVVADNAVAGVKRKSEDPEPSPRFKSQKLDRTTQQTSQNVASQRPVSAGTATIYRGTARSAGPGGQPSPAVKPASRPQQTVTSSSSTSLPRAANAPSAPPSKPRGFAALLEKAKASQEATKIAATSGIKHKPKPVERVSRREREKMHKEAMQEAQKAKKAGKPTTTDRHRPAGVGDGQPNPQKKAQETSYKGTMKKSAEPLAYKGTMRAGESAQPRAKPVVKKGMGQDRYGGYASWSDLSDAEEEGEEEDYDSAASSDMEGGFDDVDREETAALRAARREDQAALEEEERHRREKLERKKRLQALNKNAAAKRRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.29
3 0.34
4 0.35
5 0.37
6 0.36
7 0.39
8 0.43
9 0.44
10 0.42
11 0.44
12 0.48
13 0.46
14 0.46
15 0.44
16 0.48
17 0.48
18 0.47
19 0.44
20 0.47
21 0.5
22 0.49
23 0.56
24 0.51
25 0.51
26 0.51
27 0.56
28 0.5
29 0.55
30 0.55
31 0.52
32 0.49
33 0.45
34 0.41
35 0.31
36 0.27
37 0.17
38 0.14
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.15
46 0.19
47 0.25
48 0.33
49 0.37
50 0.47
51 0.52
52 0.57
53 0.59
54 0.62
55 0.6
56 0.57
57 0.61
58 0.59
59 0.62
60 0.62
61 0.65
62 0.64
63 0.67
64 0.68
65 0.64
66 0.62
67 0.56
68 0.53
69 0.49
70 0.48
71 0.41
72 0.38
73 0.35
74 0.28
75 0.25
76 0.23
77 0.21
78 0.17
79 0.15
80 0.15
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.22
105 0.28
106 0.38
107 0.4
108 0.38
109 0.37
110 0.44
111 0.45
112 0.43
113 0.39
114 0.32
115 0.29
116 0.29
117 0.29
118 0.21
119 0.2
120 0.21
121 0.17
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.26
133 0.26
134 0.27
135 0.26
136 0.26
137 0.25
138 0.27
139 0.29
140 0.32
141 0.3
142 0.29
143 0.27
144 0.24
145 0.23
146 0.2
147 0.16
148 0.11
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.16
156 0.13
157 0.14
158 0.19
159 0.25
160 0.27
161 0.28
162 0.33
163 0.38
164 0.43
165 0.48
166 0.51
167 0.54
168 0.59
169 0.68
170 0.7
171 0.71
172 0.7
173 0.68
174 0.65
175 0.64
176 0.66
177 0.62
178 0.59
179 0.53
180 0.5
181 0.49
182 0.49
183 0.45
184 0.4
185 0.36
186 0.35
187 0.35
188 0.35
189 0.32
190 0.28
191 0.29
192 0.31
193 0.35
194 0.36
195 0.41
196 0.5
197 0.55
198 0.6
199 0.57
200 0.57
201 0.52
202 0.46
203 0.4
204 0.36
205 0.33
206 0.28
207 0.27
208 0.24
209 0.27
210 0.31
211 0.32
212 0.28
213 0.27
214 0.27
215 0.25
216 0.3
217 0.33
218 0.38
219 0.41
220 0.43
221 0.49
222 0.51
223 0.51
224 0.47
225 0.48
226 0.41
227 0.41
228 0.41
229 0.38
230 0.38
231 0.38
232 0.39
233 0.38
234 0.37
235 0.31
236 0.27
237 0.24
238 0.22
239 0.2
240 0.2
241 0.15
242 0.19
243 0.22
244 0.29
245 0.29
246 0.28
247 0.29
248 0.32
249 0.37
250 0.36
251 0.4
252 0.43
253 0.42
254 0.46
255 0.52
256 0.57
257 0.54
258 0.5
259 0.48
260 0.38
261 0.38
262 0.35
263 0.27
264 0.18
265 0.16
266 0.17
267 0.14
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.22
309 0.25
310 0.27
311 0.29
312 0.26
313 0.27
314 0.28
315 0.28
316 0.28
317 0.26
318 0.28
319 0.29
320 0.37
321 0.37
322 0.37
323 0.35
324 0.36
325 0.44
326 0.51
327 0.58
328 0.6
329 0.69
330 0.75
331 0.84
332 0.88
333 0.89
334 0.89
335 0.88
336 0.88
337 0.87
338 0.84
339 0.82
340 0.77