Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3MD49

Protein Details
Accession A0A6J3MD49    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30IPTSALRRARPPKKKVALTPAGHydrophilic
123-151AEKLEKNRSKREKMKQRQQKKKLGTKGLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-23RARPPKKK
125-146KLEKNRSKREKMKQRQQKKKLG
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSALRRARPPKKKVALTPAGQQSAQVEALFANPDRVGNGIYLGPKPKTLAAIPEIIASVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLKIMDEENQAEEADQEFQARKSEREQAEAEKLEKNRSKREKMKQRQQKKKLGTKGLPSVVDAEKQQSQASATGGHLKRKLEVASIASPSGNETDTPEPDALQRPSAEPTTEEQGITIHDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.5
4 0.59
5 0.67
6 0.71
7 0.75
8 0.8
9 0.84
10 0.82
11 0.82
12 0.79
13 0.72
14 0.73
15 0.69
16 0.62
17 0.54
18 0.46
19 0.36
20 0.31
21 0.28
22 0.19
23 0.12
24 0.09
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.14
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.18
48 0.2
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.14
53 0.14
54 0.1
55 0.07
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.03
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.03
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.13
72 0.2
73 0.27
74 0.32
75 0.37
76 0.43
77 0.51
78 0.58
79 0.62
80 0.63
81 0.58
82 0.53
83 0.51
84 0.46
85 0.41
86 0.35
87 0.28
88 0.2
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.23
104 0.23
105 0.26
106 0.27
107 0.27
108 0.31
109 0.32
110 0.3
111 0.27
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.34
116 0.39
117 0.46
118 0.53
119 0.58
120 0.69
121 0.72
122 0.79
123 0.86
124 0.87
125 0.89
126 0.91
127 0.91
128 0.9
129 0.88
130 0.87
131 0.85
132 0.84
133 0.79
134 0.74
135 0.72
136 0.66
137 0.57
138 0.48
139 0.43
140 0.34
141 0.31
142 0.24
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.21
154 0.23
155 0.28
156 0.3
157 0.29
158 0.3
159 0.32
160 0.32
161 0.25
162 0.26
163 0.25
164 0.26
165 0.27
166 0.26
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.14
172 0.1
173 0.13
174 0.17
175 0.18
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.22
180 0.28
181 0.26
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.28
186 0.29
187 0.27
188 0.23
189 0.25
190 0.28
191 0.28
192 0.26
193 0.22
194 0.2
195 0.21