Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M9C5

Protein Details
Accession A0A6J3M9C5    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-37PLSRAEKKAQRDAERFKKSGNKKRKLADAAGHydrophilic
110-134TSTANKTKTSSKRRKKNDGTSTTADHydrophilic
251-287RKEKIKVKNTRLEEQRKRRAEAEKKDKERKEKKEGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-31EKKAQRDAERFKKSGNKKRK
84-91RAERRRRK
121-124KRRK
242-297GGGGAKAEGRKEKIKVKNTRLEEQRKRRAEAEKKDKERKEKKEGGGGGKGRDGEKG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSAEEVPLSRAEKKAQRDAERFKKSGNKKRKLADAAGDDEGNPPQQDDGDATNAAADANGELVASSKKVKQSDDAAAKNPGESRAERRRRKNLEAGTTLARVASADDKATSTANKTKTSSKRRKKNDGTSTTADGTAVADDAKPSKSRFILFIGNLPFKATDAGLQAHFAKLQPFTLRHRTDPTTKRSKGFAFLEFENYDRMKTCLKLYHHSMFDADDVANGGSGKGNGKHARKINVELTAGGGGAKAEGRKEKIKVKNTRLEEQRKRRAEAEKKDKERKEKKEGGGGGKGRDGEKGGAEDKPAATAAAQEPEQQQADLNGMHPSRMARLNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.63
4 0.69
5 0.76
6 0.79
7 0.81
8 0.75
9 0.71
10 0.72
11 0.73
12 0.75
13 0.75
14 0.75
15 0.74
16 0.8
17 0.83
18 0.8
19 0.75
20 0.73
21 0.67
22 0.62
23 0.56
24 0.49
25 0.4
26 0.34
27 0.29
28 0.23
29 0.17
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.1
53 0.13
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.26
58 0.31
59 0.39
60 0.46
61 0.45
62 0.43
63 0.45
64 0.43
65 0.4
66 0.36
67 0.29
68 0.24
69 0.23
70 0.29
71 0.36
72 0.46
73 0.54
74 0.62
75 0.7
76 0.75
77 0.79
78 0.8
79 0.77
80 0.75
81 0.69
82 0.62
83 0.55
84 0.47
85 0.4
86 0.3
87 0.22
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.18
100 0.21
101 0.24
102 0.26
103 0.34
104 0.43
105 0.54
106 0.61
107 0.66
108 0.72
109 0.78
110 0.87
111 0.88
112 0.89
113 0.88
114 0.84
115 0.81
116 0.74
117 0.68
118 0.58
119 0.48
120 0.37
121 0.26
122 0.19
123 0.12
124 0.08
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.2
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.23
143 0.21
144 0.18
145 0.14
146 0.14
147 0.09
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.13
162 0.18
163 0.27
164 0.29
165 0.29
166 0.34
167 0.36
168 0.43
169 0.47
170 0.49
171 0.51
172 0.51
173 0.51
174 0.5
175 0.48
176 0.45
177 0.42
178 0.37
179 0.31
180 0.29
181 0.31
182 0.28
183 0.27
184 0.24
185 0.21
186 0.17
187 0.14
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.2
193 0.23
194 0.28
195 0.34
196 0.38
197 0.37
198 0.36
199 0.34
200 0.28
201 0.25
202 0.21
203 0.15
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.08
213 0.09
214 0.16
215 0.22
216 0.26
217 0.32
218 0.37
219 0.43
220 0.45
221 0.48
222 0.46
223 0.43
224 0.41
225 0.34
226 0.3
227 0.23
228 0.2
229 0.15
230 0.11
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.09
236 0.13
237 0.17
238 0.22
239 0.27
240 0.36
241 0.44
242 0.54
243 0.61
244 0.67
245 0.71
246 0.72
247 0.77
248 0.77
249 0.79
250 0.8
251 0.8
252 0.82
253 0.78
254 0.76
255 0.73
256 0.74
257 0.73
258 0.74
259 0.74
260 0.74
261 0.78
262 0.85
263 0.86
264 0.87
265 0.87
266 0.85
267 0.85
268 0.83
269 0.79
270 0.78
271 0.77
272 0.73
273 0.72
274 0.66
275 0.57
276 0.5
277 0.48
278 0.39
279 0.34
280 0.3
281 0.22
282 0.21
283 0.22
284 0.21
285 0.21
286 0.22
287 0.22
288 0.2
289 0.2
290 0.18
291 0.14
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.2
298 0.21
299 0.25
300 0.26
301 0.22
302 0.21
303 0.17
304 0.2
305 0.17
306 0.17
307 0.19
308 0.18
309 0.18
310 0.19
311 0.19
312 0.21