FuNGI

A0A6J3MFQ1

Protein Details

Accession

A0A6J3MFQ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-53	AVNIFQKKKAPVRKPGAPVRPL	Hydrophilic
169-188	TEAVKPVKKKQKKFVSYDND	Hydrophilic
398-424	AEQEERKRTKRIRKQLGRREKKNEYLS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-32	RKPA
35-48	IFQKKKAPVRKPGA
403-419	RKRTKRIRKQLGRREKK
509-524	RKKAKGLNGRPAQGKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPAAKAGTPGVPNGSVPPSTAAPVRRKPAVNIFQKKKAPVRKPGAPVRPLQPIQRPTPSLAPETAAATPEGPFADYPIFVRKKELDLRYHVMKFQGQNTVNPYDESQFSRPLRLFRRAVGDKVDVPPPVNAQDAANEAERELMDSRRAERQAEREENQKLIAPNPTEAVKPVKKKQKKFVSYDNDNFPERQRRQQLRYEEARPWHLEDYDRKNIWVGNYEGPLSNQYALFIVDEGGFRMIPAEKYYKFSQTGKFTPMDADEAAKHMNQKFNMPRWAKGSKLEAEAMRAQDLQMKRAMREAKLKSEREDDGIIGGMNDNDHAEYQADKDGLDLEYDDMNDFQDDDEGKLFQDGEDEDAKEIESRIREEMRQAGLGGTGVKNEELDPEEEYRRQQIAEQEERKRTKRIRKQLGRREKKNEYLSDSEDPYDDDSDDEISEEEGEEEKKKREEEEAAVKTASANGEKSGSQSRGNNTPTGRSEKKDPTRLSTKRPGSPDLSDMSGNESSRKKAKGLNGRPAQGKKAFRVGFADAGSGDDSDASRASGSRPKIKLKGASPVGTPDRSRASSPSAGGSASVAAPAGSSSSNNTQKVLPTLEELRAAIPREGIEIKKLLARFKSQIPPGATPEFILLVKTAGQLDKVTKLIIPKAVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.25
4	0.24
5	0.2
6	0.2
7	0.22
8	0.19
9	0.21
10	0.25
11	0.29
12	0.35
13	0.42
14	0.46
15	0.5
16	0.52
17	0.55
18	0.62
19	0.64
20	0.66
21	0.69
22	0.71
23	0.73
24	0.77
25	0.78
26	0.77
27	0.78
28	0.76
29	0.76
30	0.77
31	0.77
32	0.8
33	0.83
34	0.83
35	0.77
36	0.73
37	0.68
38	0.69
39	0.63
40	0.6
41	0.59
42	0.56
43	0.58
44	0.61
45	0.58
46	0.52
47	0.57
48	0.53
49	0.47
50	0.42
51	0.37
52	0.3
53	0.3
54	0.27
55	0.2
56	0.17
57	0.15
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.22
68	0.24
69	0.24
70	0.29
71	0.29
72	0.35
73	0.44
74	0.49
75	0.45
76	0.5
77	0.55
78	0.58
79	0.57
80	0.52
81	0.46
82	0.45
83	0.42
84	0.39
85	0.43
86	0.36
87	0.38
88	0.41
89	0.42
90	0.38
91	0.35
92	0.32
93	0.26
94	0.27
95	0.29
96	0.26
97	0.3
98	0.3
99	0.35
100	0.36
101	0.41
102	0.45
103	0.48
104	0.48
105	0.43
106	0.52
107	0.49
108	0.5
109	0.47
110	0.44
111	0.39
112	0.4
113	0.4
114	0.31
115	0.29
116	0.27
117	0.24
118	0.23
119	0.21
120	0.18
121	0.15
122	0.16
123	0.17
124	0.17
125	0.17
126	0.15
127	0.13
128	0.14
129	0.13
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.15
134	0.17
135	0.2
136	0.25
137	0.27
138	0.28
139	0.31
140	0.38
141	0.44
142	0.49
143	0.49
144	0.49
145	0.5
146	0.48
147	0.44
148	0.39
149	0.31
150	0.26
151	0.3
152	0.24
153	0.22
154	0.23
155	0.23
156	0.2
157	0.21
158	0.26
159	0.27
160	0.33
161	0.41
162	0.5
163	0.58
164	0.66
165	0.74
166	0.77
167	0.79
168	0.78
169	0.8
170	0.79
171	0.8
172	0.78
173	0.75
174	0.67
175	0.6
176	0.54
177	0.49
178	0.49
179	0.43
180	0.46
181	0.49
182	0.53
183	0.58
184	0.65
185	0.67
186	0.65
187	0.69
188	0.64
189	0.59
190	0.55
191	0.54
192	0.47
193	0.43
194	0.36
195	0.31
196	0.31
197	0.33
198	0.37
199	0.41
200	0.4
201	0.37
202	0.36
203	0.36
204	0.33
205	0.3
206	0.25
207	0.19
208	0.2
209	0.21
210	0.2
211	0.19
212	0.19
213	0.16
214	0.14
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.1
232	0.14
233	0.14
234	0.19
235	0.21
236	0.24
237	0.26
238	0.29
239	0.33
240	0.35
241	0.37
242	0.36
243	0.35
244	0.31
