Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3MDJ6

Protein Details
Accession A0A6J3MDJ6    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-69ASSLPPASTEKKKRPYVRKTDAGSSKKRHydrophilic
271-294LTPPLHYVRKRRWRSRPNYNHAVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-69KKKRPYVRKTDAGSSKKR
111-114RKAS
116-117PK
121-130IRARQRAPPR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MPKASLAGTPNRPTLPAGATSSSGIKLKLTNSQPPTPTEGPASSLPPASTEKKKRPYVRKTDAGSSKKRAAEEDIISPAAKRVQSGTGRKLSIKLPGQQSSGGTIALAAKRKASVPKIIDIRARQRAPPRAKGIGYDSEDSDVEKDPAIQQALVLRMQPGEDANYLRKAIADGSIGPFTSQGDADVSIKFVEKNYRRAVVKVRGNTYAAALVDLPCIVETMKSFDRKGWYKVADCCQMLYVLGPCKSEEEAKNYRLPSDVDKENFQFAHGLTPPLHYVRKRRWRSRPNYNHAVEAEEQALRLLEMDRLVEESGGTSSYAVKKTANLDQAQEESQYEDEYDEEEDAEEDAVETVEATGQYPFDDEEEDGVDLEAELAAQMEFAEDDDDEPSGDMVESPMAMGGDEGASVPPETVEPTPAGTPAAMETPPAEQPSSDEDESDEDEDDLDVFDEDAAAKSAERAQQLEEVADLEQEIARTRQKAQAMTNQLLKTRELRKLAGLEEDLKAKKVIFGLEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.32
3 0.29
4 0.28
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.24
11 0.2
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.28
16 0.31
17 0.38
18 0.43
19 0.5
20 0.51
21 0.51
22 0.57
23 0.51
24 0.47
25 0.42
26 0.36
27 0.33
28 0.33
29 0.32
30 0.26
31 0.25
32 0.23
33 0.22
34 0.26
35 0.29
36 0.37
37 0.44
38 0.52
39 0.6
40 0.7
41 0.77
42 0.82
43 0.87
44 0.88
45 0.88
46 0.87
47 0.82
48 0.83
49 0.82
50 0.8
51 0.77
52 0.73
53 0.71
54 0.65
55 0.61
56 0.54
57 0.5
58 0.49
59 0.44
60 0.41
61 0.37
62 0.34
63 0.33
64 0.3
65 0.26
66 0.23
67 0.2
68 0.16
69 0.16
70 0.23
71 0.31
72 0.38
73 0.44
74 0.47
75 0.49
76 0.49
77 0.5
78 0.44
79 0.44
80 0.42
81 0.42
82 0.42
83 0.44
84 0.44
85 0.43
86 0.42
87 0.36
88 0.31
89 0.24
90 0.16
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.22
99 0.28
100 0.28
101 0.33
102 0.33
103 0.4
104 0.44
105 0.47
106 0.49
107 0.49
108 0.53
109 0.54
110 0.53
111 0.51
112 0.54
113 0.6
114 0.62
115 0.65
116 0.63
117 0.59
118 0.58
119 0.55
120 0.51
121 0.49
122 0.45
123 0.38
124 0.32
125 0.28
126 0.28
127 0.25
128 0.22
129 0.15
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.13
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.18
179 0.2
180 0.27
181 0.3
182 0.36
183 0.36
184 0.39
185 0.46
186 0.45
187 0.48
188 0.46
189 0.46
190 0.42
191 0.42
192 0.4
193 0.32
194 0.25
195 0.19
196 0.14
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.04
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.04
207 0.1
208 0.13
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.25
213 0.28
214 0.31
215 0.32
216 0.32
217 0.33
218 0.38
219 0.41
220 0.4
221 0.36
222 0.33
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.16
227 0.13
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.18
235 0.17
236 0.21
237 0.25
238 0.27
239 0.31
240 0.3
241 0.29
242 0.26
243 0.26
244 0.22
245 0.23
246 0.24
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.24
251 0.23
252 0.19
253 0.15
254 0.12
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.18
263 0.17
264 0.23
265 0.32
266 0.43
267 0.51
268 0.59
269 0.68
270 0.75
271 0.82
272 0.86
273 0.87
274 0.85
275 0.85
276 0.77
277 0.69
278 0.59
279 0.53
280 0.42
281 0.32
282 0.25
283 0.15
284 0.14
285 0.11
286 0.1
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.14
309 0.17
310 0.23
311 0.26
312 0.23
313 0.24
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.22
318 0.17
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.08
399 0.08
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.12
414 0.14
415 0.15
416 0.14
417 0.12
418 0.14
419 0.2
420 0.26
421 0.23
422 0.21
423 0.2
424 0.23
425 0.25
426 0.24
427 0.19
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.09
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.13
445 0.17
446 0.19
447 0.19
448 0.2
449 0.24
450 0.25
451 0.24
452 0.2
453 0.17
454 0.15
455 0.14
456 0.11
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.12
462 0.16
463 0.19
464 0.22
465 0.27
466 0.32
467 0.37
468 0.41
469 0.47
470 0.51
471 0.54
472 0.58
473 0.54
474 0.53
475 0.5
476 0.46
477 0.44
478 0.44
479 0.47
480 0.44
481 0.43
482 0.45
483 0.48
484 0.47
485 0.45
486 0.41
487 0.36
488 0.34
489 0.39
490 0.34
491 0.32
492 0.31
493 0.25
494 0.25
495 0.24
496 0.25