245	0.29
246	0.27
247	0.22
248	0.16
249	0.15
250	0.11
251	0.11
252	0.12
253	0.11
254	0.14
255	0.14
256	0.18
257	0.18
258	0.25
259	0.29
260	0.33
261	0.42
262	0.4
263	0.4
264	0.42
265	0.44
266	0.38
267	0.36
268	0.35
269	0.29
270	0.3
271	0.3
272	0.24
273	0.25
274	0.26
275	0.23
276	0.19
277	0.16
278	0.14
279	0.16
280	0.16
281	0.15
282	0.17
283	0.17
284	0.16
285	0.21
286	0.24
287	0.22
288	0.3
289	0.31
290	0.37
291	0.44
292	0.46
293	0.43
294	0.44
295	0.42
296	0.36
297	0.34
298	0.24
299	0.16
300	0.15
301	0.12
302	0.08
303	0.07
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.09
353	0.12
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.19
358	0.18
359	0.18
360	0.17
361	0.14
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.1
375	0.12
376	0.14
377	0.15
378	0.16
379	0.18
380	0.17
381	0.16
382	0.16
383	0.19
384	0.25
385	0.34
386	0.4
387	0.44
388	0.51
389	0.56
390	0.57
391	0.6
392	0.6
393	0.62
394	0.65
395	0.69
396	0.73
397	0.78
398	0.86
399	0.89
400	0.92
401	0.92
402	0.9
403	0.88
404	0.83
405	0.81
406	0.78
407	0.71
408	0.65
409	0.58
410	0.55
411	0.49
412	0.44
413	0.36
414	0.28
415	0.25
416	0.21
417	0.17
418	0.13
419	0.1
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.1
432	0.13
433	0.16
434	0.19
435	0.2
436	0.21
437	0.24
438	0.28
439	0.3
440	0.38
441	0.38
442	0.37
443	0.35
444	0.34
445	0.29
446	0.27
447	0.22
448	0.13
449	0.11
450	0.1
451	0.12
452	0.12
453	0.15
454	0.19
455	0.2
456	0.22
457	0.25
458	0.28
459	0.34
460	0.37
461	0.38
462	0.34
463	0.37
464	0.37
465	0.42
466	0.42
467	0.37
468	0.43
469	0.49
470	0.57
471	0.6
472	0.59
473	0.58
474	0.65
475	0.67
476	0.68
477	0.68
478	0.66
479	0.63
480	0.65
481	0.62
482	0.56
483	0.54
484	0.48
485	0.4
486	0.35
487	0.29
488	0.25
489	0.25
490	0.23
491	0.21
492	0.23
493	0.22
494	0.24
495	0.3
496	0.32
497	0.29
498	0.32
499	0.41
500	0.47
501	0.54
502	0.61
503	0.62
504	0.65
505	0.7
506	0.68
507	0.65
508	0.62
509	0.57
510	0.5
511	0.53
512	0.49
513	0.43
514	0.44
515	0.4
516	0.36
517	0.32
518	0.29
519	0.19
520	0.19
521	0.18
522	0.14
523	0.11
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.11
532	0.17
533	0.22
534	0.3
535	0.36
536	0.43
537	0.49
538	0.55
539	0.59
540	0.56
541	0.61
542	0.58
543	0.56
544	0.49
545	0.5
546	0.49
547	0.45
548	0.42
549	0.36
550	0.37
551	0.36
552	0.37
553	0.33
554	0.34
555	0.35
556	0.35
557	0.34
558	0.29
559	0.26
560	0.24
561	0.22
562	0.16
563	0.12
564	0.11
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.06
571	0.07
572	0.11
573	0.2
574	0.27
575	0.28
576	0.3
577	0.31
578	0.33
579	0.37
580	0.36
581	0.28
582	0.26
583	0.28
584	0.29
585	0.29
586	0.26
587	0.24
588	0.25
589	0.26
590	0.22
591	0.2
592	0.18
593	0.2
594	0.24
595	0.23
596	0.23
597	0.22
598	0.23
599	0.26
600	0.28
601	0.3
602	0.31
603	0.36
604	0.36
605	0.43
606	0.51
607	0.51
608	0.56
609	0.56
610	0.55
611	0.55
612	0.54
613	0.46
614	0.38
615	0.35
616	0.29
617	0.24
618	0.2
619	0.14
620	0.12
621	0.13
622	0.14
623	0.15
624	0.13
625	0.15
626	0.17
627	0.2
628	0.23
629	0.23
630	0.22
631	0.21
632	0.25
633	0.28

A0A6J3MFQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer